seq1 = pF1KB0937.tfa, 480 bp
seq2 = pF1KB0937/gi568815596f_238748216.tfa (gi568815596f:238748216_238948695), 200480 bp

>pF1KB0937 480
>gi568815596f:238748216_238948695 (Chr2)

1-480  (100001-100480)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGGGCTCCAGCTCGCCCGTGTCCCCCGTGGACAGCCTGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGGGCTCCAGCTCGCCCGTGTCCCCCGTGGACAGCCTGGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCGAGGAGGAGCTCGAGAGGCAGCCCAAGCGCTTCGGCCGGAAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCGAGGAGGAGCTCGAGAGGCAGCCCAAGCGCTTCGGCCGGAAGCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTACAGCAAGAAGTCGAGCGAAGATGGCAGCCCGACCCCGGGCAAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTACAGCAAGAAGTCGAGCGAAGATGGCAGCCCGACCCCGGGCAAGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCAAGAAGGGCAGCCCCAGCGCGCAGTCCTTCGAGGAGCTGCAGAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCAAGAAGGGCAGCCCCAGCGCGCAGTCCTTCGAGGAGCTGCAGAGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCATCCTGGCCAACGTGCGCGAGCGCCAGCGCACCCAGTCGCTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCATCCTGGCCAACGTGCGCGAGCGCCAGCGCACCCAGTCGCTCAACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGCCTTCGCGGCGCTGCGCAAGATCATCCCCACGCTGCCCTCTGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGCCTTCGCGGCGCTGCGCAAGATCATCCCCACGCTGCCCTCTGACAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGAGCAAGATCCAGACGCTCAAGCTGGCCGCCAGGTACATAGACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGAGCAAGATCCAGACGCTCAAGCTGGCCGCCAGGTACATAGACTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTACCAGGTCCTGCAGAGCGACGAGATGGACAATAAGATGACCAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTACCAGGTCCTGCAGAGCGACGAGATGGACAATAAGATGACCAGCTGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTACGTGGCCCACGAGCGCCTCAGCTACGCCTTCTCCGTGTGGCGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCTACGTGGCCCACGAGCGCCTCAGCTACGCCTTCTCCGTGTGGCGCATG

    450     .    :    .    :    .    :
    451 GAGGGCGCGTGGTCCATGTCCGCCTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGGGCGCGTGGTCCATGTCCGCCTCCCAC