seq1 = pF1KB0426.tfa, 2535 bp
seq2 = pF1KB0426/gi568815579f_6672808.tfa (gi568815579f:6672808_6957104), 284297 bp

>pF1KB0426 2535
>gi568815579f:6672808_6957104 (Chr19)

1-204  (100001-100204)   100% ->
205-321  (147895-148011)   100% ->
322-380  (148815-148873)   100% ->
381-449  (148984-149052)   100% ->
450-558  (149414-149522)   100% ->
559-654  (149612-149707)   100% ->
655-723  (152246-152314)   100% ->
724-827  (152496-152599)   100% ->
828-927  (153805-153904)   100% ->
928-1023  (155269-155364)   100% ->
1024-1092  (155612-155680)   100% ->
1093-1179  (155815-155901)   100% ->
1180-1265  (156008-156093)   100% ->
1266-1398  (156979-157111)   100% ->
1399-1508  (159284-159393)   100% ->
1509-1610  (160377-160478)   100% ->
1611-1708  (160721-160818)   100% ->
1709-1731  (160904-160926)   100% ->
1732-1777  (161101-161146)   100% ->
1778-1914  (163625-163761)   100% ->
1915-1980  (164178-164243)   100% ->
1981-2012  (170328-170359)   100% ->
2013-2129  (175191-175307)   100% ->
2130-2217  (177863-177950)   100% ->
2218-2332  (180158-180272)   100% ->
2333-2484  (181140-181291)   100% ->
2485-2535  (184247-184297)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGTGGCGCCAATGCACCCACTGGCTCATCCAGTGCCGGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGTGGCGCCAATGCACCCACTGGCTCATCCAGTGCCGGGTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGCCCAGCCACCGCGTGACCTGGGATGGGGCTCAGGTGTGTGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGCCCAGCCACCGCGTGACCTGGGATGGGGCTCAGGTGTGTGAACTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCAGGCCCTCCGGGATGGTGTCCTTCTGTGTCAGCTGCTTAACAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCAGGCCCTCCGGGATGGTGTCCTTCTGTGTCAGCTGCTTAACAACCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTACCCCATGCCATCAACCTGCGTGAGGTCAACCTGCGCCCCCAGATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTACCCCATGCCATCAACCTGCGTGAGGTCAACCTGCGCCCCCAGATGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCAG         TTCCTGTGCCTTAAGAACATTAGAACCTTCCTGTCCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCAGGTG...CAGTTCCTGTGCCTTAAGAACATTAGAACCTTCCTGTCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTGCTGTGAGAAGTTCGGCCTCAAGCGGAGCGAGCTCTTCGAAGCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147932 CCTGCTGTGAGAAGTTCGGCCTCAAGCGGAGCGAGCTCTTCGAAGCCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCTCTTCGATGTGCAGGATTTTGGCAAG         GTCATCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 147982 GACCTCTTCGATGTGCAGGATTTTGGCAAGGTG...CAGGTCATCTACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGTCTGCTCTGTCCTGGACCCCGATCGCCCAGAACAGGGGGATCAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 148826 CCTGTCTGCTCTGTCCTGGACCCCGATCGCCCAGAACAGGGGGATCATGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381        GCCCTTCCCCACCGAGGAGGAGAGTGTAGGTGATGAAGACATC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148876 G...CAGGCCCTTCCCCACCGAGGAGGAGAGTGTAGGTGATGAAGACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACAGTGGCCTGTCCGACCAGATCGA         CGACACGGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 149027 TACAGTGGCCTGTCCGACCAGATCGAGTG...CAGCGACACGGTGGAGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGATGAGGACCTGTATGACTGCGTGGAGAATGAGGAGGCGGAAGGCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149429 GGATGAGGACCTGTATGACTGCGTGGAGAATGAGGAGGCGGAAGGCGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGATCTATGAGGACCTCATGCGCTCGGAGCCCGTGTCCATGCCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 149479 AGATCTATGAGGACCTCATGCGCTCGGAGCCCGTGTCCATGCCGGTG...

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    559    CCCAAGATGACAGAGTATGACAAGCGCTGCTGCTGCCTGCGGGAGAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149609 CAGCCCAAGATGACAGAGTATGACAAGCGCTGCTGCTGCCTGCGGGAGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAGCAGACGGAGGAGAAGTACACTGACACGCTGGGCTCCATCCAGCAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 149659 CCAGCAGACGGAGGAGAAGTACACTGACACGCTGGGCTCCATCCAGCAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    655         CATTTCTTGAAGCCCCTGCAACGGTTCCTGAAACCTCAAGAC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149709 TG...CAGCATTTCTTGAAGCCCCTGCAACGGTTCCTGAAACCTCAAGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTGAGATCATCTTTATCAACATTGAG         GACCTGCTTCGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 152288 ATTGAGATCATCTTTATCAACATTGAGGTG...TAGGACCTGCTTCGTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TCATACTCACTTCCTAAAGGAGATGAAGGAAGCCCTGGGCACCCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152510 TCATACTCACTTCCTAAAGGAGATGAAGGAAGCCCTGGGCACCCCTGGCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CAGCCAATCTCTACCAGGTCTTCATCAAATACAAGGAGAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 152560 CAGCCAATCTCTACCAGGTCTTCATCAAATACAAGGAGAGGTG...TAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 TTCCTCGTCTATGGCCGCTACTGCAGCCAGGTGGAGTCAGCCAGCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153806 TTCCTCGTCTATGGCCGCTACTGCAGCCAGGTGGAGTCAGCCAGCAAACA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCTGGACCGTGTGGCCGCAGCCCGGGAGGACGTGCAGATGAAGCTGGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 153856 CCTGGACCGTGTGGCCGCAGCCCGGGAGGACGTGCAGATGAAGCTGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    928         GAATGTTCTCAGAGAGCCAACAACGGGAGGTTCACCCTGCGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153906 TG...CAGGAATGTTCTCAGAGAGCCAACAACGGGAGGTTCACCCTGCGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GACCTGCTGATGGTGCCTATGCAGCGAGTTCTCAAATATCACCTCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155311 GACCTGCTGATGGTGCCTATGCAGCGAGTTCTCAAATATCACCTCCTTCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCAG         GAGCTGGTGAAACACACGCAGGAGGCGATGGAGAAGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155361 CCAGGTG...CAGGAGCTGGTGAAACACACGCAGGAGGCGATGGAGAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGAACCTGCGGCTGGCCCTGGATGCCATGAGG         GACCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 155649 AGAACCTGCGGCTGGCCCTGGATGCCATGAGGGTG...CAGGACCTGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 CAGTGCGTGAACGAGGTCAAGCGAGACAACGAGACACTGCGACAGATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155824 CAGTGCGTGAACGAGGTCAAGCGAGACAACGAGACACTGCGACAGATCAC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 CAATTTCCAGCTGTCCATTGAGAACCTG         GACCAGTCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 155874 CAATTTCCAGCTGTCCATTGAGAACCTGGTG...TAGGACCAGTCTCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 CTCACTATGGCCGGCCCAAGATCGACGGGGAACTCAAGATCACCTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156021 CTCACTATGGCCGGCCCAAGATCGACGGGGAACTCAAGATCACCTCGGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 GAACGGCGCTCCAAGATGGACAG         GTATGCCTTCCTGCTCGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 156071 GAACGGCGCTCCAAGATGGACAGGTG...CAGGTATGCCTTCCTGCTCGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1284 CAAAGCTCTACTCATCTGTAAGCGCAGGGGAGACTCCTATGACCTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156997 CAAAGCTCTACTCATCTGTAAGCGCAGGGGAGACTCCTATGACCTCAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1334 ACTTTGTAAACCTGCACAGCTTCCAGGTTCGGGATGACTCTTCAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157047 ACTTTGTAAACCTGCACAGCTTCCAGGTTCGGGATGACTCTTCAGGAGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1384 CGAGACAACAAGAAG         TGGAGCCACATGTTCCTCCTGATCGA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 157097 CGAGACAACAAGAAGGTG...CAGTGGAGCCACATGTTCCTCCTGATCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1425 GGACCAAGGTGCCCAGGGCTATGAGCTGTTCTTCAAGACAAGAGAATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159310 GGACCAAGGTGCCCAGGGCTATGAGCTGTTCTTCAAGACAAGAGAATTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1475 AGAAGAAGTGGATGGAGCAGTTTGAGATGGCCAT         CTCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 159360 AGAAGAAGTGGATGGAGCAGTTTGAGATGGCCATGTG...CAGCTCCAAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1516 ATCTATCCGGAGAATGCCACCGCCAACGGGCATGACTTCCAGATGTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160384 ATCTATCCGGAGAATGCCACCGCCAACGGGCATGACTTCCAGATGTTCTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1566 CTTTGAGGAGACCACATCCTGCAAGGCCTGTCAGATGCTGCTTAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 160434 CTTTGAGGAGACCACATCCTGCAAGGCCTGTCAGATGCTGCTTAGGTG..

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611     AGGTACCTTCTATCAGGGCTACCGCTGCCATCGGTGCCGGGCATCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160484 .CAGAGGTACCTTCTATCAGGGCTACCGCTGCCATCGGTGCCGGGCATCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1657 GCACACAAGGAGTGTCTGGGGAGGGTCCCTCCATGTGGCCGACATGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160767 GCACACAAGGAGTGTCTGGGGAGGGTCCCTCCATGTGGCCGACATGGGCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1707 AG         ATTTCCCAGGAACTATGAAGAAG         GACAAAC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 160817 AGGTA...TAGATTTCCCAGGAACTATGAAGAAGGTA...CAGGACAAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1739 TACATCGCAGGGCTCAGGACAAAAAGAGGAATGAGCTGG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 161108 TACATCGCAGGGCTCAGGACAAAAAGAGGAATGAGCTGGGTG...CAGGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1780 CTGCCCAAGATGGAGGTGTTTCAGGAATACTACGGGCTTCCTCCACCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163627 CTGCCCAAGATGGAGGTGTTTCAGGAATACTACGGGCTTCCTCCACCCCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1830 TGGAGCCATTGGACCCTTTCTACGGCTCAACCCTGGAGACATTGTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163677 TGGAGCCATTGGACCCTTTCTACGGCTCAACCCTGGAGACATTGTGGAGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 TCACGAAGGCTGAGGCTGAACAGAACTGGTGGGAG         GGCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 163727 TCACGAAGGCTGAGGCTGAACAGAACTGGTGGGAGGTA...TAGGGCAGA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1921 AATACATCTACTAATGAAATTGGCTGGTTTCCTTGTAACAGGGTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164184 AATACATCTACTAATGAAATTGGCTGGTTTCCTTGTAACAGGGTGAAGCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 CTATGTCCAT         GGCCCTCCTCAGGACCTGTCTGTTCATCTCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 164234 CTATGTCCATGTG...TAGGGCCCTCCTCAGGACCTGTCTGTTCATCTCT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2012 G         GTACGCAGGCCCCATGGAGCGGGCAGGGGCAGAGAGCATC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170359 GGTG...CAGGTACGCAGGCCCCATGGAGCGGGCAGGGGCAGAGAGCATC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2053 CTGGCCAACCGCTCGGACGGGACTTTCTTGGTGCGGCAGAGGGTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 175231 CTGGCCAACCGCTCGGACGGGACTTTCTTGGTGCGGCAGAGGGTGAAGGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2103 TGCAGCAGAATTTGCCATCAGCATTAA         ATATAACGTCGAGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 175281 TGCAGCAGAATTTGCCATCAGCATTAAGTA...CAGATATAACGTCGAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2144 TCAAGCACATTAAAATCATGACAGCAGAAGGACTGTACCGGATCACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177877 TCAAGCACATTAAAATCATGACAGCAGAAGGACTGTACCGGATCACAGAG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2194 AAAAAGGCTTTCCGGGGGCTTACG         GAGCTGGTGGAGTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 177927 AAAAAGGCTTTCCGGGGGCTTACGGTA...TAGGAGCTGGTGGAGTTTTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2235 CCAGCAGAACTCTCTAAAGGATTGCTTCAAGTCTCTGGACACCACCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180175 CCAGCAGAACTCTCTAAAGGATTGCTTCAAGTCTCTGGACACCACCTTGC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2285 AGTTCCCCTTCAAGGAGCCTGAAAAGAGAACCATCAGCAGGCCAGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 180225 AGTTCCCCTTCAAGGAGCCTGAAAAGAGAACCATCAGCAGGCCAGCAGGT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2333        TGGGAAGCACAAAGTATTTTGGCACAGCCAAAGCCCGCTATGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180275 A...CAGTGGGAAGCACAAAGTATTTTGGCACAGCCAAAGCCCGCTATGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2376 CTTCTGCGCCCGAGACCGATCAGAGCTGTCGCTCAAGGAGGGTGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181183 CTTCTGCGCCCGAGACCGATCAGAGCTGTCGCTCAAGGAGGGTGACATCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2426 TCAAGATCCTTAACAAGAAGGGACAGCAAGGCTGGTGGCGAGGGGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181233 TCAAGATCCTTAACAAGAAGGGACAGCAAGGCTGGTGGCGAGGGGAGATC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2476 TATGGCCGG         GTTGGCTGGTTCCCTGCCAACTACGTGGAGGA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 181283 TATGGCCGGGTG...CAGGTTGGCTGGTTCCCTGCCAACTACGTGGAGGA

   2750     .    :    .
   2517 AGATTATTCTGAATACTGC
        |||||||||||||||||||
 184279 AGATTATTCTGAATACTGC