seq1 = pF1KB3505.tfa, 1062 bp
seq2 = pF1KB3505/gi568815591f_80035161.tfa (gi568815591f:80035161_80317490), 282330 bp

>pF1KB3505 1062
>gi568815591f:80035161_80317490 (Chr7)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-161  (153791-153833)   100% ->
162-303  (153930-154071)   100% ->
304-461  (164065-164222)   100% ->
462-590  (168544-168672)   100% ->
591-720  (175809-175938)   100% ->
721-874  (177556-177709)   100% ->
875-1062  (182143-182330)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCTGCACGCTGAGCGCCGAGGACAAGGCGGCGGTGGAGCGGAGTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATGATCGACCGCAACCTCCGTGAGGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATGATCGACCGCAACCTCCGTGAGGACGGCGAGAAGGCGGCGCGCGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGCTGCTGCTGCTCG         GTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGCTGCTGCTGCTCGGTA...TAGGTGCTGGTGAATCTGGTAAAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAATTGTGAAGCAGATGAA         AATTATCCATGAAGCTGGTTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 153814 ACAATTGTGAAGCAGATGAAGTA...TAGAATTATCCATGAAGCTGGTTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTACAGTAACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153951 TTCAGAAGAGGAGTGTAAACAATACAAAGCAGTGGTCTACAGTAACACCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154001 TCCAGTCAATTATTGCTATCATTAGGGCTATGGGGAGGTTGAAGATAGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTTGGTGACTCAGCCCGGGCG         GATGATGCACGCCAACTCTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 154051 TTTGGTGACTCAGCCCGGGCGGTA...CAGGATGATGCACGCCAACTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGTGCTAGCTGGAGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164085 TGTGCTAGCTGGAGCTGCTGAAGAAGGCTTTATGACTGCAGAACTTGCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164135 GAGTTATAAAGAGATTGTGGAAAGATAGTGGTGTACAAGCCTGTTTCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGATCCCGAGAGTACCAGCTTAATGATTCTGCAGCATA         CTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 164185 AGATCCCGAGAGTACCAGCTTAATGATTCTGCAGCATAGTA...CAGCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCAACCAAATTACATCCCGACTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168547 TTTGAATGACTTGGACAGAATAGCTCAACCAAATTACATCCCGACTCAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGATGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168597 AAGATGTTCTCAGAACTAGAGTGAAAACTACAGGAATTGTTGAAACCCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAA         AATGTTTGATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 168647 TTTACTTTCAAAGATCTTCATTTTAAGTG...CAGAATGTTTGATGTGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 AGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175824 AGGTCAGAGATCTGAGCGGAAGAAGTGGATTCATTGCTTCGAAGGAGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CGGCGATCATCTTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175874 CGGCGATCATCTTCTGTGTAGCACTGAGTGACTACGACCTGGTTCTAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GAAGATGAAGAAATG         AACCGAATGCATGAAAGCATGAAATT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 175924 GAAGATGAAGAAATGGCA...CAGAACCGAATGCATGAAAGCATGAAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 GTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177582 GTTTGACAGCATATGTAACAACAAGTGGTTTACAGATACATCCATTATAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTTTTCTAAACAAGAAGGATCTCTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177632 TTTTTCTAAACAAGAAGGATCTCTTTGAAGAAAAAATCAAAAAGAGCCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CTCACTATATGCTATCCAGAATATGCAG         GATCAAACACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 177682 CTCACTATATGCTATCCAGAATATGCAGGTA...CAGGATCAAACACATA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182156 TGAAGAGGCAGCTGCATATATTCAATGTCAGTTTGAAGACCTCAATAAAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GAAAGGACACAAAGGAAATATACACCCACTTCACATGTGCCACAGATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182206 GAAAGGACACAAAGGAAATATACACCCACTTCACATGTGCCACAGATACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182256 AAGAATGTGCAGTTTGTTTTTGATGCTGTAACAGATGTCATCATAAAAAA

   1100     .    :    .    :    .
   1038 TAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT
        |||||||||||||||||||||||||
 182306 TAATCTAAAAGATTGTGGTCTCTTT