seq1 = pF1KB0908.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KB0908/gi568815589r_131760541.tfa (gi568815589r:131760541_132179844), 419304 bp

>pF1KB0908 933
>gi568815589r:131760541_132179844 (Chr9)

(complement)

1-203  (100001-100203)   100% ->
204-348  (102259-102403)   100% ->
349-479  (165378-165508)   100% ->
480-573  (240371-240464)   100% ->
574-681  (285853-285960)   100% ->
682-723  (295746-295787)   100% ->
724-801  (316705-316782)   100% ->
802-933  (319173-319304)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGACGTGATAAATGTCAGTGTGAACCTGGAGGCCTTTTCCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGACGTGATAAATGTCAGTGTGAACCTGGAGGCCTTTTCCCAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTAGTGCCATCCAGGCGCTGCGCTCCAGCGTGAGCAGGGTGTTCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTAGTGCCATCCAGGCGCTGCGCTCCAGCGTGAGCAGGGTGTTCGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTGAAGGATGGGATGCGGAACAAGGAGACGCTGGAGGGCCGGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTGAAGGATGGGATGCGGAACAAGGAGACGCTGGAGGGCCGGGAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTTTATTGCGCACTTCCAGGACAACTTACATTCGGTCAACCGGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTTTATTGCGCACTTCCAGGACAACTTACATTCGGTCAACCGGGACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAA         TGAGCTGGAACGTCTGAGCAATCTGGTAGGCAAGCCAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAAGTA...CAGTGAGCTGGAACGTCTGAGCAATCTGGTAGGCAAGCCAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGAGAACCATCCTCTTCATAACAGTGGGCTGTTAAGCCTGGATCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102297 CTGAGAACCATCCTCTTCATAACAGTGGGCTGTTAAGCCTGGATCCTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGGACAAAACTCCTCTCTATAGTCAACTCCTTCAAGCATATAAGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102347 CAGGACAAAACTCCTCTCTATAGTCAACTCCTTCAAGCATATAAGTGGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAACAAG         TTGCAGTACCATGCAGGACTAGCATCTGGCCTTT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102397 AAACAAGGTA...CAGTTGCAGTACCATGCAGGACTAGCATCTGGCCTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TAAATCAGCAGTCATTGAAGCGTTCCGCTAATCAGATGGGAGTATCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165412 TAAATCAGCAGTCATTGAAGCGTTCCGCTAATCAGATGGGAGTATCTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAACGTAGACCAAAGGCTCAGCCCACAACTCTTGTCCTACCACCTCA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 165462 AAACGTAGACCAAAGGCTCAGCCCACAACTCTTGTCCTACCACCTCAGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    480       ATATGTTGATGATGTGATCAGCCGCATTGACAGGATGTTTCCTG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165512 ...TAGATATGTTGATGATGTGATCAGCCGCATTGACAGGATGTTTCCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAATGTCCATCCACTTATCCAGACCCAATGGAACATCAGCAATGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240415 AAATGTCCATCCACTTATCCAGACCCAATGGAACATCAGCAATGCTTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574          GTGACCTTGGGAAAGGTGTTGAAAGTGATCGTCGTCATGCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 240465 GTA...CAGGTGACCTTGGGAAAGGTGTTGAAAGTGATCGTCGTCATGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAGCCTGTTCATTGATCGAACAATAGTAAAGGGATATAACGAGAATGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 285894 GAGCCTGTTCATTGATCGAACAATAGTAAAGGGATATAACGAGAATGTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACACAGAAGATGGCAAG         CTTGATATATGGTCCAAATCCAAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 285944 ACACAGAAGATGGCAAGGTA...CAGCTTGATATATGGTCCAAATCCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATCAAGTATTCCAGAAG         GTGACAGACCATGCCACCACTGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 295770 TATCAAGTATTCCAGAAGGTA...CAGGTGACAGACCATGCCACCACTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CCTGCTCCACTATCAGCTGCCCCAGATGCCGGATGTCGTGGTCCGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316728 CCTGCTCCACTATCAGCTGCCCCAGATGCCGGATGTCGTGGTCCGATCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TCATG         ACCTGGTTAAGAAGTTACATAAAGCTGTTCCAGGCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 316778 TCATGGTA...TAGACCTGGTTAAGAAGTTACATAAAGCTGTTCCAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCGTGCCAGCGCTGCGGGAAGTTTCTGCAGGACGGCCTTCCCCCGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 319209 CCGTGCCAGCGCTGCGGGAAGTTTCTGCAGGACGGCCTTCCCCCGACATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    888 GAGGGATTTCCGAACCCTCGAAGCCTTCCATGACACCTGCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 319259 GAGGGATTTCCGAACCCTCGAAGCCTTCCATGACACCTGCCGGCAG