seq1 = pF1KB1389.tfa, 1944 bp
seq2 = pF1KB1389/gi568815591f_91164881.tfa (gi568815591f:91164881_91366821), 201941 bp

>pF1KB1389 1944
>gi568815591f:91164881_91366821 (Chr7)

1-1944  (100001-101941)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGGAGGAGGCGCCTAAGAAGTCCCGGGCCGCCGGCGGTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGGAGGAGGCGCCTAAGAAGTCCCGGGCCGCCGGCGGTGGCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCTGGGAACTTTGTGCCGGGGCGCTCTCGGCCCGGCTGGCGGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCTGGGAACTTTGTGCCGGGGCGCTCTCGGCCCGGCTGGCGGAGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGCGGGGACGCCGGTGGCCGCCGCCGCCCGCCAGTTGACCCCCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGCGGGGACGCCGGTGGCCGCCGCCGCCCGCCAGTTGACCCCCGGCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGCGCGCCAGCTGCTGCTGCTGCTTTGGCTGCTGGAGGCTCCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGCGCGCCAGCTGCTGCTGCTGCTTTGGCTGCTGGAGGCTCCGCTGCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGGGGTCCGGGCCCAGGCGGCGGGCCAGGGGCCAGGCCAGGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGGGGGTCCGGGCCCAGGCGGCGGGCCAGGGGCCAGGCCAGGGGCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCCGGGGCAGCAACCGCCGCCGCCGCCGCCTCAGCAGCAACAGAGCGGG
        ||||||||||||||---|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCCGGGGCAGCAA   CCGCCGCCGCCGCCTCAGCAGCAACAGAGCGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGCAGTACAACGGCGAGCGGGGCATCTCCGTCCCGGACCACGGCTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100298 CAGCAGTACAACGGCGAGCGGGGCATCTCCGTCCCGGACCACGGCTATTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCAGCCCATCTCCATCCCGCTGTGCACGGACATCGCGTACAACCAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100348 CCAGCCCATCTCCATCCCGCTGTGCACGGACATCGCGTACAACCAGACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATGCCCAACCTGCTGGGCCACACGAACCAGGAGGACGCGGGCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100398 TCATGCCCAACCTGCTGGGCCACACGAACCAGGAGGACGCGGGCCTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGCACCAGTTCTACCCTCTAGTGAAAGTGCAGTGTTCCGCTGAGCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100448 GTGCACCAGTTCTACCCTCTAGTGAAAGTGCAGTGTTCCGCTGAGCTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTCTTCCTGTGCTCCATGTACGCGCCCGTGTGCACCGTGCTAGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100498 GTTCTTCCTGTGCTCCATGTACGCGCCCGTGTGCACCGTGCTAGAGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CGCTGCCGCCCTGCCGCTCCCTGTGCGAGCGCGCGCGCCAGGGCTGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100548 CGCTGCCGCCCTGCCGCTCCCTGTGCGAGCGCGCGCGCCAGGGCTGCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCGCTCATGAACAAGTTCGGCTTCCAGTGGCCAGACACGCTCAAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100598 GCGCTCATGAACAAGTTCGGCTTCCAGTGGCCAGACACGCTCAAGTGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GAAGTTCCCGGTGCACGGCGCCGGCGAGCTGTGCGTGGGCCAGAACACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100648 GAAGTTCCCGGTGCACGGCGCCGGCGAGCTGTGCGTGGGCCAGAACACGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCGACAAGGGCACCCCGACGCCCTCGCTGCTTCCAGAGTTCTGGACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100698 CCGACAAGGGCACCCCGACGCCCTCGCTGCTTCCAGAGTTCTGGACCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AACCCTCAGCACGGCGGCGGAGGGCACCGTGGCGGCTTCCCGGGGGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100748 AACCCTCAGCACGGCGGCGGAGGGCACCGTGGCGGCTTCCCGGGGGGCGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CGGCGCGTCGGAGCGAGGCAAGTTCTCCTGCCCGCGCGCCCTCAAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100798 CGGCGCGTCGGAGCGAGGCAAGTTCTCCTGCCCGCGCGCCCTCAAGGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTCCTACCTCAACTACCACTTCCTGGGGGAGAAGGACTGCGGCGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100848 CCTCCTACCTCAACTACCACTTCCTGGGGGAGAAGGACTGCGGCGCACCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGTGAGCCGACCAAGGTGTATGGGCTCATGTACTTCGGGCCCGAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100898 TGTGAGCCGACCAAGGTGTATGGGCTCATGTACTTCGGGCCCGAGGAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCGCTTCTCGCGCACCTGGATTGGCATTTGGTCAGTGCTGTGCTGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100948 GCGCTTCTCGCGCACCTGGATTGGCATTTGGTCAGTGCTGTGCTGCGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCACGCTCTTCACGGTGCTTACGTACCTGGTGGACATGCGGCGCTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100998 CCACGCTCTTCACGGTGCTTACGTACCTGGTGGACATGCGGCGCTTCAGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TACCCGGAGCGGCCCATCATCTTCTTGTCCGGCTGTTACACGGCCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101048 TACCCGGAGCGGCCCATCATCTTCTTGTCCGGCTGTTACACGGCCGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGTGGCCTACATCGCCGGCTTCCTCCTGGAAGACCGAGTGGTGTGTAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101098 CGTGGCCTACATCGCCGGCTTCCTCCTGGAAGACCGAGTGGTGTGTAATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACAAGTTCGCCGAGGACGGGGCACGCACTGTGGCGCAGGGCACCAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101148 ACAAGTTCGCCGAGGACGGGGCACGCACTGTGGCGCAGGGCACCAAGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GAGGGCTGCACCATCCTCTTCATGATGCTCTACTTCTTCAGCATGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101198 GAGGGCTGCACCATCCTCTTCATGATGCTCTACTTCTTCAGCATGGCCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTCCATCTGGTGGGTGATCCTGTCGCTCACCTGGTTCCTGGCGGCTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101248 CTCCATCTGGTGGGTGATCCTGTCGCTCACCTGGTTCCTGGCGGCTGGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGAAGTGGGGCCACGAGGCCATCGAAGCCAACTCACAGTATTTTCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101298 TGAAGTGGGGCCACGAGGCCATCGAAGCCAACTCACAGTATTTTCACCTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GCCGCCTGGGCTGTGCCGGCCATCAAGACCATCACCATCCTGGCGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101348 GCCGCCTGGGCTGTGCCGGCCATCAAGACCATCACCATCCTGGCGCTGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CCAGGTGGACGGCGATGTGCTGAGCGGAGTGTGCTTCGTGGGGCTTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101398 CCAGGTGGACGGCGATGTGCTGAGCGGAGTGTGCTTCGTGGGGCTTAACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 ACGTGGACGCGCTGCGTGGCTTCGTGCTGGCGCCCCTCTTCGTGTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101448 ACGTGGACGCGCTGCGTGGCTTCGTGCTGGCGCCCCTCTTCGTGTACCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 TTTATCGGCACGTCCTTTCTGCTGGCCGGCTTTGTGTCGCTCTTCCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101498 TTTATCGGCACGTCCTTTCTGCTGGCCGGCTTTGTGTCGCTCTTCCGCAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CCGCACCATCATGAAGCACGATGGCACCAAGACCGAGAAGCTGGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101548 CCGCACCATCATGAAGCACGATGGCACCAAGACCGAGAAGCTGGAGAAGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TCATGGTGCGCATTGGCGTCTTCAGCGTGCTGTACACTGTGCCAGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101598 TCATGGTGCGCATTGGCGTCTTCAGCGTGCTGTACACTGTGCCAGCCACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 ATCGTCATCGCCTGCTACTTCTACGAGCAGGCCTTCCGGGACCAGTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101648 ATCGTCATCGCCTGCTACTTCTACGAGCAGGCCTTCCGGGACCAGTGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 ACGCAGCTGGGTGGCCCAGAGCTGCAAGAGCTACGCTATCCCCTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101698 ACGCAGCTGGGTGGCCCAGAGCTGCAAGAGCTACGCTATCCCCTGCCCTC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 ACCTCCAGGCGGGCGGAGGCGCCCCGCCGCACCCGCCCATGAGCCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101748 ACCTCCAGGCGGGCGGAGGCGCCCCGCCGCACCCGCCCATGAGCCCGGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 TTCACGGTCTTCATGATTAAGTACCTTATGACGCTGATCGTGGGCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101798 TTCACGGTCTTCATGATTAAGTACCTTATGACGCTGATCGTGGGCATCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GTCGGGCTTCTGGATCTGGTCCGGCAAGACCCTCAACTCCTGGAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101848 GTCGGGCTTCTGGATCTGGTCCGGCAAGACCCTCAACTCCTGGAGGAAGT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TCTACACGAGGCTCACCAACAGCAAACAAGGGGAGACTACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101898 TCTACACGAGGCTCACCAACAGCAAACAAGGGGAGACTACAGTC