seq1 = pF1KB3391.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KB3391/gi568815591f_137621987.tfa (gi568815591f:137621987_137822850), 200864 bp

>pF1KB3391 864
>gi568815591f:137621987_137822850 (Chr7)

1-864  (100001-100864)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGTGAAAAAGTTGAGAAGCCAGATACTAAAGAGAAGAAACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100001 ATGGCGGGTGAAAAAGTTGAGAAGCCAGATACTAAAGAGAAGAAACCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCAAGAAGGTTGATGCTGGTGGCAAGGTGAAAAAGGGTAACCTCAAAG
        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 100051 AGCCAAGAAGGCTGATGCTGGTGGCAAGGTGAAAAAGGGTAACCTCAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTAAAAAGCCCAAGAAGGGGAAGCCCCATTGCAGCCGCAACCCTGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100101 CTAAAAAGCCCAAGAAGGGGAAGCCCCATTGCAGCCGCAACCCTGTCATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGAGGAATTGGCAGGTATTCCCGATCTGCCATGTATTCCAGAAAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100151 GTCAGAGGAATTGGCAGGTATTCCCGATCTGCTATGTATTCCAGAAAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGTACAAGAGGAAGTACTCAGCCGCTAAATCCAAGGTTGAAAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGTACAAGAGGAAGTACTCAGCCGCTAAATCCAAGGTTGAAAAGAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGGAGAAGGTTCTCGCAACTGTTACAAAACCAGTTGGTGGTGACAAG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGGAGAAGGTTCTTGCAACTGTTACAAAACCAGTTGGTGGTGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACGGCGGTACCCGGGTGGTTAAACTTCGCAAAATGCCTAGATATTATCC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACGGCAGTACCCGGGTGGTTAAACTTCGCAAAATGCCTAGATATTATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TACTGAAGATGTGCCTCGAAAGCTGTTGAGCCACGGCAAAAAACCCTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 100351 TACTGAAGATGTGCCTCGAAAGCTGTTGAGCCACAGCAAAAAACCCTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTCAGCACGTGAGAAAACTGCGAGCCAGCATTACCCCCGGGACCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTCAGCACGTGAGAAAACTGCGAGCCAGCATTACCCCCGGGACCATTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCATCCTCACTGGACGCCACAGGGGCAAGAGGGTGGTTTTCCTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCATCCTCACTGGACGCCACAGGGGCAAGAGGGTGGTTTTCCTGAAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGGCTAGTGGCTTATTACTTGTGACTGGACCTCTGGTCCTCAATCGAG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGGCTAGTGGCTTGTTACTTGTGACTGGACCTCTGGTCCTCAATCGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCCTCTACGAAGAACACACCAGAAATTTGTCATTGCCACTTCAACCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100551 TTCCTCTACGAAGAACACACCAGAAATTTGTCATTGCCACCTCAACCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCGATATCAGCAATGTAAAAATCCCAAAACATCTTACTGATGCTTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCGATATCAGCAATGTAAAAATCCCAAAACATCTTACTGATGCTTACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAGAAGAAGAAGCTGCGGAAGCCCAGACACCAGGAAGGTGAGATCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAGAAGAAGAAGCTGCGGAAGCCCAGACACCAGGAAGGTGAGATCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACACAGAAAAAGAGAAATATGAGATTACGGAGCAGCGCAAGATTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||
 100701 ACACAGAAAAAGAGAAATATGAGATTACGGAGCAGTGCAAGATTGAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAAGCTGTGGACTCACAAATTTTACCAAAAATCAAAGCTATTCCTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAAGCTGTGGACTCACAAATTTTACCAAAAATCAAAGCTATTCCTCAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCAGGGCTACCTGCGATCTGTGTTTGCTCTGACGAATGGAATTTATCCTC
        ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
 100801 CCAGGGCTACCTGTGATCTGTGGTTGCCCTGACGAATGGAATTTATCCTC

    850     .    :
    851 ACAAATTGGTGTTC
        ||||||||||||||
 100851 ACAAATTGGTGTTC