seq1 = pF1KB0939.tfa, 480 bp
seq2 = pF1KB0939/gi568815592r_32091369.tfa (gi568815592r:32091369_32292513), 201145 bp

>pF1KB0939 480
>gi568815592r:32091369_32292513 (Chr6)

(complement)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-145  (100264-100366)   100% ->
146-345  (100606-100805)   100% ->
346-480  (101011-101145)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCTGAGAGACCCCAGGAAGAAGAGGATGGTGAGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGGAGGCTGAGAGACCCCAGGAAGAAGAGGATGGTGAGCAGGTG...CA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  GGCCCCCCTCAGGATGAGGAAGGCTGGCCCCCTCCAAACTCCACCACTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100263 GGGCCCCCCTCAGGATGAGGAAGGCTGGCCCCCTCCAAACTCCACCACTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGCCTTGGCGATCTGCTCCTCCATCCCCTCCTCCTCCAGGGACCCGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100313 GGCCTTGGCGATCTGCTCCTCCATCCCCTCCTCCTCCAGGGACCCGCCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACAG         CCCTGGGACCCCGCTCGGCCTCCCTGCTCTCCCTGCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100363 ACAGGTA...CAGCCCTGGGACCCCGCTCGGCCTCCCTGCTCTCCCTGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GACTGAACTCCTTCTGGACCTGGTGGCTGAAGCCCAGTCCCGCCGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100643 GACTGAACTCCTTCTGGACCTGGTGGCTGAAGCCCAGTCCCGCCGCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGAGCAGAGGGCCACCTTCTACACCCCCCAAAACCCCTCAAGCCTAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100693 AGGAGCAGAGGGCCACCTTCTACACCCCCCAAAACCCCTCAAGCCTAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCTGCCCCACTCCGTCCTCTCGAGGACAGAGAACAGCTTTACAGCACTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100743 CCTGCCCCACTCCGTCCTCTCGAGGACAGAGAACAGCTTTACAGCACTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTCAGTCACCAG         TGCCAGCGGATGGAAGCCCAGCGGTCAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100793 CCTCAGTCACCAGGTA...CAGTGCCAGCGGATGGAAGCCCAGCGGTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGCCTCCCCTCCCTCCAGGGGGGCAAGAGCTCCTGGAGTTGCTGCTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101039 AGCCTCCCCTCCCTCCAGGGGGGCAAGAGCTCCTGGAGTTGCTGCTGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GTTCAGGGTGGGGGTCGAATGGAGGAGCAAAGGTCCCGGCCCCCCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101089 GTTCAGGGTGGGGGTCGAATGGAGGAGCAAAGGTCCCGGCCCCCCACACA

    500     .
    474 CACCTGC
        |||||||
 101139 CACCTGC