seq1 = pF1KB0958.tfa, 1260 bp
seq2 = pF1KB0958/gi568815586r_56634147.tfa (gi568815586r:56634147_56852298), 218152 bp

>pF1KB0958 1260
>gi568815586r:56634147_56852298 (Chr12)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-261  (101104-101261)   100% ->
262-368  (105267-105373)   100% ->
369-444  (105445-105522)   96% ->
445-579  (106120-106254)   100% ->
580-638  (108176-108234)   100% ->
639-748  (109203-109312)   100% ->
749-840  (110462-110553)   100% ->
841-982  (110723-110864)   100% ->
983-1052  (112936-113005)   100% ->
1053-1144  (113774-113865)   100% ->
1145-1243  (118054-118152)   100% ->
1244-1260  (120565-120581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGACGTTTGACCCCACCGAGCTGCCCGAGCTGCTTAAACTTTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGACGTTTGACCCCACCGAGCTGCCCGAGCTGCTTAAACTTTATTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGAGGCTCTTTCCCTACTCTCAGTACTATCGCTGGCTCAACTACGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGAGGCTCTTTCCCTACTCTCAGTACTATCGCTGGCTCAACTACGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAG         TGATAAAGAATTACTTTCAACACCGTGAATTTTCATTC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGTG...CAGTGATAAAGAATTACTTTCAACACCGTGAATTTTCATTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACATTGAAAGATGATATTTACATTCGCTACCAATCCTTCAACAACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101142 ACATTGAAAGATGATATTTACATTCGCTACCAATCCTTCAACAACCAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGATCTGGAAAAGGAGATGCAGAAAATGAATCCATACAAGATTGATATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101192 TGATCTGGAAAAGGAGATGCAGAAAATGAATCCATACAAGATTGATATAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGCAGTATATTCTCACAGA         CCCAATCAACACAATACAGTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101242 GCGCAGTATATTCTCACAGAGTA...TAGCCCAATCAACACAATACAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGCTGGGAGCTTTCCAGGCTCAGGAAAAAGAACTGGTATTTGACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105288 AAGCTGGGAGCTTTCCAGGCTCAGGAAAAAGAACTGGTATTTGACATTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATGACAGACTATGACGATGTGAGGAGATGTTGTAG         TTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105338 CATGACAGACTATGACGATGTGAGGAGATGTTGTAGGTG...TAGTTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CAGACATATGTCCTAAGTGCTGGACCCTCATGACAATGGCCATACGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105450 CAGACATATGTCCTAAGTGCTGGACCCTCATGACAATGGCCATACGCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTGACAGAGCATTGAAGG  AG         GACTTTGGATTTAAGCAT
        |||||||||||||||||||--| >>>...>>>||||||||||||||||||
 105500 ATTGACAGAGCATTGAAGGGCAAGTA...GAGGACTTTGGATTTAAGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    463 CGTCTCTGGGTATATTCTGGAAGGAGAGGTGTTCATTGTTGGGTCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106138 CGTCTCTGGGTATATTCTGGAAGGAGAGGTGTTCATTGTTGGGTCTGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    513 TGAATCAGTTAGAAAACTGTCTTCTGCAGTACGTTCTGGGATAGTTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106188 TGAATCAGTTAGAAAACTGTCTTCTGCAGTACGTTCTGGGATAGTTGAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    563 ATTTGAGCCTTGTAAAG         GGTGGTCAAGACGTTAAAAAGAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 106238 ATTTGAGCCTTGTAAAGGTA...CAGGGTGGTCAAGACGTTAAAAAGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    604 GTTCACCTAAGTGAAAAAATTCACCCTTTTATCAG         AAAATC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 108200 GTTCACCTAAGTGAAAAAATTCACCCTTTTATCAGGTC...CAGAAAATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    645 TATAAACATAATAAAAAAATACTTTGAAGAATATGCCTTGGTTAATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109209 TATAAACATAATAAAAAAATACTTTGAAGAATATGCCTTGGTTAATCAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    695 ATATTCTCGAAAATAAAGAAAGCTGGGATAAGATTTTAGCCCTTGTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109259 ATATTCTCGAAAATAAAGAAAGCTGGGATAAGATTTTAGCCCTTGTTCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    745 GAAA         CAATTCATGATGAACTTCAACAAAGCTTCCAAAAGTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109309 GAAAATA...CACCAATTCATGATGAACTTCAACAAAGCTTCCAAAAGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    786 TCACAATTCACTTCAGCGTTGGGAGCACTTGAAGAAAGTAGCCAGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110499 TCACAATTCACTTCAGCGTTGGGAGCACTTGAAGAAAGTAGCCAGCAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    836 ATCAG         AATAACATCAAAAATGACAAATATGGACCCTGGCTG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110549 ATCAGGTA...TAGAATAACATCAAAAATGACAAATATGGACCCTGGCTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    877 GAGTGGGAGATTATGCTCCAGTACTGTTTTCCACGGCTGGATATCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110759 GAGTGGGAGATTATGCTCCAGTACTGTTTTCCACGGCTGGATATCAATGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    927 CAGCAAAGGAATCAATCATCTACTGAAGAGCCCTTTTAGTGTTCATCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110809 CAGCAAAGGAATCAATCATCTACTGAAGAGCCCTTTTAGTGTTCATCCTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    977 AAACAG         GTCGCATATCTGTGCCTATTGATTTGCAGAAAGTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110859 AAACAGGTA...CAGGTCGCATATCTGTGCCTATTGATTTGCAGAAAGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1018 GACCAGTTTGATCCATTTACTGTTCCGACCATAAG         CTTCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 112971 GACCAGTTTGATCCATTTACTGTTCCGACCATAAGGTA...CAGCTTCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1059 CTGCCGTGAATTGGATGCCATTTCCACTAATGAAGAGGAAAAAGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113780 CTGCCGTGAATTGGATGCCATTTCCACTAATGAAGAGGAAAAAGAGGAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1109 ATGAAGCTGAATCTGATGTCAAACATAGAACCAGAG         ATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 113830 ATGAAGCTGAATCTGATGTCAAACATAGAACCAGAGGTA...TAGATTAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1150 AAGAAGACCAGTCTAGCACCTTATGTGAAAGTTTTTGAACATTTTCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118059 AAGAAGACCAGTCTAGCACCTTATGTGAAAGTTTTTGAACATTTTCTTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1200 AAATCTGGATAAATCCCGAAAAGGAGAACTTCTTAAGAAGAGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 118109 AAATCTGGATAAATCCCGAAAAGGAGAACTTCTTAAGAAGAGTGGTA...

   1350     .    :    .    :
   1244    ATTTACAAAAAGATTTC
        >>>|||||||||||||||||
 120562 TAGATTTACAAAAAGATTTC