seq1 = pF1KB3230.tfa, 1887 bp
seq2 = pF1KB3230/gi568815575r_10349371.tfa (gi568815575r:10349371_10667547), 318177 bp

>pF1KB3230 1887
>gi568815575r:10349371_10667547 (ChrX)

(complement)

1-546  (100001-100546)   100% ->
547-642  (144361-144456)   100% ->
643-750  (171857-171964)   100% ->
751-899  (184920-185068)   100% ->
900-1027  (192798-192925)   100% ->
1028-1171  (197708-197851)   100% ->
1172-1333  (207741-207902)   100% ->
1334-1541  (212471-212678)   100% ->
1542-1887  (217832-218177)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAACACTGGAGTCAGAACTGACCTGCCCTATTTGTCTGGAGCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAACACTGGAGTCAGAACTGACCTGCCCTATTTGTCTGGAGCTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGAGGACCCTCTTCTACTGCCCTGCGCACACAGCCTCTGCTTCAACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGAGGACCCTCTTCTACTGCCCTGCGCACACAGCCTCTGCTTCAACTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCACCGCATCCTAGTATCACACTGTGCCACCAACGAGTCTGTGGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCACCGCATCCTAGTATCACACTGTGCCACCAACGAGTCTGTGGAGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCACCGCCTTCCAGTGCCCCACCTGCCGGCATGTCATCACCCTCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCACCGCCTTCCAGTGCCCCACCTGCCGGCATGTCATCACCCTCAGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGAGGTCTAGACGGGCTCAAGCGCAACGTCACCCTACAGAACATCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGAGGTCTAGACGGGCTCAAGCGCAACGTCACCCTACAGAACATCATCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAGGTTCCAGAAAGCATCAGTGAGCGGGCCCAACTCTCCCAGCGAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAGGTTCCAGAAAGCATCAGTGAGCGGGCCCAACTCTCCCAGCGAGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGTCGGGAGCGGGCCTTTGACGCCAACACCATGACCTCCGCCGAGAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGTCGGGAGCGGGCCTTTGACGCCAACACCATGACCTCCGCCGAGAAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTCTGCCAGTTTTGTGACCAGGATCCTGCCCAGGACGCTGTGAAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTCTGCCAGTTTTGTGACCAGGATCCTGCCCAGGACGCTGTGAAGACCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGTCACTTGTGAAGTATCCTACTGTGACGAGTGCCTGAAAGCCACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGTCACTTGTGAAGTATCCTACTGTGACGAGTGCCTGAAAGCCACTCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCGAATAAGAAGCCCTTTACAGGCCATCGTCTGATTGAGCCAATTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCGAATAAGAAGCCCTTTACAGGCCATCGTCTGATTGAGCCAATTCCGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCTCACATCCGGGGGCTGATGTGCTTGGAGCATGAGGATGAGAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100501 CTCTCACATCCGGGGGCTGATGTGCTTGGAGCATGAGGATGAGAAGGTG.

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547      CAAAACTTAGAGAGTAACCTCACCAACCTTATTAAGAGGAACACA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ..CAGCAAAACTTAGAGAGTAACCTCACCAACCTTATTAAGAGGAACACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAACTGGAGACCCTTTTGGCTAAACTCATCCAAACCTGTCAACATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144406 GAACTGGAGACCCTTTTGGCTAAACTCATCCAAACCTGTCAACATGTTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 A         GTCAATGCATCACGTCAAGAAGCCAAATTGACAGAGGAGT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144456 AGTG...TAGGTCAATGCATCACGTCAAGAAGCCAAATTGACAGAGGAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTGATCTTCTCATTGAGATCATTCAGCAAAGACGACAGATTATTGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171897 GTGATCTTCTCATTGAGATCATTCAGCAAAGACGACAGATTATTGGAACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AAGATCAAAGAAGGGAAG         GTGATGAGGCTTCGCAAACTGGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 171947 AAGATCAAAGAAGGGAAGGTA...AAGGTGATGAGGCTTCGCAAACTGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCAGCAGATTGCAAACTGCAAACAGTGCATTGAGCGGTCAGCATCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184943 TCAGCAGATTGCAAACTGCAAACAGTGCATTGAGCGGTCAGCATCACTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCTCCCAAGCGGAACACTCTCTGAAGGAGAATGATCATGCGCGTTTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 184993 TCTCCCAAGCGGAACACTCTCTGAAGGAGAATGATCATGCGCGTTTCCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CAGACTGCTAAGAATATCACCGAGAG         AGTCTCCATGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 185043 CAGACTGCTAAGAATATCACCGAGAGGTG...CAGAGTCTCCATGGCAAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TGCATCCTCCCAGGTTCTAATTCCTGAAATCAACCTCAATGACACATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192813 TGCATCCTCCCAGGTTCTAATTCCTGAAATCAACCTCAATGACACATTTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACACCTTTGCCTTAGATTTTTCCCGAGAGAAGAAACTGCTAGAATGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192863 ACACCTTTGCCTTAGATTTTTCCCGAGAGAAGAAACTGCTAGAATGTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GATTACCTTACAG         CTCCCAACCCTCCCACAATTAGAGAAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 192913 GATTACCTTACAGGTA...CAGCTCCCAACCCTCCCACAATTAGAGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GCTCTGCACAGCTTCATATGACACCATCACTGTGCATTGGACCTCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197736 GCTCTGCACAGCTTCATATGACACCATCACTGTGCATTGGACCTCCGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 ATGAGTTCAGCGTGGTCTCCTACGAGCTCCAGTACACCATATTCACCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197786 ATGAGTTCAGCGTGGTCTCCTACGAGCTCCAGTACACCATATTCACCGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CAAGCCAACGTCGTTA         GTCTGTGTAATTCGGCTGATAGCTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 197836 CAAGCCAACGTCGTTAGTG...CAGGTCTGTGTAATTCGGCTGATAGCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GATGATAGTACCCAACATCAAGCAGAACCACTACACGGTGCACGGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207766 GATGATAGTACCCAACATCAAGCAGAACCACTACACGGTGCACGGTCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGAGCGGCACCAAGTACATCTTCATGGTCAAGGCCATCAACCAGGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207816 AGAGCGGCACCAAGTACATCTTCATGGTCAAGGCCATCAACCAGGCGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AGCCGCAGCAGTGAGCCTGGGAAGTTGAAGACAAACA         GCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 207866 AGCCGCAGCAGTGAGCCTGGGAAGTTGAAGACAAACAGTA...CAGGCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 ACCATTTAAACTGGATCCCAAATCTGCTCATCGAAAACTGAAGGTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212475 ACCATTTAAACTGGATCCCAAATCTGCTCATCGAAAACTGAAGGTGTCCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 ATGATAACTTGACAGTAGAACGTGATGAGTCATCATCCAAGAAGAGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212525 ATGATAACTTGACAGTAGAACGTGATGAGTCATCATCCAAGAAGAGTCAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 ACACCTGAACGCTTCACCAGCCAGGGGAGCTATGGAGTAGCTGGAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212575 ACACCTGAACGCTTCACCAGCCAGGGGAGCTATGGAGTAGCTGGAAATGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GTTTATTGATAGTGGCCGGCATTATTGGGAAGTGGTCATAAGTGGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212625 GTTTATTGATAGTGGCCGGCATTATTGGGAAGTGGTCATAAGTGGAAGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CATG         GTATGCCATTGGTCTTGCTTACAAATCAGCCCCGAAG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 212675 CATGGTA...CAGGTATGCCATTGGTCTTGCTTACAAATCAGCCCCGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 CATGAATGGATTGGGAAGAACTCTGCTTCCTGGGCGCTCTGCCGCTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217869 CATGAATGGATTGGGAAGAACTCTGCTTCCTGGGCGCTCTGCCGCTGCAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CAATAACTGGGTGGTGAGACACAATAGCAAGGAAATCCCCATTGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217919 CAATAACTGGGTGGTGAGACACAATAGCAAGGAAATCCCCATTGAGCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 CCCCCCACCTCCGGCGCGTGGGCATCCTGCTGGACTATGATAACGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217969 CCCCCCACCTCCGGCGCGTGGGCATCCTGCTGGACTATGATAACGGCTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 ATCGCCTTTTATGATGCTTTGAACTCCATCCACCTCTACACCTTCGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218019 ATCGCCTTTTATGATGCTTTGAACTCCATCCACCTCTACACCTTCGACGT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CGCATTTGCGCAGCCTGTTTGCCCCACCTTCACCGTGTGGAACAAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218069 CGCATTTGCGCAGCCTGTTTGCCCCACCTTCACCGTGTGGAACAAGTGTC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 TGACGATTATCACTGGGCTCCCTATCCCAGACCATTTGGACTGCACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218119 TGACGATTATCACTGGGCTCCCTATCCCAGACCATTTGGACTGCACAGAG

   1950     .
   1879 CAGCTGCCG
        |||||||||
 218169 CAGCTGCCG