seq1 = pF1KB0953.tfa, 552 bp
seq2 = pF1KB0953/gi568815587f_64914208.tfa (gi568815587f:64914208_65121852), 207645 bp

>pF1KB0953 552
>gi568815587f:64914208_65121852 (Chr11)

1-65  (100001-100065)   100% ->
66-176  (104157-104267)   100% ->
177-339  (104364-104526)   100% ->
340-420  (106212-106292)   100% ->
421-552  (107514-107645)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGCTCCTGACCATTCTGAAGAAGATGAAGCAGAAAGAGCGGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGCTCCTGACCATTCTGAAGAAGATGAAGCAGAAAGAGCGGGAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGACTGCTCATGCT         TGGCCTGGACAATGCTGGAAAGACAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGACTGCTCATGCTGTA...CAGTGGCCTGGACAATGCTGGAAAGACAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATCCTGAAGAAGTTCAATGGGGAGGACATCGACACCATCTCCCCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104183 CCATCCTGAAGAAGTTCAATGGGGAGGACATCGACACCATCTCCCCAACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGGCTTCAACATCAAGACCCTGGAGCACCGAGG         ATTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104233 CTGGGCTTCAACATCAAGACCCTGGAGCACCGAGGGTG...CAGATTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGAACATCTGGGATGTGGGTGGCCAGAAGTCCCTGCGGTCCTACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104370 GCTGAACATCTGGGATGTGGGTGGCCAGAAGTCCCTGCGGTCCTACTGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAACTACTTTGAGAGCACCGATGGCCTCATCTGGGTAGTGGACAGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104420 GGAACTACTTTGAGAGCACCGATGGCCTCATCTGGGTAGTGGACAGCGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACCGCCAGCGCATGCAGGACTGCCAGCGGGAGCTCCAGAGCCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104470 GACCGCCAGCGCATGCAGGACTGCCAGCGGGAGCTCCAGAGCCTGCTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGGAG         CGCCTGGCCGGAGCAACCCTCCTCATCTTTGCTA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104520 GGAGGAGGTG...CAGCGCCTGGCCGGAGCAACCCTCCTCATCTTTGCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAAGCAGGACCTGCCTGGAGCACTGTCCTCTAACGCCATCCGCGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 106246 ATAAGCAGGACCTGCCTGGAGCACTGTCCTCTAACGCCATCCGCGAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    421       GTCCTGGAGCTGGACTCCATCCGCAGCCACCACTGGTGCATCCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106296 ...CAGGTCCTGGAGCTGGACTCCATCCGCAGCCACCACTGGTGCATCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGCTGCAGCGCCGTCACCGGGGAGAACCTGCTGCCGGGCATCGACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107558 GGGCTGCAGCGCCGTCACCGGGGAGAACCTGCTGCCGGGCATCGACTGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .
    515 TCCTGGATGACATTTCCAGCCGCATTTTCACAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107608 TCCTGGATGACATTTCCAGCCGCATTTTCACAGCTGAC