seq1 = pF1KB0962.tfa, 1275 bp
seq2 = pF1KB0962/gi568815592r_30003539.tfa (gi568815592r:30003539_30212805), 209267 bp

>pF1KB0962 1275
>gi568815592r:30003539_30212805 (Chr6)

(complement)

1-417  (100001-100417)   100% ->
418-513  (101063-101158)   100% ->
514-744  (102128-102358)   100% ->
745-767  (103758-103780)   100% ->
768-883  (104638-104753)   98% ->
884-958  (107564-107638)   100% ->
959-1024  (108639-108704)   100% ->
1025-1275  (109017-109267)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAGTGGGCAGTTTGTGAACAAACTGCAAGAGGAAGTGATCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAGTGGGCAGTTTGTGAACAAACTGCAAGAGGAAGTGATCTGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCTGCCTGGACATTCTGCAGAAACCTGTCACCATCGACTGTGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCTGCCTGGACATTCTGCAGAAACCTGTCACCATCGACTGTGGGCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATTTCTGCCTCAAATGCATCACTCAGATTGGGGAAACATCATGTGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATTTCTGCCTCAAATGCATCACTCAGATTGGGGAAACATCATGTGGATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCAAATGTCCCCTCTGCAAAACTTCCGTAAGGAAGAACGCAATCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCAAATGTCCCCTCTGCAAAACTTCCGTAAGGAAGAACGCAATCAGGTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACTCGCTGTTGCGGAATCTGGTGGAGAAAATCCAAGCTCTACAAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACTCGCTGTTGCGGAATCTGGTGGAGAAAATCCAAGCTCTACAAGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGAGGTGCAGTCCAAAAGGAAAGAGGCTACATGCCCGAGGCACCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGAGGTGCAGTCCAAAAGGAAAGAGGCTACATGCCCGAGGCACCAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTTCCACTATTTCTGCGAGGATGATGGGAAGTTCCTCTGTTTTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTTCCACTATTTCTGCGAGGATGATGGGAAGTTCCTCTGTTTTGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCGTGAATCCAAGGACCACAAATCCCATAATGTCAGCTTGATCGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCGTGAATCCAAGGACCACAAATCCCATAATGTCAGCTTGATCGAAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGCCCAGAATTATCAG         GGGCAGATTCAAGAGCAGATCCAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGCCCAGAATTATCAGGTA...CAGGGGCAGATTCAAGAGCAGATCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTCTTGCAGCAAAAGGAGAAGGAGACAGTACAAGTGAAGGCACAAGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101087 GTCTTGCAGCAAAAGGAGAAGGAGACAGTACAAGTGAAGGCACAAGGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACACAGGGTCGATGTCTTCACG         GACCAGGTAGAACATGAGA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 101137 ACACAGGGTCGATGTCTTCACGGTA...TAGGACCAGGTAGAACATGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCAAAGGATCCTCACAGAATTTGAACTCCTGCATCAAGTCCTAGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102147 AGCAAAGGATCCTCACAGAATTTGAACTCCTGCATCAAGTCCTAGAGGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GAGAAGAATTTCCTGCTATCACGGATTTACTGGCTGGGTCATGAGGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102197 GAGAAGAATTTCCTGCTATCACGGATTTACTGGCTGGGTCATGAGGGAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGAAGCGGGGAAACACTATGTTGCCTCCACTGAGCCACAGTTGAACGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102247 GGAAGCGGGGAAACACTATGTTGCCTCCACTGAGCCACAGTTGAACGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TCAAGAAGCTCGTTGATTCCCTGAAGACCAAGCAGAACATGCCACCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102297 TCAAGAAGCTCGTTGATTCCCTGAAGACCAAGCAGAACATGCCACCCAGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CAGCTGCTGGAG         GATATCAAAGTCGTCTTGTGCAG      
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...
 102347 CAGCTGCTGGAGGTG...TAGGATATCAAAGTCGTCTTGTGCAGGTA...

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    768    AAGTGAAGAGTTTCAGTTTCTCAACCCAACCCCTGTTCCTCTGGAAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104635 TAGAAGTGAAGAGTTTCAGTTTCTCAACCCAACCCCTGTTCCTCTGGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGAGAAAAAACTCAGTGAAGCAAAATCAAGACACGACTCCATCACAGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 104685 TGGAGAAAAAACTCAGTGAAGCAAAATCAAGACATGACTCCATCACAGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCCTGAAAAAATTCAAAG         ACCAACTCCAGGCTGATAGGAA
        ||||| |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 104735 AGCCTAAAAAAATTCAAAGGTA...CAGACCAACTCCAGGCTGATAGGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AAAAGATGAAAACAGATTCTTCAAAAGCATGAATAAAAATGACATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107586 AAAAGATGAAAACAGATTCTTCAAAAGCATGAATAAAAATGACATGAAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GCT         GGGGCTTGTTACAGAAAAATAATCATAAAATGAACAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107636 GCTGTA...TAGGGGGCTTGTTACAGAAAAATAATCATAAAATGAACAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 ACCTCAGAGCCCGGGTCATCTTCTGCAG         GCGGCAGAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 108677 ACCTCAGAGCCCGGGTCATCTTCTGCAGGTA...AAGGCGGCAGAACTAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ATCGGGGCCACCAAATCACCACTCTTCAGCCCCATCCCACTCCCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109030 ATCGGGGCCACCAAATCACCACTCTTCAGCCCCATCCCACTCCCTGTTTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGGCCTCGTCTGCTGGGAAAGTCACTTTTCCAGTATGTCTCCTGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109080 GGGCCTCGTCTGCTGGGAAAGTCACTTTTCCAGTATGTCTCCTGGCCTCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 TATGATGAGATTTCTGGTCAAGGAGCGAGCTCTCAGGATACGAAGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109130 TATGATGAGATTTCTGGTCAAGGAGCGAGCTCTCAGGATACGAAGACATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGACGTTGCGCTGTCCGAGGAGCTCCATGCGGCACTGAGTGAGTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109180 TGACGTTGCGCTGTCCGAGGAGCTCCATGCGGCACTGAGTGAGTGGCTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .
   1238 CAGCGATCCGGGCTTGGTTTTGTGAGGTTCCTTCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109230 CAGCGATCCGGGCTTGGTTTTGTGAGGTTCCTTCAAGC