seq1 = pF1KB0997.tfa, 819 bp
seq2 = pF1KB0997/gi568815581r_4634609.tfa (gi568815581r:4634609_4839396), 204788 bp

>pF1KB0997 819
>gi568815581r:4634609_4839396 (Chr17)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-275  (100477-100615)   100% ->
276-358  (100907-100989)   100% ->
359-775  (103889-104305)   100% ->
776-819  (104745-104788)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGGGAGTCAGAGCGAGGTGGCTCCATCCCCGCAGAGTCCGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGGGAGTCAGAGCGAGGTGGCTCCATCCCCGCAGAGTCCGCGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGAGATGGGACGGGACTTGCGGCCCGGGTCCCGCGTGCTCCTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGAGATGGGACGGGACTTGCGGCCCGGGTCCCGCGTGCTCCTGCTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCTTCTGCTCCTGCTGGTGTACCTGACTCAGCCAG         GCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 TGCTTCTGCTCCTGCTGGTGTACCTGACTCAGCCAGGTT...CAGGCAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAACGAGGGCAGCGTCACTGGAAGTTGTTATTGTGGTAAAAGAATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100482 GGCAACGAGGGCAGCGTCACTGGAAGTTGTTATTGTGGTAAAAGAATTTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCCGACTCCCCGCCATCGGTTCAGTTCATGAATCGTCTCCGGAAACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100532 TTCCGACTCCCCGCCATCGGTTCAGTTCATGAATCGTCTCCGGAAACACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAGAGCTTACCATCGGTGTCTATACTACACGAG         GTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100582 TGAGAGCTTACCATCGGTGTCTATACTACACGAGGTA...CAGGTTCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTCCTTTCCTGGAGCGTGTGTGGGGGCAACAAGGACCCATGGGTTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100914 CTCCTTTCCTGGAGCGTGTGTGGGGGCAACAAGGACCCATGGGTTCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTGATGAGCTGTCTTGATCTCAAAG         AATGTGGACATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100964 ATTGATGAGCTGTCTTGATCTCAAAGGTG...CAGAATGTGGACATGCTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACTCGGGGATTGTGGCCCACCAGAAGCATTTACTTCCTACCAGCCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103904 ACTCGGGGATTGTGGCCCACCAGAAGCATTTACTTCCTACCAGCCCCCCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTTCTCAGGCCTCAGAGGGGGCATCTTCAGATATCCACACCCCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103954 ATTTCTCAGGCCTCAGAGGGGGCATCTTCAGATATCCACACCCCTGCCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATGCTCCTGTCCACCTTGCAGTCCACTCAGCGCCCCACCCTCCCAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104004 GATGCTCCTGTCCACCTTGCAGTCCACTCAGCGCCCCACCCTCCCAGTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GATCACTGTCCTCGGACAAAGAGCTCACTCGTCCCAATGAAACCACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104054 GATCACTGTCCTCGGACAAAGAGCTCACTCGTCCCAATGAAACCACCATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CACACTGCGGGCCACAGTCTGGCAGCTGGGCCTGAGGCTGGGGAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104104 CACACTGCGGGCCACAGTCTGGCAGCTGGGCCTGAGGCTGGGGAGAACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAAGCAGCCGGAAAAAAATGCTGGTCCCACAGCCAGGACATCAGCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104154 GAAGCAGCCGGAAAAAAATGCTGGTCCCACAGCCAGGACATCAGCCACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TGCCAGTCCTGTGCCTCCTGGCCATCATCTTCATCCTCACCGCAGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104204 TGCCAGTCCTGTGCCTCCTGGCCATCATCTTCATCCTCACCGCAGCCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCCTATGTGCTGTGCAAGAGGAGGAGGGGGCAGTCACCGCAGTCCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104254 TCCTATGTGCTGTGCAAGAGGAGGAGGGGGCAGTCACCGCAGTCCTCTCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AG         ATCTGCCGGTTCATTATATACCTGTGGCACCTGACTCTA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104304 AGGTA...CAGATCTGCCGGTTCATTATATACCTGTGGCACCTGACTCTA

    850     .
    815 ATACC
        |||||
 104784 ATACC