seq1 = pF1KB3398.tfa, 453 bp
seq2 = pF1KB3398/gi568815597r_52672197.tfa (gi568815597r:52672197_52872648), 200452 bp

>pF1KB3398 453
>gi568815597r:52672197_52872648 (Chr1)

(complement)

1-453  (100001-100452)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCGCATGCATGCTCCCGGGAAGGGCCTGTCCCAGTCGGCTTTACC
        |||||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTCGTATGCGTGCTCCTGAGAAGGGCCTGTCCCAGTCGGCTTTACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTATCGACGCAGCGTCCCCACTTGGTTGAAGTTGACATCTGACGACGTGA
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTATCGACGCAGCTTCCCCACTTGGTTGAAGTTGACATCTGACGACGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAGCAGATTTACAAACTGGCCAAGAAGGGCCTTACTCCTTCACAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAGCAGATTTACAAACTGGCCAAGAAGGGCCTTACTCCTTCACAGATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGTGTAATCCTGAGAGATTCACATGGTGTTGCACAAGTACGTTTTGTGAC
        ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTGTAATCGTGAGAGAATCACATGGTGTTGCACAAGTACGTTTTGTGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGCAATAAAATTTTAAGAATTCTTAAGTCTAAGGGACTTGCTCCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGCAATAAAATTTTAAGAATTCTTAAGTCTAAGGGACTTGCTCCTGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCCTGAAGATCTCTACCATTTAATTAAGAAAGCAGTTGCTGTTCGAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||-||||
 100251 TTCCTGAAGATCTCTACCATTTAATTAAGAAAGCAGTTGCTGTTC AAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CATCTTGAGAGGAACAGAAAGGATAAGGATGCTAAATTCCGTCTGATTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100300 CATCTTGAGAGGAACAGAAAGGATAAGGATGCTAAATTCCATCTGATTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATAGAGAGCCGGATTCACCGTTTGGCTCGATATTATAAGACCAAGCGAG
         |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100350 GATAGAGAGCCAGATTCACCGTTTGGCTCAATATTATAAGACCAAGCGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTCCCTCCCAATTGGAAATATGAATCATCTACAGCCTCTGCCCTGGTC
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100400 TCCTCCCTCCCAGTTGGAAATATGAATCATCTACAGCCTCTGCCCTGGTC

    450 
    451 GCA
        |||
 100450 GCA