seq1 = pF1KB3446.tfa, 885 bp
seq2 = pF1KB3446/gi568815579f_23727199.tfa (gi568815579f:23727199_23928046), 200848 bp

>pF1KB3446 885
>gi568815579f:23727199_23928046 (Chr19)

1-885  (99964-100848)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCGGAGCCCTTGATGTCCTGCAAATGAAGGAGGAGGATGTCCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99964 ATGTCCGGAGCCCTTGATGTCCTGCAAATGAAGGAGGAGGATGTCCTTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCCTTGCAGCAGGAACCCACTTAGGTGGCACCAATCTTGACTTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 GTTCCTTGCAGCAGGAACCCACTTAGGTGGCACCAATCTTGACTTCCAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAACAGTACATCTATAAAAGGAAAAGTGATGGCATCTATATCATAAAT
        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100064 TGGAACACTACATCTATAAAAGGAAAAGTGATGGCATCTATATCATAAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAAGAGGACCTGGGAGAAGCTTCTGCTGGCAGCTCGTGCAATTGTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100114 CTCAAGAGGACCTGGGAGAAGCTTCTGCTGGCAGCTCGTGCTATTGTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTGAAAACCCTGCTGATGTCAGTGTTATATCCTCCAGGAATACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100164 CATTGAAAACCCTGCTGATGTCAGTGTTATATCCTCCAGGAATACTGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAGGGCTGTGCTGAAGTTTGCTGCTGCCACTGGAGCCACTCCAATTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100214 AGAGGGCTGTGCTGAAGTTTGCTGCTGCCACTGGAGCCACTCCAATTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCCGCTTCACTCCTGGAACCTTCACTAACCAGATCCAGGCAGCCTTCCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100264 GGCCGCTTCACTCCTGGAACCTTCACTAACCAGATCCAGGCAGCCTTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAGCCACGGCTTCTTGTGGTTACTGACCCCAGGGCTGACCACCAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100314 GGAGCCACGGCTTCTTGTGGTTACTGACCCCAGGGCTGACCACCAGCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCACGGAGGCATCTTATGTTAACCTACCTACCATTGCGCTGTGTAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100364 TCACGGAGGCATCTTATGTTAACCTACCTACCATTGCGCTGTGTAACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GATTCTCCTCTGCGCTATGTGGACATTGCCATCCCATGCAACAACAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100414 GATTCTCCTCTGCGCTATGTGGACATTGCCATCCCATGCAACAACAAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGCTCACTCAGTGGGTTTGATGTGGTGGATGCTGGCTCGGGAAGTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100464 AGCTCACTCAGTGGGTTTGATGTGGTGGATGCTGGCTCGGGAAGTTCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCATGCGTGGCACCATTTCCCGTGAACACCCATGGGAGGTCATGCCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100514 GCATGCGTGGCACCATTTCCCGTGAACACCCATGGGAGGTCATGCCTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGTACTTCTACAGAGATCCTGAAGAGATTGAAAAAGAAGAGCAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100564 CTGTACTTCTACAGAGATCCTGAAGAGATTGAAAAAGAAGAGCAGGCTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGCTGAGAAGGCAGTGACCAAGGAGGAATTTCAGGGTGAATGGACTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100614 TGCTGAGAAGGCAGTGACCAAGGAGGAATTTCAGGGTGAATGGACTGCTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCGCTCCTGAGTTCACTGCTACTCAGCCTGAGGTTGCAGACTGGTCTGAA
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100664 CCTCTCCTGAGTTCACTGCTACTCAGCCTGAGGTTGCAGACTGGTCTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGTGTACAGGTGCCCTCTGTGCCTATTCAGCAATTCCCTACTGAAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100714 GGTGTACAGGTGCCCTCTGTGCCTATTCAGCAATTCCCTACTGAAGACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAGCGCTCAGCCTGCCACGGAAGACTGGTCTGCAGCTCCCACTGCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100764 GAGCGCTCAGCCTGCCACGGAAGACTGGTCTGCAGCTCCCACTGCTCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .
    851 CCACTGAATGGGTAGGAGCAACCACTGACTGGTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100814 CCACTGAATGGGTAGGAGCAACCACTGACTGGTCT