seq1 = pF1KB3093.tfa, 2235 bp
seq2 = pF1KB3093/gi568815581r_41655747.tfa (gi568815581r:41655747_41871854), 216108 bp

>pF1KB3093 2235
>gi568815581r:41655747_41871854 (Chr17)

(complement)

1-208  (100001-100208)   100% ->
209-468  (102178-102437)   100% ->
469-707  (102648-102886)   100% ->
708-909  (104275-104476)   100% ->
910-1054  (106788-106932)   100% ->
1055-1158  (107039-107142)   100% ->
1159-1497  (108534-108872)   100% ->
1498-1653  (112985-113140)   100% ->
1654-1773  (113337-113456)   100% ->
1774-1924  (114071-114221)   100% ->
1925-2046  (114319-114440)   100% ->
2047-2086  (115641-115680)   100% ->
2087-2235  (115960-116108)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGTGATGAACCTGATGGAGCAGCCTATCAAGGTGACTGAGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGTGATGAACCTGATGGAGCAGCCTATCAAGGTGACTGAGTGGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGACATACACCTACGACTCGGGTATCCACTCGGGCGCCAACACCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGACATACACCTACGACTCGGGTATCCACTCGGGCGCCAACACCTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCTCCGTCAGCAGCAAGGGCATCATGGAGGAGGATGAGGCCTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCTCCGTCAGCAGCAAGGGCATCATGGAGGAGGATGAGGCCTGCGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCCAGTACACGCTCAAGAAAACCACCACTTACACCCAGGGGGTGCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCCAGTACACGCTCAAGAAAACCACCACTTACACCCAGGGGGTGCCCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCCAAG         GTGATCTGGAGTACCAGATGTCCACAACAGCCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCCAAGGTC...CAGGTGATCTGGAGTACCAGATGTCCACAACAGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGCCAAACGGGTGCGGGAGGCCATGTGCCCTGGTGTGTCAGGCGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102211 GGGCCAAACGGGTGCGGGAGGCCATGTGCCCTGGTGTGTCAGGCGAGGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCTCGCTTCTGCTGGCCACCCAGGTGGAGGGGCAGGCCACCAACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102261 AGCTCGCTTCTGCTGGCCACCCAGGTGGAGGGGCAGGCCACCAACCTGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCGACTGGCCGAGCCGTCCCAGCTGCTCAAGTCGGCCATTGTGCATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102311 GCGACTGGCCGAGCCGTCCCAGCTGCTCAAGTCGGCCATTGTGCATCTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCAACTACCAGGACGATGCCGAGCTGGCCACTCGCGCCCTGCCCGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102361 TCAACTACCAGGACGATGCCGAGCTGGCCACTCGCGCCCTGCCCGAGCTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCAAACTGCTCAACGACGAGGACCCG         GTGGTGGTGACCAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 102411 ACCAAACTGCTCAACGACGAGGACCCGGTC...CAGGTGGTGGTGACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCGGCCATGATTGTGAACCAGCTGTCGAAGAAGGAGGCGTCGCGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102662 GGCGGCCATGATTGTGAACCAGCTGTCGAAGAAGGAGGCGTCGCGGCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCTGATGGGCTCGCCCCAGCTGGTGGCCGCTGTCGTGCGTACCATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102712 CCCTGATGGGCTCGCCCCAGCTGGTGGCCGCTGTCGTGCGTACCATGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AATACCAGCGACCTGGACACAGCCCGCTGCACCACCAGCATCCTGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102762 AATACCAGCGACCTGGACACAGCCCGCTGCACCACCAGCATCCTGCACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCTCTCCCACCACCGGGAGGGGCTGCTCGCCATCTTCAAGTCGGGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102812 CCTCTCCCACCACCGGGAGGGGCTGCTCGCCATCTTCAAGTCGGGTGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCCCTGCTCTGGTCCGCATGCTCAG         CTCCCCTGTGGAGTCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102862 TCCCTGCTCTGGTCCGCATGCTCAGGTA...CAGCTCCCCTGTGGAGTCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTCCTGTTCTATGCCATCACCACGCTGCACAACCTGCTCCTGTACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104291 GTCCTGTTCTATGCCATCACCACGCTGCACAACCTGCTCCTGTACCAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGGCGCCAAGATGGCCGTGCGCCTGGCCGACGGGCTGCAAAAGATGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104341 GGGCGCCAAGATGGCCGTGCGCCTGGCCGACGGGCTGCAAAAGATGGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCCTGCTCAACAAGAACAACCCCAAGTTCCTGGCCATCACCACCGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104391 CCCTGCTCAACAAGAACAACCCCAAGTTCCTGGCCATCACCACCGACTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTGCAGCTCCTGGCCTACGGCAACCAGGAGAGCAAG         CTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104441 CTGCAGCTCCTGGCCTACGGCAACCAGGAGAGCAAGGTG...TAGCTGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CATCCTGGCCAATGGTGGGCCCCAGGCCCTCGTGCAGATCATGCGTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106793 CATCCTGGCCAATGGTGGGCCCCAGGCCCTCGTGCAGATCATGCGTAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ACAGTTATGAAAAGCTGCTCTGGACCACCAGTCGTGTGCTCAAGGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106843 ACAGTTATGAAAAGCTGCTCTGGACCACCAGTCGTGTGCTCAAGGTGCTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TCCGTGTGTCCCAGCAATAAGCCTGCCATTGTGGAGGCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106893 TCCGTGTGTCCCAGCAATAAGCCTGCCATTGTGGAGGCTGGTG...CAGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TGGGATGCAGGCCCTGGGCAAGCACCTGACCAGCAACAGCCCCCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107040 TGGGATGCAGGCCCTGGGCAAGCACCTGACCAGCAACAGCCCCCGCCTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGCAGAACTGCCTGTGGACCCTGCGCAACCTCTCAGATGTGGCCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107090 TGCAGAACTGCCTGTGGACCCTGCGCAACCTCTCAGATGTGGCCACCAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CAG         GAGGGCCTGGAGAGTGTGCTGAAGATTCTGGTGAATCA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107140 CAGGTG...CAGGAGGGCCTGGAGAGTGTGCTGAAGATTCTGGTGAATCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GCTGAGTGTGGATGACGTCAACGTCCTCACCTGTGCCACGGGCACACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108572 GCTGAGTGTGGATGACGTCAACGTCCTCACCTGTGCCACGGGCACACTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CCAACCTGACATGCAACAACAGCAAGAACAAGACGCTGGTGACACAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108622 CCAACCTGACATGCAACAACAGCAAGAACAAGACGCTGGTGACACAGAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 AGCGGTGTGGAGGCTCTCATCCATGCCATCCTGCGTGCTGGTGACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108672 AGCGGTGTGGAGGCTCTCATCCATGCCATCCTGCGTGCTGGTGACAAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CGACATCACGGAGCCTGCCGTCTGCGCTCTGCGCCACCTCACTAGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108722 CGACATCACGGAGCCTGCCGTCTGCGCTCTGCGCCACCTCACTAGCCGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 ACCCTGAGGCCGAGATGGCCCAGAACTCTGTGCGTCTCAACTATGGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108772 ACCCTGAGGCCGAGATGGCCCAGAACTCTGTGCGTCTCAACTATGGCATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CCAGCCATCGTGAAGCTGCTCAACCAGCCCAACCAGTGGCCACTGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108822 CCAGCCATCGTGAAGCTGCTCAACCAGCCCAACCAGTGGCCACTGGTCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 G         GCAACCATCGGCTTGATCAGGAATCTGGCCCTGTGCCCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108872 GGTA...CAGGCAACCATCGGCTTGATCAGGAATCTGGCCCTGTGCCCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCAACCATGCCCCGCTGCAGGAGGCAGCGGTCATCCCCCGCCTCGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113025 CCAACCATGCCCCGCTGCAGGAGGCAGCGGTCATCCCCCGCCTCGTCCAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 CTGCTGGTGAAGGCCCACCAGGATGCCCAGCGCCACGTAGCTGCAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113075 CTGCTGGTGAAGGCCCACCAGGATGCCCAGCGCCACGTAGCTGCAGGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 ACAGCAGCCCTACACG         GATGGTGTGAGGATGGAGGAGATTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 113125 ACAGCAGCCCTACACGGTA...CAGGATGGTGTGAGGATGGAGGAGATTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1679 TGGAGGGCTGCACCGGAGCACTGCACATCCTCGCCCGGGACCCCATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113362 TGGAGGGCTGCACCGGAGCACTGCACATCCTCGCCCGGGACCCCATGAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 CGCATGGAGATCTTCCGGCTCAACACCATTCCCCTGTTTGTGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 113412 CGCATGGAGATCTTCCGGCTCAACACCATTCCCCTGTTTGTGCAGGTG..

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774     CTCCTGTACTCGTCGGTGGAGAACATCCAGCGCGTGGCTGCCGGGG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113462 .CAGCTCCTGTACTCGTCGGTGGAGAACATCCAGCGCGTGGCTGCCGGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 TGCTGTGTGAGCTGGCCCAGGACAAGGAGGCGGCCGACGCCATTGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114117 TGCTGTGTGAGCTGGCCCAGGACAAGGAGGCGGCCGACGCCATTGATGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GAGGGGGCCTCGGCCCCACTCATGGAGTTGCTGCACTCCCGCAACGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114167 GAGGGGGCCTCGGCCCCACTCATGGAGTTGCTGCACTCCCGCAACGAGGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 CACTG         CCACCTACGCTGCTGCCGTCCTGTTCCGCATCTCCG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114217 CACTGGTG...CAGCCACCTACGCTGCTGCCGTCCTGTTCCGCATCTCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1961 AGGACAAGAACCCAGACTACCGGAAGCGCGTGTCCGTGGAGCTCACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114355 AGGACAAGAACCCAGACTACCGGAAGCGCGTGTCCGTGGAGCTCACCAAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 TCCCTCTTCAAGCATGACCCGGCTGCCTGGGAGGCT         GCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 114405 TCCCTCTTCAAGCATGACCCGGCTGCCTGGGAGGCTGTG...CAGGCCCA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 GAGCATGATTCCCATCAATGAGCCCTATGGAGATG         ACTTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|| |||
 115646 GAGCATGATTCCCATCAATGAGCCCTATGGAGATGGTA...CAGACATGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 ATGCCACCTACCGCCCCATGTACTCCAGCGATGTGCCCCTTGACCCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115966 ATGCCACCTACCGCCCCATGTACTCCAGCGATGTGCCCCTTGACCCGCTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2143 GAGATGCACATGGACATGGATGGAGACTACCCCATCGACACCTACAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116016 GAGATGCACATGGACATGGATGGAGACTACCCCATCGACACCTACAGCGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :
   2193 CGGCCTCAGGCCCCCGTACCCCACTGCAGACCACATGCTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116066 CGGCCTCAGGCCCCCGTACCCCACTGCAGACCACATGCTGGCC