seq1 = pF1KB3432.tfa, 342 bp
seq2 = pF1KB3432/gi568815596r_176100911.tfa (gi568815596r:176100911_176301252), 200342 bp

>pF1KB3432 342
>gi568815596r:176100911_176301252 (Chr2)

(complement)

1-342  (100001-100342)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCTGTCTCCGAGCTCGCCTGCATCTACTCGGCCCTCATTCTGCA
        |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCCGTCTCCAAGCTCGCCTGCATCTACTCGGCCCTCATTCTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGACGATGAGGTGACAGTCACGGAGGATAAGATCAATGCCCTCATTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGACGATGAGGTGACAGTCACGGAGGATAAGATCAATGCCCTCATTAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCCGGTGTAAATGTTGAGCCTTTTTGGCCTGGCTTGTTTGCAAAGGCC
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGCCGGTGTAAATGTTGAACCTTTTTGGCCTGGCTTGTTTGCAAAGGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCCAACGTCAACATTGGGAGCCTCATCTGCAATGTAGGGGCCGGTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100151 CTGGCCAACGTCAACATTGGGAGCCTCATCTGCAATGTAGGGGCTGGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACCTGCTCCAGCAGCTGGTGCTGCACCAGCAGGAGGTCCTGCCCCCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100201 ACCTGCTCCAGCAGCTGGTGCTGCACCAGCAGGACGTCCTGCCCCCTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGCTGCTGCTCCAGCTGAGGAGAAGAAAGTGGAAGCAAAGAAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGCTGCTGCTCCAGCTGAGGAGAAGAAAGTGGAAGCAAAGAAAGAAGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCGAGGAGTCTGATGATGACATGGGCTTTGGTCTTTTTGAC
        ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100301 TCCAAGGAGTCTGATGATGACATGGGCCTTGGTCTTTTTGAC