seq1 = pF1KB3398.tfa, 453 bp
seq2 = pF1KB3398/gi568815587r_16975097.tfa (gi568815587r:16975097_17177478), 202382 bp

>pF1KB3398 453
>gi568815587r:16975097_17177478 (Chr11)

(complement)

1-23  (99838-99860)   100% ->
24-72  (100002-100050)   100% ->
73-151  (100233-100311)   100% ->
152-321  (101856-102025)   100% ->
322-422  (102282-102382)   100% ->
423-453  (103013-103043)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTCGCATGCATGCTCCCGG         GAAGGGCCTGTCCCAGTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
  99838 ATGGGTCGCATGCATGCTCCCGGGTG...CAGGAAGGGCCTGTCCCAGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGCTTTACCCTATCGACGCAGCGTCCCCACT         TGGTTGAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100020 GGCTTTACCCTATCGACGCAGCGTCCCCACTGTA...CAGTGGTTGAAGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 TGACATCTGACGACGTGAAGGAGCAGATTTACAAACTGGCCAAGAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100243 TGACATCTGACGACGTGAAGGAGCAGATTTACAAACTGGCCAAGAAGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CTTACTCCTTCACAGATCG         GTGTAATCCTGAGAGATTCACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100293 CTTACTCCTTCACAGATCGGTG...CAGGTGTAATCCTGAGAGATTCACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 TGGTGTTGCACAAGTACGTTTTGTGACAGGCAATAAAATTTTAAGAATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101878 TGGTGTTGCACAAGTACGTTTTGTGACAGGCAATAAAATTTTAAGAATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TTAAGTCTAAGGGACTTGCTCCTGATCTTCCTGAAGATCTCTACCATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101928 TTAAGTCTAAGGGACTTGCTCCTGATCTTCCTGAAGATCTCTACCATTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATTAAGAAAGCAGTTGCTGTTCGAAAGCATCTTGAGAGGAACAGAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101978 ATTAAGAAAGCAGTTGCTGTTCGAAAGCATCTTGAGAGGAACAGAAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    322        GATAAGGATGCTAAATTCCGTCTGATTCTAATAGAGAGCCGGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102028 A...TAGGATAAGGATGCTAAATTCCGTCTGATTCTAATAGAGAGCCGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TTCACCGTTTGGCTCGATATTATAAGACCAAGCGAGTCCTCCCTCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102325 TTCACCGTTTGGCTCGATATTATAAGACCAAGCGAGTCCTCCCTCCCAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    415 TGGAAATA         TGAATCATCTACAGCCTCTGCCCTGGTCGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 102375 TGGAAATAGTA...CAGTGAATCATCTACAGCCTCTGCCCTGGTCGCA