seq1 = pF1KB0916.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KB0916/gi568815593r_93640580.tfa (gi568815593r:93640580_93841563), 200984 bp

>pF1KB0916 984
>gi568815593r:93640580_93841563 (Chr5)

(complement)

1-984  (100001-100984)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGGACACAGGCCCTCAAACCACTTCTGCCCCCTTCCAGGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGGACACAGGCCCTCAAACCACTTCTGCCCCCTTCCAGGCAGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGGGGCGGCCCCAGAGGGCCGATGCCCCTGCGGGTTGACACTCTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGGGGCGGCCCCAGAGGGCCGATGCCCCTGCGGGTTGACACTCTGACCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTTGAGCACCCAGGCGGCCCCTGGCAGGGTGATGGTCTGGCCGGCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTTGAGCACCCAGGCGGCCCCTGGCAGGGTGATGGTCTGGCCGGCAGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGCCAGGGATCTGCCCAGGCCCTGACGTGTGGAGGATTCCCCTGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGCCAGGGATCTGCCCAGGCCCTGACGTGTGGAGGATTCCCCTGGGTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGCCACACGAATTCCGGGGCTGGATAGCACCCTGCAGGCCCCGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGCCACACGAATTCCGGGGCTGGATAGCACCCTGCAGGCCCCGTCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GAGCTAGTGAGGCAGGGGACTGGTTGCGACGCCCCTCCGAAGGCGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GAGCTAGTGAGGCAGGGGACTGGTTGCGACGCCCCTCCGAAGGCGCCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGGGCCCTACATTGCCCTGCGGAGCATTCCGAAGTTGCCGCCGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGGGCCCTACATTGCCCTGCGGAGCATTCCGAAGTTGCCGCCGCCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGACATCTCGGGCATACTGAAAGAGTTGCAGCAATTGGCCAAGGAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGACATCTCGGGCATACTGAAAGAGTTGCAGCAATTGGCCAAGGAGTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCAGAAGAGGTTGAGCCTAGGGTACTCGCAGGCCGATGTGGGGATCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCAGAAGAGGTTGAGCCTAGGGTACTCGCAGGCCGATGTGGGGATCGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGGGAGCTCTGTTTGGGAAGGTGCTTAGCCAGACGACCATCTGCCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGGGAGCTCTGTTTGGGAAGGTGCTTAGCCAGACGACCATCTGCCGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGAGGCCCAGCAGCTAAGCGTCGCCAACATGTGGAAGCTGCGACCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGAGGCCCAGCAGCTAAGCGTCGCCAACATGTGGAAGCTGCGACCACTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAAAAGTGGCTGAAGGAAGTGGAAGCAGAGAACCTTCTGGGCTTATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAAAAAGTGGCTGAAGGAAGTGGAAGCAGAGAACCTTCTGGGCTTATGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAAATGGAGATGATCCTGCAACAGTCTGGGAAGTGGAGACGGGCAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAAATGGAGATGATCCTGCAACAGTCTGGGAAGTGGAGACGGGCAAGCAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAGCGACGAATCGGAAACAGCCTGGAGAAATTCTTCCAGCGGTGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAGCGACGAATCGGAAACAGCCTGGAGAAATTCTTCCAGCGGTGCCCTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCCCACACCCCAGCAAATCAGCCACATTGCTGGGTGCCTCCAGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCCCACACCCCAGCAAATCAGCCACATTGCTGGGTGCCTCCAGCTGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGGATGTGGTTCGAGTTTGGTTCTATAACCGCAGCAAGATGGGCAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGGATGTGGTTCGAGTTTGGTTCTATAACCGCAGCAAGATGGGCAGTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ACCAACCAATGATGCTTCCCCACGGGAGATTGTGGGGACAGCCGGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ACCAACCAATGATGCTTCCCCACGGGAGATTGTGGGGACAGCCGGGCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTTGCCCAGGAGCACCAGTGTGCTTTCACCTGGGACTGGGGCTCCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTTGCCCAGGAGCACCAGTGTGCTTTCACCTGGGACTGGGGCTCCCAGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GATATCCCCCACTATACACGTCTCTACTCTGCAGGGGTAGCCCACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GATATCCCCCACTATACACGTCTCTACTCTGCAGGGGTAGCCCACTCCTC

    950     .    :    .    :    .    :
    951 TGCCCCAGCCACCACTCTGGGCCTCCTCAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCCCCAGCCACCACTCTGGGCCTCCTCAGATTT