seq1 = pF1KB3486.tfa, 1104 bp
seq2 = pF1KB3486/gi568815579r_4261603.tfa (gi568815579r:4261603_4500368), 238766 bp

>pF1KB3486 1104
>gi568815579r:4261603_4500368 (Chr19)

(complement)

1-45  (100001-100045)   100% ->
46-114  (133375-133443)   100% ->
115-187  (133796-133868)   100% ->
188-331  (134744-134887)   100% ->
332-465  (136148-136281)   100% ->
466-624  (136491-136649)   100% ->
625-728  (136896-136999)   100% ->
729-853  (137633-137757)   100% ->
854-910  (137984-138040)   100% ->
911-1104  (138573-138766)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGTGGCGGGGCTGAAGAAGCAGTTCTACAAGGCGAGCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100001 ATGTCGGTGGCGGGGCTGAAGAAGCAGTTCTACAAGGCGAGCCAGGTG..

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     46     CTGGTCAGTGAGAAGGTCGGAGGGGCCGAGGGGACCAAGCTGGATG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 .TAGCTGGTCAGTGAGAAGGTCGGAGGGGCCGAGGGGACCAAGCTGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGACTTCAAAGAGATGGAGAAG         AAGGTGGATGTCACCAGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 133421 ATGACTTCAAAGAGATGGAGAAGGTG...CAGAAGGTGGATGTCACCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 AAGGCGGTGACAGAAGTGCTGGCCAGGACCATCGAGTACCTGCAGCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133814 AAGGCGGTGACAGAAGTGCTGGCCAGGACCATCGAGTACCTGCAGCCCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCAG         CCTCGCGGGCTAAGCTGACCATGCTCAACACGGTGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133864 CCCAGGTG...CAGCCTCGCGGGCTAAGCTGACCATGCTCAACACGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CCAAGATCCGGGGCCAGGTGAAGAACCCCGGCTACCCGCAGTCGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134780 CCAAGATCCGGGGCCAGGTGAAGAACCCCGGCTACCCGCAGTCGGAGGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTTCTGGGCGAGTGCATGATCCGCCACGGGAAGGAGCTGGGCGGCGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134830 CTTCTGGGCGAGTGCATGATCCGCCACGGGAAGGAGCTGGGCGGCGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAACTTTG         GTGACGCATTGCTGGATGCCGGCGAGTCCATGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 134880 CAACTTTGGTG...CAGGTGACGCATTGCTGGATGCCGGCGAGTCCATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AGCGCCTGGCAGAGGTGAAGGACTCCCTGGACATCGAGGTCAAGCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136181 AGCGCCTGGCAGAGGTGAAGGACTCCCTGGACATCGAGGTCAAGCAGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TTCATTGACCCCCTCCAGAACCTGTGCGAGAAAGACCTGAAGGAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136231 TTCATTGACCCCCTCCAGAACCTGTGCGAGAAAGACCTGAAGGAGATCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 G         CACCACCTGAAGAAACTGGAGGGCCGCCGCCTGGACTTTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136281 GGTG...CAGCACCACCTGAAGAAACTGGAGGGCCGCCGCCTGGACTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ACTACAAGAAGAAGCGGCAGGGCAAGATCCCCGATGAGGAGCTACGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136531 ACTACAAGAAGAAGCGGCAGGGCAAGATCCCCGATGAGGAGCTACGCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCGCTGGAGAAGTTCGAGGAGTCCAAGGAGGTGGCAGAAACCAGCATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136581 GCGCTGGAGAAGTTCGAGGAGTCCAAGGAGGTGGCAGAAACCAGCATGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CAACCTCCTGGAGACTGAC         ATCGAGCAGGTGAGTCAGCTCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 136631 CAACCTCCTGGAGACTGACGTG...CAGATCGAGCAGGTGAGTCAGCTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CGGCCCTGGTGGATGCACAGCTGGACTACCACCGGCAGGCCGTGCAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136918 CGGCCCTGGTGGATGCACAGCTGGACTACCACCGGCAGGCCGTGCAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTGGACGAGCTGGCGGAGAAGCTCAAGCGCAG         GATGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 136968 CTGGACGAGCTGGCGGAGAAGCTCAAGCGCAGGTG...CAGGATGCGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGCTTCCTCACGCCCTAAGCGGGAGTATAAGCCCAAGCCCCGGGAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137642 AGCTTCCTCACGCCCTAAGCGGGAGTATAAGCCCAAGCCCCGGGAGCCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTGACCTTGGAGAGCCTGAGCAGTCCAACGGGGGCTTCCCCTGCACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137692 TTGACCTTGGAGAGCCTGAGCAGTCCAACGGGGGCTTCCCCTGCACCACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCCCCCAAGATCGCAG         CTTCATCGTCTTTCCGATCTTCCGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 137742 GCCCCCAAGATCGCAGGTA...TAGCTTCATCGTCTTTCCGATCTTCCGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CAAGCCCATCCGGACCCCTAGCCGGAGCATGC         CGCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 138009 CAAGCCCATCCGGACCCCTAGCCGGAGCATGCGTG...CAGCGCCCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 ACCAGCCGAGCTGCAAGGCGCTGTACGACTTCGAGCCCGAGAACGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138582 ACCAGCCGAGCTGCAAGGCGCTGTACGACTTCGAGCCCGAGAACGACGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAGCTGGGCTTCCATGAGGGCGACGTCATCACGCTGACCAACCAGATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138632 GAGCTGGGCTTCCATGAGGGCGACGTCATCACGCTGACCAACCAGATCGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGAGAACTGGTACGAGGGCATGCTGGACGGCCAGTCGGGCTTCTTCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138682 TGAGAACTGGTACGAGGGCATGCTGGACGGCCAGTCGGGCTTCTTCCCGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1070 TCAGCTACGTGGAGGTGCTTGTGCCCCTGCCGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138732 TCAGCTACGTGGAGGTGCTTGTGCCCCTGCCGCAG