seq1 = pF1KB0929.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KB0929/gi568815597f_225964352.tfa (gi568815597f:225964352_226171476), 207125 bp

>pF1KB0929 408
>gi568815597f:225964352_226171476 (Chr1)

1-128  (100001-100128)   100% ->
129-282  (101305-101458)   100% ->
283-408  (107000-107125)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAG         GCCTGGTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGTA...AAGGCCTGGTACTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGCTCCGTGAAATTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101318 GCGCTCCGTGAAATTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAACTTCCCTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101368 CAAACTTCCCTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGATCTGCGCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101418 CAGATCTGCGCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGTA...CAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGCAAGTGAGGCCTATCTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107000 GAGGCAAGTGAGGCCTATCTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGCTATCCATGCCAAACGTGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107050 TGCTATCCATGCCAAACGTGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAG

    400     .    :    .    :    .
    383 CACGCCGCATACGTGGAGAACGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||
 107100 CACGCCGCATACGTGGAGAACGTGCT