seq1 = pF1KB3391.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KB3391/gi568815580r_6362147.tfa (gi568815580r:6362147_6563010), 200864 bp

>pF1KB3391 864
>gi568815580r:6362147_6563010 (Chr18)

(complement)

1-864  (100001-100864)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGTGAAAAAGTTGAGAAGCCAGATACTAAAGAGAAGAAACCCGA
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGTGAAAAAGTTGAGAAGCCAGATACTAAAGAGAAGAAACCCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCCAAGAAGGTTGATGCTGGTGGCAAGGTGAAAAAGGGTAACCTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCCAAGAAGGTTGATGCTGGTGGCAAGGTGAAAAAGGGTAACCTCAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTAAAAAGCCCAAGAAGGGGAAGCCCCATTGCAGCCGCAACCCTGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTAAAAAGCCCAAGAAGGGGAAGCCCCATTGCAGCCGCAACCCTGTCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCAGAGGAATTGGCAGGTATTCCCGATCTGCCATGTATTCCAGAAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCAGAGGAATTGGCAGGTATTCCCGATCTGCCATGTATTCCAGAAAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATGTACAAGAGGAAGTACTCAGCCGCTAAATCCAAGGTTGAAAAGAAAA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATGTAGAAGAGGAAGTACTCAGCCGCTAAATCCAAGGTTGAAAAGAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGGAGAAGGTTCTCGCAACTGTTACAAAACCAGTTGGTGGTGACAAG
        |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGGAGAAGGTTCTTGCAGCTGTTACAAAACCAGTTGGTGGTGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACGGCGGTACCCGGGTGGTTAAACTTCGCAAAATGCCTAGATATTATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100301 AACGGCGGTACCCGGGTGGTTAAACTTCGCAAAATGCCTAGATAGTATCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TACTGAAGATGTGCCTCGAAAGCTGTTGAGCCACGGCAAAAAACCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TACTGAAGATGTGCCTCGAAAGCTGTTGAGCCACGGCAAAAAACCCTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTCAGCACGTGAGAAAACTGCGAGCCAGCATTACCCCCGGGACCATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTCAGCACGTGAGAAAACTGCGAGCCAGCATTACCCCCGGGACCATTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCATCCTCACTGGACGCCACAGGGGCAAGAGGGTGGTTTTCCTGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCATCCTCACTGGACGCCACAGGGGCAAGAGGGTGGTTTTCCTGAAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGGCTAGTGGCTTATTACTTGTGACTGGACCTCTGGTCCTCAATCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGGCTAGTGGCTTATTACTTGTGACTGGACCTCTGGTCCTCAATCGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCCTCTACGAAGAACACACCAGAAATTTGTCATTGCCACTTCAACCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100551 TTCCTCTACGAAGAACACACCAGAAATTTGTCATTGCCACCTCAACCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCGATATCAGCAATGTAAAAATCCCAAAACATCTTACTGATGCTTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCGATATCAGCAATGTAAAAATCCCAAAACATCTTACTGATGCTTACTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CAAGAAGAAGAAGCTGCGGAAGCCCAGACACCAGGAAGGTGAGATCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CAAGAAGAAGAAGCTGCGGAAGCCCAGACACCAGGAAGGTGAGATCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACACAGAAAAAGAGAAATATGAGATTACGGAGCAGCGCAAGATTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACACAGAAAAAGAGAAATATGAGATTACGGAGCAGCGCAAGATTGATCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAAGCTGTGGACTCACAAATTTTACCAAAAATCAAAGCTATTCCTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAAGCTGTGGACTCACAAATTTTACCAAAAATCAAAGCTATTCCTCAGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCAGGGCTACCTGCGATCTGTGTTTGCTCTGACGAATGGAATTTATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCAGGGCTACCTGCGATCTGTGTTTGCTCTGACGAATGGAATTTATCCTC

    850     .    :
    851 ACAAATTGGTGTTC
        ||||||||||||||
 100851 ACAAATTGGTGTTC