seq1 = pF1KB0929.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KB0929/gi568815575f_123414472.tfa (gi568815575f:123414472_123614874), 200403 bp

>pF1KB0929 408
>gi568815575f:123414472_123614874 (ChrX)

1-408  (99999-100403)   97%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGTACAAAGCAGACTGCCCGCAAATCGACCGGTGGTAAAGCACC
        | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||-|||||||
  99999 ACGGCTCCTACAAAGCGGACTGCCCGCAAACCGACCAGTGGT AAGCACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100048 CAGGAAGCAACTGGCTACAAAAGCCGCTCGCAAGAGTGCGCCCTCTACTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100098 GAGGGGTGAAGAAACCTCATCGTTACAGGCCTGGTACTGTGGCGCTCCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAATTAGACGTTATCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCGCAAACTTCC
        |||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100148 GAAATTAGACG T TCAGAAGTCCACTGAACTTCTGATTCGCAAACTTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAACAGATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100196 CTTCCAGCGTCTGGTGCGAGAAATTGCTCAGGACTTTAAAACAGATCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100246 GCTTCCAGAGCGCAGCTATCGGTGCTTTGCAGGAGGCAAGTGAGGCCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100296 CTGGTTGGCCTTTTTGAAGACACCAACCTGTGTGCTATCCATGCCAAACG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTAACAATTATGCCAAAAGACATCCAGCTAGCACGCCGCATACGTGGAG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100346 TGTAACAATTACGCCAAAAGACATCCAGCTAGCACGCCGCATACGTGGAG

    400     .
    401 AACGTGCT
        ||||||||
 100396 AACGTGCT