seq1 = pF1KB0970.tfa, 1293 bp
seq2 = pF1KB0970/gi568815586r_12230030.tfa (gi568815586r:12230030_12443314), 213285 bp

>pF1KB0970 1293
>gi568815586r:12230030_12443314 (Chr12)

(complement)

1-223  (100001-100223)   100% ->
224-364  (104755-104895)   100% ->
365-1293  (112357-113285)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTTCGGGGGAGAAGGGAGCTTGACTTACACTTTGGTAATAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTTCGGGGGAGAAGGGAGCTTGACTTACACTTTGGTAATAATTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCTGACACTAAGGCTGTCTGCTAGTCAGAATTGCCTCAAAAAGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCTGACACTAAGGCTGTCTGCTAGTCAGAATTGCCTCAAAAAGAGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGAAGATGTTGTCATTGACATCCAGTCATCTCTTTCTAAGGGAATCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGAAGATGTTGTCATTGACATCCAGTCATCTCTTTCTAAGGGAATCAGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAATGAGCCCGTATATACTTCAACTCAAGAAGACTGCATTAATTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAATGAGCCCGTATATACTTCAACTCAAGAAGACTGCATTAATTCTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGTTCAACAAAAAACATATCAG         GGGACAAAGCATGTAACT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100201 CTGTTCAACAAAAAACATATCAGGTA...CAGGGGACAAAGCATGTAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGATGATCTTCGACACTCGAAAAACAGCTAGACAACCCAACTGCTACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104773 TGATGATCTTCGACACTCGAAAAACAGCTAGACAACCCAACTGCTACCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTTTTCTGTCCCAACGAGGAAGCCTGTCCATTGAAACCAGCAAAAGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104823 TTTTTCTGTCCCAACGAGGAAGCCTGTCCATTGAAACCAGCAAAAGGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TATGAGTTACAGGATAATTACAG         ATTTTCCATCTTTGACCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 104873 TATGAGTTACAGGATAATTACAGGTA...CAGATTTTCCATCTTTGACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAAATTTGCCAAGCCAAGAGTTACCCCAGGAAGATTCTCTCTTACATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112375 GAAATTTGCCAAGCCAAGAGTTACCCCAGGAAGATTCTCTCTTACATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAATTTTCACAAGCAGTCACTCCCCTAGCCCATCATCACACAGATTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112425 CAATTTTCACAAGCAGTCACTCCCCTAGCCCATCATCACACAGATTATTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAAGCCCACCGATATCTCATGGAGAGACACACTTTCTCAGAAGTTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112475 AAAGCCCACCGATATCTCATGGAGAGACACACTTTCTCAGAAGTTTGGAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTCAGATCACCTGGAGAAACTATTTAAGATGGATGAAGCAAGTGCCCAG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112525 CCTCAGATCACTTGGAGAAACTATTTAAGATGGATGAAGCAAGTGCCCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCCTTGCTTATAAGGAAAAAGGCCATTCTCAGAGTTCACAATTTTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112575 CTCCTTGCTTATAAGGAAAAAGGCCATTCTCAGAGTTCACAATTTTCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGATCAAGAAATAGCTCATCTGCTGCCTGAAAATGTGAGTGCGCTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112625 TGATCAAGAAATAGCTCATCTGCTGCCTGAAAATGTGAGTGCGCTCCCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTACGGTGGCAGTTGCTTCTCCACATACCACCTCGGCTACTCCAAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112675 CTACGGTGGCAGTTGCTTCTCCACATACCACCTCGGCTACTCCAAAGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GCCACCCTTCTACCCACCAATGCTTCAGTGACACCTTCTGGGACTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112725 GCCACCCTTCTACCCACCAATGCTTCAGTGACACCTTCTGGGACTTCCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCCACAGCTGGCCACCACAGCTCCACCTGTAACCACTGTCACTTCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112775 GCCACAGCTGGCCACCACAGCTCCACCTGTAACCACTGTCACTTCTCAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CTCCCACGACCCTCATTTCTACAGTTTTTACACGGGCTGCGGCTACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112825 CTCCCACGACCCTCATTTCTACAGTTTTTACACGGGCTGCGGCTACACTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CAAGCAATGGCTACAACAGCAGTTCTGACTACCACCTTTCAGGCACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112875 CAAGCAATGGCTACAACAGCAGTTCTGACTACCACCTTTCAGGCACCTAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GGACTCGAAAGGCAGCTTAGAAACCATACCGTTTACAGAAATCTCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 112925 GGACTCGAAAGGCAGCTTAGAAACCATACCGTTTACAGAAATCTCCAACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TAACTTTGAACACAGGGAATGTGTATAACCCTACTGCACTTTCTATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112975 TAACTTTGAACACAGGGAATGTGTATAACCCTACTGCACTTTCTATGTCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AATGTGGAGTCTTCCACTATGAATAAAACTGCTTCCTGGGAAGGTAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113025 AATGTGGAGTCTTCCACTATGAATAAAACTGCTTCCTGGGAAGGTAGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GGCCAGTCCAGGCAGTTCCTCCCAGGGCAGTGTTCCAGAAAATCAGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113075 GGCCAGTCCAGGCAGTTCCTCCCAGGGCAGTGTTCCAGAAAATCAGTACG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GCCTTCCATTTGAAAAATGGCTTCTTATCGGGTCCCTGCTCTTTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113125 GCCTTCCATTTGAAAAATGGCTTCTTATCGGGTCCCTGCTCTTTGGTGTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CTGTTCCTGGTGATAGGCCTCGTCCTCCTGGGTAGAATCCTCTCGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113175 CTGTTCCTGGTGATAGGCCTCGTCCTCCTGGGTAGAATCCTCTCGGAATC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 ACTCCGCAGGAAACGTTACTCAAGACTGGATTATTTGATCAATGGGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113225 ACTCCGCAGGAAACGTTACTCAAGACTGGATTATTTGATCAATGGGATCT

   1300     .    :
   1283 ATGTGGACATC
        |||||||||||
 113275 ATGTGGACATC