seq1 = pF1KB3388.tfa, 609 bp
seq2 = pF1KB3388/gi568815588f_96650288.tfa (gi568815588f:96650288_96850896), 200609 bp

>pF1KB3388 609
>gi568815588f:96650288_96850896 (Chr10)

1-609  (100001-100609)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGTGCAGGTCCTGGTGCTTGATGGTCGAGGCCATCTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGGTGCAGGTCCTGGTGCTTGATGGTCGAGGCCATCTCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGCCTGGCGGCCATCGTGGCTAAACAGGTACTGCTGGGCCGGAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGCCTGGCGGCCATCGTGGCTAAACAGGTACTGCTGGGCCGGAAGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTCGTACGCTGTGAAGGCATCAACATTTCTGGCAATTTCTACAGAAAC
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTTGTACGCTGTGAAGGCATCAACATTTCTGGCAATTTCTACAGAAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGTTGAAGTACCTGGCTTTCCTCCGCAAGCGGATGAACACCAACCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGTTGAAGTACCTGGCTTTCCTCCGCAAGCGGATGAACACCAACCCTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCGAGGCCCCTACCACTTCCGGGCCCCCAGCCGCATCTTCTGGCGGACCG
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCGAGTCCCCTACCACTTCCGGGCCCCCAGCCGCATCTTCTGGCGGACCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCGAGGTATGCTGCCCCACAAAACCAAGCGAGGCCAGGCCGCTCTGGAC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCGAGGTATGCTGCCCCACAAGACCAAGCGAGGCCAGGCCGCTCTGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAAAAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGTCTCAAGGTGTTTGACGGCATCCCACCGCCCTACGACAAGAAAAAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGTGGTTCCTGCTGCCCTCAAGGTCGTGCGTCTGAAGCCTACAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGTGGTTCCTGCTGCCCTCAAGGTCGTGCGTCTGAAGCCTACAAGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTTTGCCTATCTGGGGCGCCTGGCTCACGAGGTTGGCTGGAAGTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTTTGCCTATCTGGGGCGCCTGGCTCACGAGGTTGGCTGGAAGTACCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGTGACAGCCACCCTGGAGGAGAAGAGGAAAGAGAAAGCCAAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGTGACAGCCACCCTGGAGGAGAAGAGGAAAGAGAAAGCCAAGATCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTACCGGAAGAAGAAACAGCTCATGAGGCTACGGAAACAGGCCGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTACCGGAAGAAGAAACAGCTCATGAGGCTACGGAAACAGGCCGAGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGTGGAGAAGAAAATTGACAAATACACAGAGGTCCTCAAGACCCACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACGTGGAGAAGAAAATTGACAAATACACAGAGGTCCTCAAGACCCACGGA

    600     .
    601 CTCCTGGTC
        |||||||||
 100601 CTCCTGGTC