seq1 = pF1KB3411.tfa, 2697 bp
seq2 = pF1KB3411/gi568815588f_102296253.tfa (gi568815588f:102296253_102502373), 206121 bp

>pF1KB3411 2697
>gi568815588f:102296253_102502373 (Chr10)

1-21  (99708-99728)   100% ->
22-103  (100001-100082)   100% ->
104-144  (100197-100237)   100% ->
145-243  (100473-100571)   100% ->
244-395  (100652-100803)   100% ->
396-502  (101050-101156)   100% ->
503-661  (101275-101433)   100% ->
662-766  (101729-101833)   100% ->
767-852  (101960-102045)   100% ->
853-991  (102133-102271)   100% ->
992-1117  (102487-102612)   100% ->
1118-1327  (103036-103245)   99% ->
1328-1469  (103325-103466)   100% ->
1470-1584  (103828-103942)   100% ->
1585-1798  (104026-104239)   100% ->
1799-1968  (104403-104572)   99% ->
1969-2071  (104695-104797)   100% ->
2072-2223  (104928-105079)   100% ->
2224-2293  (105197-105266)   100% ->
2294-2466  (105493-105665)   100% ->
2467-2578  (105796-105907)   100% ->
2579-2697  (106003-106121)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGTTGCTACAACCCA         GGTCTGGATGGTATTATTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
  99708 ATGGAGAGTTGCTACAACCCAGTG...CAGGGTCTGGATGGTATTATTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ATATGATGATTTCAAATTGAACTCCTCCATTGTGGAACCCAAGGAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100021 ATATGATGATTTCAAATTGAACTCCTCCATTGTGGAACCCAAGGAGCCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCCAGAAACAG         CTGATGGCCCCTACCTGGTGATCGTGGAA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100071 CCCCAGAAACAGGTC...CAGCTGATGGCCCCTACCTGGTGATCGTGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CAGCCTAAGCAG         AGAGGCTTCCGATTTCGATATGGCTGTGA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100226 CAGCCTAAGCAGGTG...CAGAGAGGCTTCCGATTTCGATATGGCTGTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 AGGCCCCTCCCATGGAGGACTGCCCGGTGCCTCCAGTGAGAAGGGCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100502 AGGCCCCTCCCATGGAGGACTGCCCGGTGCCTCCAGTGAGAAGGGCCGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AGACCTATCCCACTGTCAAG         ATCTGTAACTACGAGGGACCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100552 AGACCTATCCCACTGTCAAGGTG...TAGATCTGTAACTACGAGGGACCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    265 GCCAAGATCGAGGTGGACCTGGTAACACACAGTGACCCACCTCGTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100673 GCCAAGATCGAGGTGGACCTGGTAACACACAGTGACCCACCTCGTGCTCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGCCCACAGTCTGGTGGGCAAGCAATGCTCGGAGCTGGGGATCTGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100723 TGCCCACAGTCTGGTGGGCAAGCAATGCTCGGAGCTGGGGATCTGCGCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTTCTGTGGGGCCCAAGGACATGACTGCCCA         ATTTAACAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100773 TTTCTGTGGGGCCCAAGGACATGACTGCCCAGTA...CAGATTTAACAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 CTGGGTGTCCTGCATGTGACTAAGAAGAACATGATGGGGACTATGATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101060 CTGGGTGTCCTGCATGTGACTAAGAAGAACATGATGGGGACTATGATACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AAAACTTCAGAGGCAGCGGCTCCGCTCTAGGCCCCAGGGCCTTACGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101110 AAAACTTCAGAGGCAGCGGCTCCGCTCTAGGCCCCAGGGCCTTACGGGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    503       AGGCCGAGCAGCGGGAGCTGGAGCAAGAGGCCAAAGAACTGAAG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101160 ...CAGAGGCCGAGCAGCGGGAGCTGGAGCAAGAGGCCAAAGAACTGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAGGTGATGGATCTGAGTATAGTGCGGCTGCGCTTCTCTGCCTTCCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101319 AAGGTGATGGATCTGAGTATAGTGCGGCTGCGCTTCTCTGCCTTCCTTAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 AGCCAGTGATGGCTCCTTCTCCCTGCCCCTGAAGCCAGTCATCTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101369 AGCCAGTGATGGCTCCTTCTCCCTGCCCCTGAAGCCAGTCATCTCCCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCATCCATGACAGCA         AATCTCCGGGGGCATCAAACCTGAAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101419 CCATCCATGACAGCAGTG...TAGAATCTCCGGGGGCATCAAACCTGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ATTTCTCGAATGGACAAGACAGCAGGCTCTGTGCGGGGTGGAGATGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101755 ATTTCTCGAATGGACAAGACAGCAGGCTCTGTGCGGGGTGGAGATGAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TTATCTGCTTTGTGACAAGGTGCAGAAAG         ATGACATTGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101805 TTATCTGCTTTGTGACAAGGTGCAGAAAGGTG...TAGATGACATTGAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TTCGGTTCTATGAGGATGATGAGAATGGATGGCAGGCCTTTGGGGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101972 TTCGGTTCTATGAGGATGATGAGAATGGATGGCAGGCCTTTGGGGACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TCTCCCACAGATGTGCATAAACAG         TATGCCATTGTGTTCCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102022 TCTCCCACAGATGTGCATAAACAGGTA...CAGTATGCCATTGTGTTCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 GACACCCCCCTATCACAAGATGAAGATTGAGCGGCCTGTAACAGTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102150 GACACCCCCCTATCACAAGATGAAGATTGAGCGGCCTGTAACAGTGTTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGCAACTGAAACGCAAGCGAGGAGGGGACGTGTCTGATTCCAAACAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102200 TGCAACTGAAACGCAAGCGAGGAGGGGACGTGTCTGATTCCAAACAGTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 ACCTATTACCCTCTGGTGGAAG         ACAAGGAAGAGGTGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 102250 ACCTATTACCCTCTGGTGGAAGGTG...CAGACAAGGAAGAGGTGCAGCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 GAAGCGGAGGAAGGCCTTGCCCACCTTCTCCCAGCCCTTCGGGGGTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102506 GAAGCGGAGGAAGGCCTTGCCCACCTTCTCCCAGCCCTTCGGGGGTGGCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 CCCACATGGGTGGAGGCTCTGGGGGTGCAGCCGGGGGCTACGGAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102556 CCCACATGGGTGGAGGCTCTGGGGGTGCAGCCGGGGGCTACGGAGGAGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GGAGGAG         GTGGCAGCCTCGGTTTCTTCCCCTCCTCCCTGGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102606 GGAGGAGGTG...CAGGTGGCAGCCTCGGTTTCTTCCCCTCCTCCCTGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 CTACAGCCCCTACCAGTCCGGCGCGGGCCCCATGGGCTGCTACCCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103070 CTACAGCCCCTACCAGTCCGGCGCGGGCCCCATGGGCTGCTACCCGGGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GCGGGGGCGGGGCGCAGATGGCCGCCACGGTGCCCAGCAGGGACTCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103120 GCGGGGGCGGGGCGCAGATGGCCGCCACGGTGCCCAGCAGGGACTCCGGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GAGGAAGCCGCGGAGCCGAGCGCCCCCTCCAGGACCCCCCAGTGCGAGCC
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 103170 GAGGAAGCCGCGGAGCCAAGCGCCCCCTCCAGGACCCCCCAGTGCGAGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GCAGGCCCCGGAGATGCTGCAGCGAG         CTCGAGAGTACAACG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 103220 GCAGGCCCCGGAGATGCTGCAGCGAGGTA...TAGCTCGAGAGTACAACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CGCGCCTGTTCGGCCTGGCGCAGCGCAGCGCCCGAGCCCTACTCGACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103340 CGCGCCTGTTCGGCCTGGCGCAGCGCAGCGCCCGAGCCCTACTCGACTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 GGCGTCACCGCGGACGCGCGCGCGCTGCTGGCGGGACAGCGCCACCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103390 GGCGTCACCGCGGACGCGCGCGCGCTGCTGGCGGGACAGCGCCACCTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GACGGCGCAGGACGAGAACGGAGACAC         ACCACTGCACCTAG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103440 GACGGCGCAGGACGAGAACGGAGACACGTA...CAGACCACTGCACCTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 CCATCATCCACGGGCAGACCAGTGTCATTGAGCAGATAGTCTATGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103842 CCATCATCCACGGGCAGACCAGTGTCATTGAGCAGATAGTCTATGTCATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 CACCACGCCCAGGACCTCGGCGTTGTCAACCTCACCAACCACCTGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103892 CACCACGCCCAGGACCTCGGCGTTGTCAACCTCACCAACCACCTGCACCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 G         ACGCCCCTGCACCTGGCGGTGATCACGGGGCAGACGAGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103942 GGTG...CAGACGCCCCTGCACCTGGCGGTGATCACGGGGCAGACGAGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TGGTGAGCTTTCTGCTGCGGGTAGGTGCAGACCCAGCTCTGCTGGATCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104066 TGGTGAGCTTTCTGCTGCGGGTAGGTGCAGACCCAGCTCTGCTGGATCGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CATGGAGACTCAGCCATGCATCTGGCGCTGCGGGCAGGCGCTGGTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104116 CATGGAGACTCAGCCATGCATCTGGCGCTGCGGGCAGGCGCTGGTGCTCC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 TGAGCTGCTGCGTGCACTGCTTCAGAGTGGAGCTCCTGCTGTGCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104166 TGAGCTGCTGCGTGCACTGCTTCAGAGTGGAGCTCCTGCTGTGCCCCAGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TGTTGCATATGCCTGACTTTGAGG         GACTGTATCCAGTACAC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104216 TGTTGCATATGCCTGACTTTGAGGGTG...TAGGACTGTATCCAGTACAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CTGGCGGTCCGAGCCCGAAGCCCTGAGTGCCTGGATCTGCTGGTGGACAG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104420 CTGGCAGTCCGAGCCCGAAGCCCTGAGTGCCTGGATCTGCTGGTGGACAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TGGGGCTGAAGTGGAGGCCACAGAGCGGCAGGGGGGACGAACAGCCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104470 TGGGGCTGAAGTGGAGGCCACAGAGCGGCAGGGGGGACGAACAGCCTTGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATCTAGCCACAGAGATGGAGGAGCTGGGGTTGGTCACCCATCTGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104520 ATCTAGCCACAGAGATGGAGGAGCTGGGGTTGGTCACCCATCTGGTCACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 AAG         CTCCGGGCCAACGTGAACGCTCGCACCTTTGCGGGAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104570 AAGGTG...CAGCTCCGGGCCAACGTGAACGCTCGCACCTTTGCGGGAAA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CACACCCCTGCACCTGGCAGCTGGACTGGGGTACCCGACCCTCACCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104733 CACACCCCTGCACCTGGCAGCTGGACTGGGGTACCCGACCCTCACCCGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 TCCTTCTGAAGGCTG         GTGCTGACATCCATGCTGAAAACGAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104783 TCCTTCTGAAGGCTGGTC...CAGGTGCTGACATCCATGCTGAAAACGAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GAGCCCCTGTGCCCACTGCCTTCACCCCCTACCTCTGATAGCGACTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104954 GAGCCCCTGTGCCCACTGCCTTCACCCCCTACCTCTGATAGCGACTCGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 CTCTGAAGGGCCTGAGAAGGACACCCGAAGCAGCTTCCGGGGCCACACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105004 CTCTGAAGGGCCTGAGAAGGACACCCGAAGCAGCTTCCGGGGCCACACGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 CTCTTGACCTCACTTGCAGCACCAAG         GTGAAGACCTTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105054 CTCTTGACCTCACTTGCAGCACCAAGGTG...CAGGTGAAGACCTTGCTG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2239 CTAAATGCTGCTCAGAACACCATGGAGCCACCCCTGACCCCGCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105212 CTAAATGCTGCTCAGAACACCATGGAGCCACCCCTGACCCCGCCCAGCCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2289 AGCAG         GGCCGGGACTGTCACTTGGTGATACAGCTCTGCAGA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105262 AGCAGGTG...AAGGGCCGGGACTGTCACTTGGTGATACAGCTCTGCAGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2330 ACCTGGAGCAGCTGCTAGACGGGCCAGAAGCCCAGGGCAGCTGGGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105529 ACCTGGAGCAGCTGCTAGACGGGCCAGAAGCCCAGGGCAGCTGGGCAGAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2380 CTGGCAGAGCGTCTGGGGCTGCGCAGCCTGGTAGACACGTACCGACAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105579 CTGGCAGAGCGTCTGGGGCTGCGCAGCCTGGTAGACACGTACCGACAGAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2430 AACCTCACCCAGTGGCAGCCTCCTGCGCAGCTACGAG         CTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 105629 AACCTCACCCAGTGGCAGCCTCCTGCGCAGCTACGAGGTG...CAGCTGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2471 CTGGCGGGGACCTGGCAGGTCTACTGGAGGCCCTGTCTGACATGGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105800 CTGGCGGGGACCTGGCAGGTCTACTGGAGGCCCTGTCTGACATGGGCCTA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2521 GAGGAGGGAGTGAGGCTGCTGAGGGGTCCAGAAACCCGAGACAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105850 GAGGAGGGAGTGAGGCTGCTGAGGGGTCCAGAAACCCGAGACAAGCTGCC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2571 CAGCACAG         AGGTGAAGGAAGACAGTGCGTACGGGAGCCAGT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 105900 CAGCACAGGTA...CAGAGGTGAAGGAAGACAGTGCGTACGGGAGCCAGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2612 CAGTGGAGCAGGAGGCAGAGAAGCTGGGCCCACCCCCTGAGCCACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106036 CAGTGGAGCAGGAGGCAGAGAAGCTGGGCCCACCCCCTGAGCCACCAGGA

   2850     .    :    .    :    .    :    .
   2662 GGGCTCTGCCACGGGCACCCCCAGCCTCAGGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106086 GGGCTCTGCCACGGGCACCCCCAGCCTCAGGTGCAC