seq1 = pF1KB3283.tfa, 3567 bp
seq2 = pF1KB3283/gi568815590r_22015703.tfa (gi568815590r:22015703_22229170), 213468 bp

>pF1KB3283 3567
>gi568815590r:22015703_22229170 (Chr8)

(complement)

1-612  (100001-100612)   100% ->
613-1405  (101342-102134)   99% ->
1406-1556  (103439-103589)   100% ->
1557-1750  (103667-103860)   100% ->
1751-1915  (105358-105522)   100% ->
1916-2005  (106292-106381)   100% ->
2006-2121  (106563-106678)   100% ->
2122-2203  (107477-107558)   100% ->
2204-2367  (107943-108106)   100% ->
2368-2610  (108213-108455)   100% ->
2611-2776  (108664-108829)   100% ->
2777-2846  (108998-109067)   100% ->
2847-2977  (109281-109411)   100% ->
2978-3097  (109888-110007)   100% ->
3098-3213  (110106-110221)   100% ->
3214-3378  (112132-112296)   99% ->
3379-3507  (112743-112871)   100% ->
3508-3567  (113409-113468)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAGTACGCCCAGCTTCCTGAAGGGCACCCCAACCTGGGAGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAGTACGCCCAGCTTCCTGAAGGGCACCCCAACCTGGGAGAAGAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCCCAGAGAACGGCATCGTGAGACAGGAGCCCGGCAGCCCGCCTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCCCAGAGAACGGCATCGTGAGACAGGAGCCCGGCAGCCCGCCTCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGGACTGCACCATGGGCCGCTGTGCCTGGGAGAGCCTGCTCCCTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGGACTGCACCATGGGCCGCTGTGCCTGGGAGAGCCTGCTCCCTTTTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGGGCGTCCTGAGCACCCCAGACTCCTGGCTTCCCCCTGGCTTCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGGGCGTCCTGAGCACCCCAGACTCCTGGCTTCCCCCTGGCTTCCCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCCCCAAGGACATGCTCCCACTTGTGGAGGGCGAGGGCCCCCAGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCCCCAAGGACATGCTCCCACTTGTGGAGGGCGAGGGCCCCCAGAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGAGAGGAAGGTCAACTGGCTGGGCAGCAAAGAGGGACTGCGCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGAGAGGAAGGTCAACTGGCTGGGCAGCAAAGAGGGACTGCGCTGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGCCATGCTTACCCATCCGCTGGCATTCTGCGGGCCAGCGTGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGCCATGCTTACCCATCCGCTGGCATTCTGCGGGCCAGCGTGCCCACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCGCTGTGGCCCCCTGATGCCTGAGCATAGTGGTGGCCATCTCAAGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCGCTGTGGCCCCCTGATGCCTGAGCATAGTGGTGGCCATCTCAAGAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACCCTGTGGCCTTCCGGCCCTGGCACTGCCCTTTCCTTCTGGAGACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACCCTGTGGCCTTCCGGCCCTGGCACTGCCCTTTCCTTCTGGAGACCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCCTGGAGCGAGCTCCCTTCTGGGTGCCCACCTGCTTGCCACCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCCTGGAGCGAGCTCCCTTCTGGGTGCCCACCTGCTTGCCACCCTACCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGTCTGGCCTGCCCCCAGAGCATCCATGTGACTGGCCCCTGACCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGTCTGGCCTGCCCCCAGAGCATCCATGTGACTGGCCCCTGACCCCGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCCCTGGGTATACTCCGGGGGCCAGCCCAAAGTGCCCTCTGCCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCCCTGGGTATACTCCGGGGGCCAGCCCAAAGTGCCCTCTGCCTTCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTAGGCAGCAAG         GGCTTTTACTACAAGGATCCGAGCATTCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTAGGCAGCAAGGTG...TAGGGCTTTTACTACAAGGATCCGAGCATTCC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CAGGTTGGCAAAGGAGCCCTTGGCAGCTGCGGAACCTGGGTTGTTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101371 CAGGTTGGCAAAGGAGCCCTTGGCAGCTGCGGAACCTGGGTTGTTTGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TAAACTCTGGTGGGCACCTGCAGAGAGCCGGGGAGGCCGAACGCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101421 TAAACTCTGGTGGGCACCTGCAGAGAGCCGGGGAGGCCGAACGCCCTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGCACCAGAGGGATGGAGAGATGGGAGCTGGCCGGCAGCAGAATCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101471 CTGCACCAGAGGGATGGAGAGATGGGAGCTGGCCGGCAGCAGAATCCTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCCGCTCTTCCTGGGGCAGCCAGACACTGTGCCCTGGACCTCCTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101521 CCCGCTCTTCCTGGGGCAGCCAGACACTGTGCCCTGGACCTCCTGGCCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CTTGTCCCCCAGGCCTTGTTCATACTCTTGGCAACGTCTGGGCTGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101571 CTTGTCCCCCAGGCCTTGTTCATACTCTTGGCAACGTCTGGGCTGGGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GGCGATGGGAACCTTGGGTACCAGCTGGGGCCACCAGCAACACCAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101621 GGCGATGGGAACCTTGGGTACCAGCTGGGGCCACCAGCAACACCAAGGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CCCCTCTCCTGAGCCGCCTGTCACCCAGCGGGGCTGCTGTTCATCCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101671 CCCCTCTCCTGAGCCGCCTGTCACCCAGCGGGGCTGCTGTTCATCCTACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CACCCACTAAAGGTGGGGATCTTGGCCCTTGTGGGAAGTGCCAGGAGGGC
        |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
 101721 CACCCACTAAAGGTGGGGGTCTTGGCCCTTGTGGGAAGTGCCAGGAGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CTGGAGGGGGGTGCCAGTGGAGCCAGCGAACCCAGCGAGGAAGTGAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101771 CTGGAGGGGGGTGCCAGTGGAGCCAGCGAACCCAGCGAGGAAGTGAACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGCCTCTGGCCCCAGGGCCTGTCCCCCCAGCCACCACACCAAGCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101821 GGCCTCTGGCCCCAGGGCCTGTCCCCCCAGCCACCACACCAAGCTGAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 AGACATGGCTCACACGGCACTCGGAGCAGTTTGAATGTCCACGCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101871 AGACATGGCTCACACGGCACTCGGAGCAGTTTGAATGTCCACGCGGCTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CCTGAGGTCGAGGAGAGGCCGGTTGCTCGGCTCCGGGCCCTCAAAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101921 CCTGAGGTCGAGGAGAGGCCGGTTGCTCGGCTCCGGGCCCTCAAAAGGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AGGCAGCCCCGAGGTCCAGGGAGCAATGGGCAGTCCAGCCCCCAAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101971 AGGCAGCCCCGAGGTCCAGGGAGCAATGGGCAGTCCAGCCCCCAAGCGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 CACCGGACCCTTTCCCAGGCACTGCAGAACAGGGGGCTGGGGGTTGGCAG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102021 CACCGGACCCTTTTCCAGGCACTGCAGAACAGGGGGCTGGGGGTTGGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GAGGTGCGGGACACATCGATAGGGAACAAGGATGTGGACTCGGGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102071 GAGGTGCGGGACACATCGATAGGGAACAAGGATGTGGACTCGGGACAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TGATGAGCAGAAAG         GACCCCAAGATGGCCAGGCCAGTCTCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 102121 TGATGAGCAGAAAGGTA...CAGGACCCCAAGATGGCCAGGCCAGTCTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AGGACCCGGGACTTCAGGACATACCATGCCTGGCTCTCCCTGCAAAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103466 AGGACCCGGGACTTCAGGACATACCATGCCTGGCTCTCCCTGCAAAACTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 GCTCAATGCCAAAGTTGTGCCCAGGCAGCTGGAGAGGGAGGAGGGCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103516 GCTCAATGCCAAAGTTGTGCCCAGGCAGCTGGAGAGGGAGGAGGGCACGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 CTGCCACTCTCAGCAAGTGCGGAG         ATCGCCTCTGGGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103566 CTGCCACTCTCAGCAAGTGCGGAGGTG...CAGATCGCCTCTGGGAGGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AGCTGCAGCAGGAGGAAGACACAGCCACCAACTCCAGCTCTGAGGAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103684 AGCTGCAGCAGGAGGAAGACACAGCCACCAACTCCAGCTCTGAGGAAGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 CCAGGGTCCGGCCCTGACAGCCGGCTCAGCACAGGCCTCGCCAAGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103734 CCAGGGTCCGGCCCTGACAGCCGGCTCAGCACAGGCCTCGCCAAGCACCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 GCTCAGTGGTTTGGGGGACCGACTGTGCCGCCTGCTGCGGAGGGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103784 GCTCAGTGGTTTGGGGGACCGACTGTGCCGCCTGCTGCGGAGGGAGCGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 AGGCCCTGGCTTGGGCCCAGCGGGAAG         GCCAAGGGCCAGCC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103834 AGGCCCTGGCTTGGGCCCAGCGGGAAGGTG...CAGGCCAAGGGCCAGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1765 GTGACAGAGGACAGCCCAGGCATTCCACGCTGCTGCAGCCGTTGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105372 GTGACAGAGGACAGCCCAGGCATTCCACGCTGCTGCAGCCGTTGCCACCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1815 TGGACTCTTCAACACCCACTGGCGATGTCCCCGCTGCAGCCACCGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105422 TGGACTCTTCAACACCCACTGGCGATGTCCCCGCTGCAGCCACCGGCTGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1865 GTGTGGCCTGTGGTCGTGTGGCAGGCACTGGGCGGGCCAGGGAGAAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105472 GTGTGGCCTGTGGTCGTGTGGCAGGCACTGGGCGGGCCAGGGAGAAAGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1915 G         GCTTTCAGGAGCAGTCCGCGGAGGAGTGCACGCAGGAGGC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105522 GGTA...CAGGCTTTCAGGAGCAGTCCGCGGAGGAGTGCACGCAGGAGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1956 CGGGCACGCTGCCTGTTCCCTGATGCTGACCCAGTTTGTCTCCAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106332 CGGGCACGCTGCCTGTTCCCTGATGCTGACCCAGTTTGTCTCCAGCCAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2006          CTTTGGCAGAGCTGAGCACTGCAATGCACCAGGTCTGGGTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106382 GTG...CAGCTTTGGCAGAGCTGAGCACTGCAATGCACCAGGTCTGGGTC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2047 AAGTTTGATATCCGGGGGCACTGCCCCTGCCAAGCTGATGCCCGGGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106604 AAGTTTGATATCCGGGGGCACTGCCCCTGCCAAGCTGATGCCCGGGTATG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2097 GGCCCCCGGGGATGCAGGCCAGCAG         AAGGAATCAACACAGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106654 GGCCCCCGGGGATGCAGGCCAGCAGGTA...CAGAAGGAATCAACACAGA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2138 AAACGCCCCCAACTCCACAACCTTCCTGCAATGGCGACACCCACAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107493 AAACGCCCCCAACTCCACAACCTTCCTGCAATGGCGACACCCACAGGACC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2188 AAGAGCATCAAAGAGG         AGACCCCCGATTCCGCTGAGACCCC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 107543 AAGAGCATCAAAGAGGGTG...CAGAGACCCCCGATTCCGCTGAGACCCC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 AGCAGAGGACCGTGCTGGCCGAGGGCCCCTGCCTTGTCCTTCTCTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107968 AGCAGAGGACCGTGCTGGCCGAGGGCCCCTGCCTTGTCCTTCTCTCTGCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2279 AACTGCTGGCTTCTACCGCGGTCAAACTCTGCTTGGGCCATGAGCGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108018 AACTGCTGGCTTCTACCGCGGTCAAACTCTGCTTGGGCCATGAGCGAATA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2329 CACATGGCCTTCGCCCCCGTCACTCCGGCCCTGCCCAGT         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108068 CACATGGCCTTCGCCCCCGTCACTCCGGCCCTGCCCAGTGTG...CAGGA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 TGACCGCATCACCAACATCCTGGACAGCATTATCGCACAGGTGGTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108215 TGACCGCATCACCAACATCCTGGACAGCATTATCGCACAGGTGGTGGAAC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 GGAAGATCCAGGAGAAAGCCCTGGGGCCGGGGCTTCGAGCTGGCCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108265 GGAAGATCCAGGAGAAAGCCCTGGGGCCGGGGCTTCGAGCTGGCCCGGGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 CTGCGCAAGGGCCTGGGCCTGCCCCTCTCTCCAGTGCGGCCCCGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108315 CTGCGCAAGGGCCTGGGCCTGCCCCTCTCTCCAGTGCGGCCCCGGCTGCC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 TCCCCCAGGGGCTTTGCTGTGGCTGCAGGAGCCCCAGCCTTGCCCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108365 TCCCCCAGGGGCTTTGCTGTGGCTGCAGGAGCCCCAGCCTTGCCCTCGGC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 GTGGCTTCCACCTCTTCCAGGAGCACTGGAGGCAGGGCCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 108415 GTGGCTTCCACCTCTTCCAGGAGCACTGGAGGCAGGGCCAGGTG...CAG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2611 CCTGTGTTGGTGTCAGGGATCCAAAGGACATTGCAGGGCAACCTGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108664 CCTGTGTTGGTGTCAGGGATCCAAAGGACATTGCAGGGCAACCTGTGGGG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2661 GACAGAAGCTCTTGGGGCACTTGGAGGCCAGGTGCAGGCGCTGAGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108714 GACAGAAGCTCTTGGGGCACTTGGAGGCCAGGTGCAGGCGCTGAGCCCCC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2711 TCGGACCTCCCCAGCCCAGCAGCCTGGGCAGCACAACATTCTGGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108764 TCGGACCTCCCCAGCCCAGCAGCCTGGGCAGCACAACATTCTGGGAGGGC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2761 TTCTCCTGGCCTGAGC         TTCGCCCAAAGTCAGACGAGGGCTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 108814 TTCTCCTGGCCTGAGCGTA...TAGTTCGCCCAAAGTCAGACGAGGGCTC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2802 TGTCCTCCTGCTGCACCGAGCTTTGGGGGATGAGGACACCAGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 109023 TGTCCTCCTGCTGCACCGAGCTTTGGGGGATGAGGACACCAGCAGGTG..

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2847     GGTGGAGAACCTAGCTGCCAGTCTGCCACTTCCGGAGTACTGCGCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109073 .CAGGGTGGAGAACCTAGCTGCCAGTCTGCCACTTCCGGAGTACTGCGCC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2893 CTCCATGGAAAACTCAACCTGGCTTCCTACCTCCCACCGGGCCTTGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109327 CTCCATGGAAAACTCAACCTGGCTTCCTACCTCCCACCGGGCCTTGCCCT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2943 GCGTCCACTGGAGCCCCAGCTCTGGGCAGCCTATG         GTGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109377 GCGTCCACTGGAGCCCCAGCTCTGGGCAGCCTATGGTG...CAGGTGTGA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2984 GCCCGCACCGGGGACACCTGGGGACCAAGAACCTCTGTGTGGAGGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109894 GCCCGCACCGGGGACACCTGGGGACCAAGAACCTCTGTGTGGAGGTGGCC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3034 GACCTGGTCAGCATCCTGGTGCATGCCGACACACCACTGCCTGCCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109944 GACCTGGTCAGCATCCTGGTGCATGCCGACACACCACTGCCTGCCTGGCA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3084 CCGGGCACAGAAAG         ACTTCCTTTCAGGCCTGGACGGGGAGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 109994 CCGGGCACAGAAAGGTA...CAGACTTCCTTTCAGGCCTGGACGGGGAGG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3125 GGCTCTGGTCTCCGGGCAGCCAGGTCAGCACTGTGTGGCACGTGTTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110133 GGCTCTGGTCTCCGGGCAGCCAGGTCAGCACTGTGTGGCACGTGTTCCGG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3175 GCACAGGACGCCCAGCGCATCCGCCGCTTTCTCCAGATG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 110183 GCACAGGACGCCCAGCGCATCCGCCGCTTTCTCCAGATGGTG...GAGGT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3216 GTGCCCGGCCGGGGCAGGCGCCCTGGAGCCTGGCGCCCCAGGCAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112134 GTGCCCGGCCGGGGCAGGCGCCCTGGAGCCTGGCGCCCCAGGCAGCTGCT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3266 ACCTGGATGCAGGGCTGCGGCGGCGCCTGCGGGAGGAGTGGGGCGTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112184 ACCTGGATGCAGGGCTGCGGCGGCGCCTGCGGGAGGAGTGGGGCGTGAGC

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3316 TGCTGGACCCTGCTCCAGGCCCCAGGAGAGGCCGTGCTGGTGCCTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 112234 TGCTGGACCCTGCTCCAGGCCCCCGGAGAGGCCGTGCTGGTGCCTGCAGG

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3366 GGCTCCCCACCAG         GTGCAGGGCCTGGTGAGCACAGTCAGCG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 112284 GGCTCCCCACCAGGTG...CAGGTGCAGGGCCTGGTGAGCACAGTCAGCG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3407 TCACTCAGCACTTCCTCTCCCCTGAGACCTCTGCCCTCTCTGCTCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112771 TCACTCAGCACTTCCTCTCCCCTGAGACCTCTGCCCTCTCTGCTCAGCTC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3457 TGCCACCAGGGACCCAGCCTTCCCCCTGACTGCCACCTGCTTTATGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112821 TGCCACCAGGGACCCAGCCTTCCCCCTGACTGCCACCTGCTTTATGCCCA

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3507 G         ATGGACTGGGCTGTGTTCCAAGCAGTGAAGGTGGCCGTGG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112871 GGTG...TAGATGGACTGGGCTGTGTTCCAAGCAGTGAAGGTGGCCGTGG

   3700     .    :    .    :
   3548 GGACATTACAGGAGGCCAAA
        ||||||||||||||||||||
 113449 GGACATTACAGGAGGCCAAA