seq1 = pF1KB0921.tfa, 363 bp
seq2 = pF1KB0921/gi568815582r_69020428.tfa (gi568815582r:69020428_69221173), 200746 bp

>pF1KB0921 363
>gi568815582r:69020428_69221173 (Chr16)

(complement)

1-23  (99716-99738)   100% ->
24-141  (100004-100121)   100% ->
142-363  (100525-100746)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGCAAATTGTTATTTCCAG         TGCGAGGGCTGGAGGCCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
  99716 ATGGTGCAAATTGTTATTTCCAGGTA...CAGTGCGAGGGCTGGAGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GGCAGAATGGGTGCTGATGGAGCTACAGGGGGAGATCGAGGCTCGCTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100022 GGCAGAATGGGTGCTGATGGAGCTACAGGGGGAGATCGAGGCTCGCTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCACTGGATTAGCTGGAAACCTCCTGGGAGACCTACATTACACCACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100072 GCACTGGATTAGCTGGAAACCTCCTGGGAGACCTACATTACACCACTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          GGAATCCCTGTGCTGATCGTGGGGCATCATATCCTGTATGG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100122 GTG...AAGGGAATCCCTGTGCTGATCGTGGGGCATCATATCCTGTATGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAAAATCATCCACCTGGAGAAACCTTTTGCAGTCCTTGTCAAACACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100566 GAAAATCATCCACCTGGAGAAACCTTTTGCAGTCCTTGTCAAACACACTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGGGATCAGGACTGTGATGAGCTTGGCCGCGAGACTGGCACCCGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100616 CTGGGGATCAGGACTGTGATGAGCTTGGCCGCGAGACTGGCACCCGGTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTGACAGCACTCATCAAAGACAAGATCCTTTTCAAAACCCGCCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100666 CTGGTGACAGCACTCATCAAAGACAAGATCCTTTTCAAAACCCGCCCCAA

    350     .    :    .    :    .    :
    333 GCCCATTATCACCAGCGTCCCCAAGAAAGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 100716 GCCCATTATCACCAGCGTCCCCAAGAAAGTA