seq1 = pF1KB0993.tfa, 834 bp
seq2 = pF1KB0993/gi568815592f_42829571.tfa (gi568815592f:42829571_43038788), 209218 bp

>pF1KB0993 834
>gi568815592f:42829571_43038788 (Chr6)

1-151  (100001-100151)   100% ->
152-275  (104905-105028)   100% ->
276-372  (106004-106100)   100% ->
373-495  (108147-108269)   100% ->
496-613  (108520-108637)   100% ->
614-834  (108998-109218)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTCAATGCCTGAGCCCGCGTCCCGCTGTCTTCTGCTTCTTCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATTCAATGCCTGAGCCCGCGTCCCGCTGTCTTCTGCTTCTTCCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCGGCCCCGGAGCTGGGCCCGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCCGGCCCCGGAGCTGGGCCCGAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGCCGGAGCTGAGGAGAACGACTGGGTTCGCCTGCCCAGCAAATGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGCCGGAGCTGAGGAGAACGACTGGGTTCGCCTGCCCAGCAAATGCGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 G         TGTGTAAATATGTTGCTGTGGAGCTGAAGTCAGCCTTTGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGTG...CAGTGTGTAAATATGTTGCTGTGGAGCTGAAGTCAGCCTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAAACCGGCAAGACCAAGGAGGTGATTGGCACGGGCTATGGCATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104945 GGAAACCGGCAAGACCAAGGAGGTGATTGGCACGGGCTATGGCATCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCAGAAGGCCTCTGGAGTCAAATACACCAAGTC         GGACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 104995 ACCAGAAGGCCTCTGGAGTCAAATACACCAAGTCGTA...CAGGGACTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGGTTAATCGAAGTCACTGAGACCATTTGCAAGAGGCTCCTGGATTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106011 CGGTTAATCGAAGTCACTGAGACCATTTGCAAGAGGCTCCTGGATTATAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGCACAAGGAGAGGACCGGCAGCAATCGATTTGCCAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 106061 CCTGCACAAGGAGAGGACCGGCAGCAATCGATTTGCCAAGGTT...CAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCATGTCAGAGACCTTTGAGACATTACACAACCTGGTACACAAAGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108148 GCATGTCAGAGACCTTTGAGACATTACACAACCTGGTACACAAAGGGGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AAGGTGGTGATGGACATCCCCTATGAGCTGTGGAACGAGACTTCTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108198 AAGGTGGTGATGGACATCCCCTATGAGCTGTGGAACGAGACTTCTGCAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GGTGGCTGACCTCAAGAAGCAG         TGTGATGTGCTGGTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 108248 GGTGGCTGACCTCAAGAAGCAGGTA...CAGTGTGATGTGCTGGTGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGTTTGAGGAGGTGATCGAGGACTGGTACAGGAACCACCAGGAGGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108539 AGTTTGAGGAGGTGATCGAGGACTGGTACAGGAACCACCAGGAGGAAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGACTGAATTCCTCTGCGCCAACCACGTGCTGAAGGGAAAAGACACCA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 108589 CTGACTGAATTCCTCTGCGCCAACCACGTGCTGAAGGGAAAAGACACCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    614         GTTGCCTGGCAGAGCAGTGGTCCGGCAAGAAGGGAGACACAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108639 TG...TAGGTTGCCTGGCAGAGCAGTGGTCCGGCAAGAAGGGAGACACAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGCCCTGGGAGGGAAGAAGTCCAAGAAGAAGAGCAGCAGGGCCAAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109040 CTGCCCTGGGAGGGAAGAAGTCCAAGAAGAAGAGCAGCAGGGCCAAGGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCAGGCGGCAGGAGTAGCAGCAGCAAACAAAGGAAGGAGCTGGGTGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109090 GCAGGCGGCAGGAGTAGCAGCAGCAAACAAAGGAAGGAGCTGGGTGGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAGGGAGACCCCAGCCCCGAGGAGGATGAGGGCATCCAGAAGGCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109140 TGAGGGAGACCCCAGCCCCGAGGAGGATGAGGGCATCCAGAAGGCATCCC

    850     .    :    .    :    .
    806 CTCTCACACACAGCCCCCCTGATGAGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 109190 CTCTCACACACAGCCCCCCTGATGAGCTC