seq1 = pF1KB3300.tfa, 2169 bp
seq2 = pF1KB3300/gi568815589f_127354528.tfa (gi568815589f:127354528_127602896), 248369 bp
>pF1KB3300 2169
>gi568815589f:127354528_127602896 (Chr9)
1-72 (100001-100072) 100% ->
73-129 (100471-100527) 100% ->
130-174 (101049-101093) 100% ->
175-252 (102789-102866) 100% ->
253-321 (104476-104544) 100% ->
322-406 (106646-106730) 100% ->
407-528 (107725-107846) 100% ->
529-619 (113213-113303) 100% ->
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904-1043 (125312-125451) 98% ->
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1089-1159 (128423-128493) 100% ->
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1423-1503 (136688-136768) 100% ->
1504-1599 (138275-138370) 100% ->
1600-1698 (140793-140891) 100% ->
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1831-1912 (142726-142807) 100% ->
1913-2046 (146483-146616) 100% ->
2047-2169 (148247-148369) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCCGCTCTTCTTCCGGAAGCGGAAACCCAGTGAGGAGGCTCGGAAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCCGCTCTTCTTCCGGAAGCGGAAACCCAGTGAGGAGGCTCGGAAACG
50 . : . : . : . : . :
51 CCTGGAGTACCAGATGTGTTTG GCAAAAGAAGCTGGGGCAG
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
100051 CCTGGAGTACCAGATGTGTTTGGTG...TAGGCAAAAGAAGCTGGGGCAG
100 . : . : . : . : . :
92 ATGACATTCTCGACATCTCTAAATGTGAGCTCTCAGAG ATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
100490 ATGACATTCTCGACATCTCTAAATGTGAGCTCTCAGAGGTA...TAGATT
150 . : . : . : . : . :
133 CCATTTGGAGCTTTTGCAACATGCAAAGTTCTGCAGAAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
101052 CCATTTGGAGCTTTTGCAACATGCAAAGTTCTGCAGAAGAAGGTA...CA
200 . : . : . : . : . :
175 GTGCTGATCGTCCACACGAATCACCTCACTTCCCTGCTTCCCAAATCCT
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102788 GGTGCTGATCGTCCACACGAATCACCTCACTTCCCTGCTTCCCAAATCCT
250 . : . : . : . : . :
224 GCAGCCTCCTGAGTCTGGCAACCATCAAG GTTCTAGATCTC
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
102838 GCAGCCTCCTGAGTCTGGCAACCATCAAGGTA...CAGGTTCTAGATCTC
300 . : . : . : . : . :
265 CACGATAATCAGCTGACAGCCCTTCCTGACGATCTGGGGCAGCTGACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104488 CACGATAATCAGCTGACAGCCCTTCCTGACGATCTGGGGCAGCTGACTGC
350 . : . : . : . : . :
315 CCTCCAG GTCTTAAACGTGGAAAGGAATCAACTGATGCAGC
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
104538 CCTCCAGGTA...TAGGTCTTAAACGTGGAAAGGAATCAACTGATGCAGC
400 . : . : . : . : . :
356 TCCCACGTTCCATTGGGAACCTGACCCAGCTCCAGACTCTCAATGTTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106680 TCCCACGTTCCATTGGGAACCTGACCCAGCTCCAGACTCTCAATGTTAAA
450 . : . : . : . : . :
406 G ACAACAAGCTGAAGGAGCTTCCAGACACCGTGGGGGAGCT
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106730 GGTA...CAGACAACAAGCTGAAGGAGCTTCCAGACACCGTGGGGGAGCT
500 . : . : . : . : . :
447 TCGAAGCCTGCGTACCCTCAACATCAGTGGAAACGAGATCCAGAGATTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107765 TCGAAGCCTGCGTACCCTCAACATCAGTGGAAACGAGATCCAGAGATTGC
550 . : . : . : . : . :
497 CGCAGATGCTGGCTCACGTTCGAACCCTGGAG ATGCTGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
107815 CGCAGATGCTGGCTCACGTTCGAACCCTGGAGGTA...CAGATGCTGAGC
600 . : . : . : . : . :
538 CTTGACGCCTCGGCCATGGTCTACCCGCCGCGGGAGGTGTGTGGTGCCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113222 CTTGACGCCTCGGCCATGGTCTACCCGCCGCGGGAGGTGTGTGGTGCCGG
650 . : . : . : . : . :
588 CACTGCGGCCATCTTGCAGTTCCTCTGCAAAG AGTCAGGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
113272 CACTGCGGCCATCTTGCAGTTCCTCTGCAAAGGTA...CAGAGTCAGGGC
700 . : . : . : . : . :
629 TGGAATACTACCCCCCTTCTCAGTACTTGCTGCCAATTCTGGAGCAAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119283 TGGAATACTACCCCCCTTCTCAGTACTTGCTGCCAATTCTGGAGCAAGAT
750 . : . : . : . : . :
679 GGAATCGAGAACTCTCGGGACAGCCCTGATGGGCCCACGGACAGATTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119333 GGAATCGAGAACTCTCGGGACAGCCCTGATGGGCCCACGGACAGATTCTC
800 . : . : . : . : . :
729 AAGGGAGGAGTTAGAGTGGCAG AACAGGTTCTCAGACTATG
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
119383 AAGGGAGGAGTTAGAGTGGCAGGTA...CAGAACAGGTTCTCAGACTATG
850 . : . : . : . : . :
770 AGAAGAGGAAG GAACAGAAGATGCTGGAGAAACTCGAGTTT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
124426 AGAAGAGGAAGGTA...CAGGAACAGAAGATGCTGGAGAAACTCGAGTTT
900 . : . : . : . : . :
811 GAACGGCGCCTGGAACTGGGGCAGCGGGAGCACACCCAGCTCCTTCAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124886 GAACGGCGCCTGGAACTGGGGCAGCGGGAGCACACCCAGCTCCTTCAGCA
950 . : . : . : . : . :
861 GAGCAGCAGCCAGAAGGATGAGATCCTTCAGACGGTCAAGGAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
124936 GAGCAGCAGCCAGAAGGATGAGATCCTTCAGACGGTCAAGGAGGTT...C
1000 . : . : . : . : . :
904 GAGCAGTCCCGGCTGGAGCAGGGCCTGAGTGAGCACCAGCGCCACCTC
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125310 AGGAGCAGTCCCGGCTGGAGCAGGGCCTGAGTGAGCACCAGCGCCACCTC
1050 . : . : . : . : . :
952 GACGCAGAGCGGCGGCGGCTGCAGGAGCAGCTGAAGCAGACGGAACAGAA
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125360 AACGCAGAGCGGCAGCGGCTGCAGGAGCAGCTGAAGCAGACGGAACAGAA
1100 . : . : . : . : . :
1002 CATTTCCAGCCGGATCCAGAAGCTGCTGCAGGACAATCAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
125410 CATTTCCAGCCGGATCCAGAAGCTGCTGCAGGACAATCAGAGGTT...CA
1150 . : . : . : . : . :
1044 ACAAAAGAAAAGCTCCGAGATTTTGAAATCGCTGGAAAATGAAAG
>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
126655 GACAAAAGAAAAGCTCCGAGATTTTGAAATCGCTGGAAAATGAAAGGTA.
1200 . : . : . : . : . :
1089 AATAAGAATGGAACAGTTGATGTCCATAACCCAGGAGGAGACTGA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
126705 ..TAGAATAAGAATGGAACAGTTGATGTCCATAACCCAGGAGGAGACTGA
1250 . : . : . : . : . :
1134 GAGCCTGCGGCGACGTGACGTTGCCT CCGCCATGCAGCAGA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
128468 GAGCCTGCGGCGACGTGACGTTGCCTGTG...CAGCCGCCATGCAGCAGA
1300 . : . : . : . : . :
1175 TGCTGACTGAGAGCTGTAAGAACCGGCTCATCCAGATGGCCTACGAATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131224 TGCTGACTGAGAGCTGTAAGAACCGGCTCATCCAGATGGCCTACGAATCT
1350 . : . : . : . : . :
1225 CAGAGGCAGAACTTGGTCCAGCAGGCCTGTTCCAG CATGGC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
131274 CAGAGGCAGAACTTGGTCCAGCAGGCCTGTTCCAGGTA...CAGCATGGC
1400 . : . : . : . : . :
1266 CGAAATGGATGAACGATTCCAGCAGATTCTGTCGTGGCAGCAAATGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133155 CGAAATGGATGAACGATTCCAGCAGATTCTGTCGTGGCAGCAAATGGATC
1450 . : . : . : . : . :
1316 AGAACAAAGCCATCAGCCAGATCCTGCAGGAG AGCGCGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
133205 AGAACAAAGCCATCAGCCAGATCCTGCAGGAGGTG...CAGAGCGCGATG
1500 . : . : . : . : . :
1357 CAGAAGGCTGCGTTCGAGGCACTCCAGGTGAAGAAAGACCTGATGCATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
134926 CAGAAGGCTGCGTTCGAGGCACTCCAGGTGAAGAAAGACCTGATGCATCG
1550 . : . : . : . : . :
1407 GCAGATCAGGAGCCAG ATTAAGTTAATAGAAACTGAGTTAT
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
134976 GCAGATCAGGAGCCAGGTG...TAGATTAAGTTAATAGAAACTGAGTTAT
1600 . : . : . : . : . :
1448 TGCAGCTGACACAGCTGGAGTTAAAGAGGAAGTCCCTGGACACAGAGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136713 TGCAGCTGACACAGCTGGAGTTAAAGAGGAAGTCCCTGGACACAGAGTCA
1650 . : . : . : . : . :
1498 CTCCAG GAGATGATCTCGGAGCAGCGCTGGGCCCTCAGCTC
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
136763 CTCCAGGTA...CAGGAGATGATCTCGGAGCAGCGCTGGGCCCTCAGCTC
1700 . : . : . : . : . :
1539 CCTGCTCCAGCAGCTGCTCAAAGAGAAGCAGCAGCGAGAGGAAGAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138310 CCTGCTCCAGCAGCTGCTCAAAGAGAAGCAGCAGCGAGAGGAAGAGCTCC
1750 . : . : . : . : . :
1589 GGGAAATCCTG ACGGAGTTAGAAGCCAAAAGTGAAACCAGG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
138360 GGGAAATCCTGGTA...CAGACGGAGTTAGAAGCCAAAAGTGAAACCAGG
1800 . : . : . : . : . :
1630 CAGGAAAATTACTGGCTGATTCAGTATCAACGGCTTTTGAACCAGAAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140823 CAGGAAAATTACTGGCTGATTCAGTATCAACGGCTTTTGAACCAGAAGCC
1850 . : . : . : . : . :
1680 CTTGTCCTTGAAGCTGCAA GAAGAGGGGATGGAGCGCCAGC
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
140873 CTTGTCCTTGAAGCTGCAAGTA...CAGGAAGAGGGGATGGAGCGCCAGC
1900 . : . : . : . : . :
1721 TGGTGGCCCTCCTGGAGGAGCTGTCGGCTGAGCACTACCTGCCCATCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141459 TGGTGGCCCTCCTGGAGGAGCTGTCGGCTGAGCACTACCTGCCCATCTTT
1950 . : . : . : . : . :
1771 GCGCACCACCGCCTCTCACTGGACCTGCTGAGCCAAATGAGCCCAGGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141509 GCGCACCACCGCCTCTCACTGGACCTGCTGAGCCAAATGAGCCCAGGGGA
2000 . : . : . : . : . :
1821 CCTGGCCAAG GTGGGCGTCTCAGAAGCTGGCCTGCAGCACG
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
141559 CCTGGCCAAGGTG...CAGGTGGGCGTCTCAGAAGCTGGCCTGCAGCACG
2050 . : . : . : . : . :
1862 AGATCCTCCGGAGAGTCCAGGAACTGCTGGATGCAGCCAGGATCCAGCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142757 AGATCCTCCGGAGAGTCCAGGAACTGCTGGATGCAGCCAGGATCCAGCCA
2100 . : . : . : . : . :
1912 G AGCTGAAACCACCAATGGGTGAGGTCGTCACCCCTACGGC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142807 GGTA...CAGAGCTGAAACCACCAATGGGTGAGGTCGTCACCCCTACGGC
2150 . : . : . : . : . :
1953 CCCCCAGGAGCCTCCTGAGTCTGTGAGGCCATCCGCTCCCCCTGCAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146523 CCCCCAGGAGCCTCCTGAGTCTGTGAGGCCATCCGCTCCCCCTGCAGAGC
2200 . : . : . : . : . :
2003 TGGAGGTGCAGGCCTCAGAGTGTGTCGTGTGCCTGGAACGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
146573 TGGAGGTGCAGGCCTCAGAGTGTGTCGTGTGCCTGGAACGGGAGGTA...
2250 . : . : . : . : . :
2047 GCCCAGATGATCTTCCTCAACTGTGGCCACGTCTGCTGCTGCCAGCA
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148244 CAGGCCCAGATGATCTTCCTCAACTGTGGCCACGTCTGCTGCTGCCAGCA
2300 . : . : . : . : . :
2094 GTGCTGCCAGCCACTGCGCACCTGCCCGCTGTGCCGCCAGGACATCGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148294 GTGCTGCCAGCCACTGCGCACCTGCCCGCTGTGCCGCCAGGACATCGCCC
2350 . : . : .
2144 AGCGCCTCCGCATCTACCACAGCAGC
||||||||||||||||||||||||||
148344 AGCGCCTCCGCATCTACCACAGCAGC