seq1 = pF1KB0929.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KB0929/gi568815594f_112464988.tfa (gi568815594f:112464988_112665395), 200408 bp

>pF1KB0929 408
>gi568815594f:112464988_112665395 (Chr4)

1-408  (100001-100408)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC
        ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||
 100001 ATGGCTCGTACAAGGCAGACTGCCCACAAATCAACCGGTGGTAAACCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 100051 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGTGCCCTCTACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAATTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCGCAAACTTCC
        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 100151 GAAATTAGATGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCGCTAACTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAACAGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAACAGATCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAGCACGCCGCATACGTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||
 100351 TGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAGCATGCCACATACGTTGAG

    400     .
    401 AACGTGCT
        || |||||
 100401 AATGTGCT