seq1 = pF1KB0908.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KB0908/gi568815593r_80251024.tfa (gi568815593r:80251024_80451956), 200933 bp

>pF1KB0908 933
>gi568815593r:80251024_80451956 (Chr5)

(complement)

1-933  (100001-100933)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGTGATAAATGTCAGTGTGAACCTGGAGGCCTTTTCCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACGTGATAAATGTCAGTGTGAACCTGGAGGCCTTTTCCCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTAGTGCCATCCAGGCGCTGCGCTCCAGCGTGAGCAGGGTGTTCGACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100051 CATTAGTGCCATCCAGGCGCTGCGCTCCAGCGTGAGCAGGTTGTTCGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGAAGGATGGGATGCGGAACAAGGAGACGCTGGAGGGCCGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGAAGGATGGGATGCGGAACAAGGAGACGCTGGAGGGCCGGGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTTTATTGCGCACTTCCAGGACAACTTACATTCGGTCAACCGGGACCT
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTTCATTGCGCACTTCCAGGACAACTTACATTCGGTCAACCGGGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAATGAGCTGGAACGTCTGAGCAATCTGGTAGGCAAGCCATCTGAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAATGAGCTGGAACGTCTGAGCAATCTGGTAGGCAAGCCATCTGAGAACC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCCTCTTCATAACAGTGGGCTGTTAAGCCTGGATCCTGTGCAGGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCCTCTTCATAACAGTGGGCTGTTAAGCCTGGATCCTGTGCAGGACAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTCCTCTCTATAGTCAACTCCTTCAAGCATATAAGTGGTCAAACAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTCCTCTCTATAGTCAACTCCTTCAAGCATATAAGTGGTCAAACAAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCAGTACCATGCAGGACTAGCATCTGGCCTTTTAAATCAGCAGTCATTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||
 100351 GCAGTACCATGCAGGACTAGCATCTGGCCTTTTAAATCAGTAGTCGTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCGTTCCGCTAATCAGATGGGAGTATCTGCCAAACGTAGACCAAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100401 AGCGTTCCGCTAATCAGATGGGAGTATCTGCCAAAAGTAGACCAAAGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCCCACAACTCTTGTCCTACCACCTCAATATGTTGATGATGTGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCCCACAACTCTTGTCCTACCACCTCAATATGTTGATGATGTGATCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGCATTGACAGGATGTTTCCTGAAATGTCCATCCACTTATCCAGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGCATTGACAGGATGTTTCCTGAAATGTCCATCCACTTATCCAGACCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATGGAACATCAGCAATGCTTCTGGTGACCTTGGGAAAGGTGTTGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATGGAACATCAGCAATGCTTCTGGTGACCTTGGGAAAGGTGTTGAAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCGTCGTCATGCGGAGCCTGTTCATTGATCGAACAATAGTAAAGGGATA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATCGTCATCATGCGGAGCCTGTTCATTGATCGAACAATAGTAAAGGGATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TAACGAGAATGTCTACACAGAAGATGGCAAGCTTGATATATGGTCCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TAACGAGAATGTCTACACAGAAGATGGCAAGCTTGATATATGGTCCAAAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCAACTATCAAGTATTCCAGAAGGTGACAGACCATGCCACCACTGCCCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
 100701 CCAACTATCAAGTATTCCAGAAGGTGACAGACCACGCCACCACGGCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCCACTATCAGCTGCCCCAGATGCCGGATGTCGTGGTCCGATCCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100751 CTCCACTATCAGCTGCCCCAGATGCCGGATGTCGTAGTCCGATCCTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GACCTGGTTAAGAAGTTACATAAAGCTGTTCCAGGCCCCGTGCCAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||
 100801 GACCTGGTTAAGAAGTTACATAAAGCTGTTCCAGGCCCCATGCCAGCACT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCGGGAAGTTTCTGCAGGACGGCCTTCCCCCGACATGGAGGGATTTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCGGGAAGTTTCTGCAGGACGGCCTTCCCCCGACATGGAGGGATTTCCGA

    900     .    :    .    :    .    :
    901 ACCCTCGAAGCCTTCCATGACACCTGCCGGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ACCCTCGAAGCCTTCCATGACACCTGCCGGCAG