seq1 = pF1KB0943.tfa, 510 bp
seq2 = pF1KB0943/gi568815591f_78251903.tfa (gi568815591f:78251903_78458611), 206709 bp

>pF1KB0943 510
>gi568815591f:78251903_78458611 (Chr7)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-174  (100953-101071)   100% ->
175-510  (106374-106709)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACTCAGTCTCTGTAGTCATGATGCTCACATCCAAGCCCCTGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACTCAGTCTCTGTAGTCATGATGCTCACATCCAAGCCCCTGCACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTAG         GAAGATTCATCACTAAGCCATTACTCTTCACTAATT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTAGGTA...AAGGAAGATTCATCACTAAGCCATTACTCTTCACTAATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCATGGAAAACTTCGAACTAACTCCTAGCAGACATGGCCGTGTGCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100989 CCATGGAAAACTTCGAACTAACTCCTAGCAGACATGGCCGTGTGCACCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAATCATGTCATGAAGCACCCAGGACCTACAAG         GTGGCTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 101039 CAATCATGTCATGAAGCACCCAGGACCTACAAGGTA...CAGGTGGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAAGACAGCAGAAAGACAGAACCTGGTGCTCAGTGGCCAAGGCCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106382 TGAAGACAGCAGAAAGACAGAACCTGGTGCTCAGTGGCCAAGGCCATCTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGGGCCACCCGGCAGCCATCTTGGCCAAGTGGGCTCTGCTGGGAAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
 106432 GTGGGCCACCCGGCAGCCATCTTGGCCAAGTGGGTTCTGCTGGGAAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTGGTGGTCGAGCACCACGAGGGCATCAACATTTCTGGCAATTTCTGGA
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106482 ACTGGTGGTTGAGCACCACGAGGGCATCAACATTTCTGGCAATTTCTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GAAACAAATTAAAGTATCTGGCCTTCCTCTACAAGCAGATGAGCACCAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 106532 GAAACAAATTAAAGTATCTGGCCTTCCTCTGCAAGCAGATGAGCACCAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTTCCCAAGGCCCGCCCGCCCCGCCATTCCTGGGCCCCCAGCGCATCTT
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106582 CCTTCCCAAGGCCCACCCGCCCCGCCATTCCTGGGCCCCCAGCGCATCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTGGTGGCCTTGCAGAACCAAGTGGGGCCAGGCTGCCCTGGACCACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106632 TTGGTGGCCTTGCAGAACCAAGTGGGGCCAGGCTGCCCTGGACCACCTTA

    500     .    :    .    :    .
    483 TGGTGTTTTATGGGATCTCACTGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 106682 TGGTGTTTTATGGGATCTCACTGCCCTA