seq1 = pF1KB3372.tfa, 1335 bp
seq2 = pF1KB3372/gi568815588r_124889521.tfa (gi568815588r:124889521_125139054), 249534 bp

>pF1KB3372 1335
>gi568815588r:124889521_125139054 (Chr10)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-213  (135563-135717)   100% ->
214-358  (135951-136095)   100% ->
359-565  (140885-141091)   100% ->
566-780  (144372-144586)   100% ->
781-911  (145070-145200)   100% ->
912-1039  (145726-145853)   100% ->
1040-1157  (146243-146360)   100% ->
1158-1335  (149357-149534)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCTTGTGGATAAGCACAAAGTCAAGAGACAGCGATTGGACAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCTTGTGGATAAGCACAAAGTCAAGAGACAGCGATTGGACAGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGTGAAG         GTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCCCTGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTGTGAAGGTA...CAGGTATCCGCCCCCAGATCATGAACGGCCCCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135596 ACCCCCGCCCCCTGGTGGCGCTGCTGGACGGCCGCGACTGCACTGTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGCCCATCCTGAAGGACCTGGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135646 ATGCCCATCCTGAAGGACCTGGCCACTGTGGCCTTCTGTGACGCGCAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GACGCAGGAAATCCACGAGAAG         GTTCTAAACGAAGCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 135696 GACGCAGGAAATCCACGAGAAGGTG...CAGGTTCTAAACGAAGCCGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GCGCCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135970 GCGCCATGATGTACCACACCATCACCCTCACCAGGGAGGACCTGGAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGGATAGGCAGTGGCTATGACAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136020 TTCAAGGCCCTGAGAGTGATCGTGCGGATAGGCAGTGGCTATGACAACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCG         GAATTGCCGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 136070 GGACATCAAGGCTGCCGGCGAGCTCGGTG...CAGGAATTGCCGTGTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACATCCCGTCTGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140900 ACATCCCGTCTGCAGCCGTGGAAGAGACAGCGGACTCTACCATCTGCCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGTACCAGGCACTGCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140950 ATCCTCAACCTGTACCGGAGGAACACGTGGCTGTACCAGGCACTGCGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141000 AGGCACGCGGGTTCAGAGCGTGGAGCAGATCCGCGAGGTGGCCTCGGGAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CGGCCCGCATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 141050 CGGCCCGCATCCGTGGGGAGACGCTGGGCCTCATTGGCTTTGGTA...CA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    566  GTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTTTGGATTCAG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144371 GGTCGCACGGGGCAGGCGGTTGCAGTTCGAGCCAAGGCCTTTGGATTCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144421 CGTCATATTTTATGACCCCTACTTGCAGGATGGGATCGAGCGGTCCCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCGTGCAGAGGGTCTACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144471 GCGTGCAGAGGGTCTACACCCTGCAGGATTTGCTGTATCAGAGCGACTGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCACCTCATCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144521 GTCTCCTTGCACTGCAATCTCAACGAACATAACCACCACCTCATCAATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTTTACCATAAAGCAG         ATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 144571 CTTTACCATAAAGCAGGTA...CAGATGAGGCAGGGAGCATTCCTTGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGTGGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145095 ACGCAGCCCGTGGCGGCCTGGTGGACGAGAAAGCCTTAGCACAAGCCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AAGGAGGGCAGGATACGAGGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145145 AAGGAGGGCAGGATACGAGGGGCAGCCCTCGACGTGCATGAGTCAGAGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTTCAG         CTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145195 CTTCAGGTG...TAGCTTTGCTCAGGGTCCGTTGAAAGATGCCCCGAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTACAGTGAGCAGGCGTCACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145761 TCATCTGCACTCCTCACACTGCCTGGTACAGTGAGCAGGCGTCACTGGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 145811 ATGAGGGAGGCAGCTGCCACCGAGATCCGCCGAGCCATCACAGGTG...T

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1040   GTCGCATCCCAGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146241 AGGTCGCATCCCAGAAAGCTTAAGAAATTGTGTGAACAAGGAATTCTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAGCAATTCATCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146291 TCACATCAGCGCCTTGGTCAGTAATAGACCAGCAAGCAATTCATCCTGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTCAATGGTGCCACATACAG         ATATCCGCCAGGCATCGTGGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 146341 CTCAATGGTGCCACATACAGGTG...TAGATATCCGCCAGGCATCGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 TGTGGCTCCAGGAGGACTTCCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149378 TGTGGCTCCAGGAGGACTTCCTGCAGCCATGGAAGGGATCATCCCTGGAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTCCCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149428 GCATCCCAGTGACTCACAACCTCCCGACAGTGGCACATCCTTCCCAAGCG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 CCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149478 CCCTCTCCCAACCAGCCCACAAAACACGGGGACAATCGAGAGCACCCCAA

   1400     .
   1329 CGAGCAA
        |||||||
 149528 CGAGCAA