seq1 = pF1KB0929.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KB0929/gi568815594r_139598147.tfa (gi568815594r:139598147_139798554), 200408 bp

>pF1KB0929 408
>gi568815594r:139598147_139798554 (Chr4)

(complement)

1-408  (100001-100408)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAATTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCGCAAACTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100151 GAAATTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGGTTCGCAAACTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAACAGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAACAGATCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAGCACGCCGCATACGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||
 100351 TGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAGCACACAGCATACGTGGAG

    400     .
    401 AACGTGCT
        ||||||||
 100401 AACGTGCT