seq1 = pF1KB1292.tfa, 1956 bp
seq2 = pF1KB1292/gi568815590r_42317806.tfa (gi568815590r:42317806_42572390), 254585 bp

>pF1KB1292 1956
>gi568815590r:42317806_42572390 (Chr8)

(complement)

1-289  (100001-100289)   100% ->
290-430  (106474-106614)   100% ->
431-516  (109301-109386)   100% ->
517-613  (112399-112495)   100% ->
614-730  (127629-127745)   100% ->
731-934  (132738-132941)   99% ->
935-1523  (134814-135402)   100% ->
1524-1709  (142142-142327)   100% ->
1710-1794  (143549-143633)   100% ->
1795-1956  (154424-154585)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCATGGATGAGTATTTGTGGATGGTCATTTTGGGTTTCATCATAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCATGGATGAGTATTTGTGGATGGTCATTTTGGGTTTCATCATAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCATCTTGGCCTTTTCTGTTGGTGCAAACGATGTTGCCAACTCCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCATCTTGGCCTTTTCTGTTGGTGCAAACGATGTTGCCAACTCCTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTACAGCCGTGGGCTCTGGTGTGGTGACCTTGAGGCAGGCATGCATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTACAGCCGTGGGCTCTGGTGTGGTGACCTTGAGGCAGGCATGCATTTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTTCAATATTTGAAACCACCGGCTCCGTGTTACTAGGCGCCAAAGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCTTCAATATTTGAAACCACCGGCTCCGTGTTACTAGGCGCCAAAGTAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGAAACCATTCGCAAAGGTATCATTGACGTGAACCTGTACAACGAGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGAAACCATTCGCAAAGGTATCATTGACGTGAACCTGTACAACGAGACGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGAGACTCTCATGGCTGGGGAAGTTAGTGCCATGGTTG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100251 TGGAGACTCTCATGGCTGGGGAAGTTAGTGCCATGGTTGGTG...TAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCCGCTGTGTGGCAGCTGATTGCTTCCTTCCTGAGGCTTCCAATCTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106476 TCCGCTGTGTGGCAGCTGATTGCTTCCTTCCTGAGGCTTCCAATCTCAGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AACGCACTGCATTGTGGGTTCTACTATAGGATTCTCACTGGTCGCAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106526 AACGCACTGCATTGTGGGTTCTACTATAGGATTCTCACTGGTCGCAATCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTACCAAAGGTGTGCAGTGGATGGAGCTTGTCAAGATTG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 106576 GTACCAAAGGTGTGCAGTGGATGGAGCTTGTCAAGATTGGTA...CAGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCTTCTTGGTTTATATCTCCACTGTTGTCTGGTTTCATGTCTGGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109303 GCTTCTTGGTTTATATCTCCACTGTTGTCTGGTTTCATGTCTGGCCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTTGTACTCATCAGAATTTTCATCTTAAAAAAG         GAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109353 GTTTGTACTCATCAGAATTTTCATCTTAAAAAAGGTA...CAGGAAGACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTGTTCCCAATGGCCTCCGGGCACTCCCAGTATTCTATGCTGCTACCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112406 CTGTTCCCAATGGCCTCCGGGCACTCCCAGTATTCTATGCTGCTACCATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCAATCAATGTCTTTTCCATCATGTACACAGGAGCACCAG         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112456 GCAATCAATGTCTTTTCCATCATGTACACAGGAGCACCAGGTA...CAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTCGGCCTTGTTCTCCCCATGTGGGCCATAGCCCTCATTTCCTTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127630 GCTCGGCCTTGTTCTCCCCATGTGGGCCATAGCCCTCATTTCCTTTGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCGCCCTCCTGTTCGCTTTTTTTGTGTGGCTCTTCGTGTGTCCGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127680 TCGCCCTCCTGTTCGCTTTTTTTGTGTGGCTCTTCGTGTGTCCGTGGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CGGAGGAAAATAACAG         GCAAATTACAAAAAGAAGGTGCTTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 127730 CGGAGGAAAATAACAGGTA...TAGGCAAATTACAAAAAGAAGGTGCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATCACGAGTATCTGACGAAAGCCTCAGTAAGGTTCAGGAAGCAGAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132763 ATCACGAGTATCTGACGAAAGCCTCAGTAAGGTTCAGGAAGCAGAGTCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAGTATTTAAAGAGCTACCAGGTGCCAAGGCTAATGATGACAGCACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132813 CAGTATTTAAAGAGCTACCAGGTGCCAAGGCTAATGATGACAGCACCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCGCTCACGGGAGCAGCAGGGGAGACACTGGGGACCTCGGAAGGCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132863 CCGCTCACGGGAGCAGCAGGGGAGACACTGGGGACCTCGGAAGGCACTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGCGAGCAGCCACCCTCGGGCTGCATACG         GAAGAGCACTGT
        |||| ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 132913 TGCGGGCAGCCACCCTCGGGCTGCATACGGTA...CAGGAAGAGCACTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCATGACCCATGGCTCTGTGAAATCGCCCATCTCCAACGGCACCTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134826 CCATGACCCATGGCTCTGTGAAATCGCCCATCTCCAACGGCACCTTCGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 TTCGACGGCCACACCAGGAGCGACGGTCATGTGTACCACACCGTGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134876 TTCGACGGCCACACCAGGAGCGACGGTCATGTGTACCACACCGTGCACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AGACTCGGGGCTCTACAAAGATCTGCTGCACAAAATCCACATCGACAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134926 AGACTCGGGGCTCTACAAAGATCTGCTGCACAAAATCCACATCGACAGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCCCCGAGGAGAAGCCAGCCCAGGAAAGCAACTACCGGCTGCTGCGCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134976 GCCCCGAGGAGAAGCCAGCCCAGGAAAGCAACTACCGGCTGCTGCGCCGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 AACAACAGTTACACCTGCTACACCGCAGCCATTTGTGGGCTGCCAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135026 AACAACAGTTACACCTGCTACACCGCAGCCATTTGTGGGCTGCCAGTGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CGCCACCTTTCGAGCTGCGGACTCATCGGCCCCAGAGGACAGTGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135076 CGCCACCTTTCGAGCTGCGGACTCATCGGCCCCAGAGGACAGTGAGAAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TGGTGGGCGACACCGTGTCCTACTCCAAGAAGAGGCTGCGCTACGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135126 TGGTGGGCGACACCGTGTCCTACTCCAAGAAGAGGCTGCGCTACGACAGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 TACTCGAGCTACTGTAACGCGGTGGCAGAGGCGGAGATCGAGGCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135176 TACTCGAGCTACTGTAACGCGGTGGCAGAGGCGGAGATCGAGGCGGAGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGGCGGCGTGGAGATGAAGCTGGCGTCGGAGCTGGCCGACCCTGACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135226 GGGCGGCGTGGAGATGAAGCTGGCGTCGGAGCTGGCCGACCCTGACCAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 CGCGAGAGGACCCTGCAGAGGAGGAGAAGGAGGAGAAGGACGCACCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135276 CGCGAGAGGACCCTGCAGAGGAGGAGAAGGAGGAGAAGGACGCACCCGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GTTCACCTCCTGTTCCATTTCCTGCAGGTCCTCACCGCCTGTTTCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135326 GTTCACCTCCTGTTCCATTTCCTGCAGGTCCTCACCGCCTGTTTCGGGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CTTTGCTCACGGCGGCAATGACGTGAG         TAATGCCATCGGTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 135376 CTTTGCTCACGGCGGCAATGACGTGAGGTG...CAGTAATGCCATCGGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 CCCTGGTAGCCTTGTGGCTGATTTACAAACAAGGCGGGGTAACGCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142156 CCCTGGTAGCCTTGTGGCTGATTTACAAACAAGGCGGGGTAACGCAAGAA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 GCAGCTACACCCGTCTGGCTGCTGTTTTATGGAGGAGTTGGAATCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142206 GCAGCTACACCCGTCTGGCTGCTGTTTTATGGAGGAGTTGGAATCTGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 AGGCCTCTGGGTCTGGGGGAGAAGAGTGATCCAGACCATGGGGAAGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142256 AGGCCTCTGGGTCTGGGGGAGAAGAGTGATCCAGACCATGGGGAAGGACC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 TCACTCCCATCACGCCGTCCAG         CGGCTTCACGATCGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 142306 TCACTCCCATCACGCCGTCCAGGTA...CAGCGGCTTCACGATCGAGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 GCCTCAGCCTTCACAGTGGTGATCGCCTCCAACATCGGGCTTCCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143568 GCCTCAGCCTTCACAGTGGTGATCGCCTCCAACATCGGGCTTCCAGTCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CACCACGCACTGTAAG         GTGGGCTCGGTGGTGGCCGTGGGCT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 143618 CACCACGCACTGTAAGGTA...CAGGTGGGCTCGGTGGTGGCCGTGGGCT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1820 GGATCCGCTCCCGCAAGGCTGTGGACTGGCGCCTCTTTCGGAACATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154449 GGATCCGCTCCCGCAAGGCTGTGGACTGGCGCCTCTTTCGGAACATCTTC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GTGGCCTGGTTCGTGACCGTCCCTGTGGCTGGGCTGTTCAGCGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154499 GTGGCCTGGTTCGTGACCGTCCCTGTGGCTGGGCTGTTCAGCGCTGCTGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .
   1920 CATGGCTCTTCTCATGTATGGGATCCTTCCATATGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154549 CATGGCTCTTCTCATGTATGGGATCCTTCCATATGTG