Result of SIM4 for
pF1KB0412
seq1 = pF1KB0412.tfa, 2472 bp
seq2 = pF1KB0412/gi568815597f_111655925.tfa (gi568815597f:111655925_111866896), 210972 bp
>pF1KB0412 2472
>gi568815597f:111655925_111866896 (Chr1)
1-301 (100001-100301) 99% ->
302-396 (100722-100816) 100% ->
397-565 (103476-103644) 100% ->
566-680 (104550-104664) 100% ->
681-823 (104782-104924) 100% ->
824-962 (105063-105201) 100% ->
963-1021 (105302-105360) 100% ->
1022-1104 (106331-106413) 98% ->
1105-1210 (106753-106858) 100% ->
1211-1312 (106982-107083) 100% ->
1313-2472 (109813-110972) 99%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGGCGGCATTTGAAGCCTCGGGAGCCTTAGCAGCAGTGGCGACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGCGGCGGCATTTGAAGCCTCGGGAGCCTTAGCAGCAGTGGCGACTGC
50 . : . : . : . : . :
51 TATGCCGGCTGAGCATGTGGCCGTGCAGGTCCCGGCCCCAGAGCCAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TATGCCGGCTGAGCATGTGGCCGTGCAGGTCCCGGCCCCAGAGCCAACAC
100 . : . : . : . : . :
101 CCGGGCCTGTGAGGATCCTGCGGACCGCTCAGGATCTCAGCAGCCCGCGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCGGGCCTGTGAGGATCCTGCGGACCGCTCAGGATCTCAGCAGCCCGCGG
150 . : . : . : . : . :
151 ACCCGCACGGGGGATGTGCTGTTGGCGGAGCCGGCCGACTTCGAGTCACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 ACCCGCACGGGGGATGTGCTGTTGGCGGAGCCGGCCGACTTCGAGTCACT
200 . : . : . : . : . :
201 GCTGCTTTCGCGGCCGGTGCTGGAGGGGCTGCGGGCGGCCGGCTTCGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 GCTGCTTTCGCGGCCGGTGCTGGAGGGGCTGCGGGCGGCCGGCTTCGAGA
250 . : . : . : . : . :
251 GGCCCTCGCCGGTGCAGCTCAAGGCCATCCCGCTGGGGCGCTGCGGGCTC
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
100251 GGCCCTCGCCGGTGCAGCTCAAGGCCATCCCGTTGGGGCGCTGCGGGCTC
300 . : . : . : . : . :
301 G ATTTAATTGTTCAAGCTAAATCTGGCACCGGGAAAACCTG
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 GGTG...CAGATTTAATTGTTCAAGCTAAATCTGGCACCGGGAAAACCTG
350 . : . : . : . : . :
342 TGTGTTCTCCACCATAGCTTTGGACTCTCTTGTTCTTGAAAACTTAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100762 TGTGTTCTCCACCATAGCTTTGGACTCTCTTGTTCTTGAAAACTTAAGTA
400 . : . : . : . : . :
392 CCCAG ATTTTGATCTTGGCTCCTACAAGAGAAATTGCTGTA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100812 CCCAGGTG...TAGATTTTGATCTTGGCTCCTACAAGAGAAATTGCTGTA
450 . : . : . : . : . :
433 CAGATACATTCTGTTATTACAGCCATTGGAATAAAAATGGAAGGCTTAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103512 CAGATACATTCTGTTATTACAGCCATTGGAATAAAAATGGAAGGCTTAGA
500 . : . : . : . : . :
483 GTGTCATGTCTTTATTGGAGGGACCCCATTATCACAAGACAAAACCAGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103562 GTGTCATGTCTTTATTGGAGGGACCCCATTATCACAAGACAAAACCAGAC
550 . : . : . : . : . :
533 TTAAAAAGTGTCATATTGCTGTTGGATCTCCTG GCAGAATT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
103612 TTAAAAAGTGTCATATTGCTGTTGGATCTCCTGGTA...TAGGCAGAATT
600 . : . : . : . : . :
574 AAGCAACTCATAGAACTTGACTACTTGAACCCAGGCAGTATACGCCTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104558 AAGCAACTCATAGAACTTGACTACTTGAACCCAGGCAGTATACGCCTCTT
650 . : . : . : . : . :
624 TATTCTTGATGAAGCAGATAAGCTTTTAGAAGAAGGCAGCTTCCAGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104608 TATTCTTGATGAAGCAGATAAGCTTTTAGAAGAAGGCAGCTTCCAGGAGC
700 . : . : . : . : . :
674 AAATAAA TTGGATTTATTCTTCCTTGCCTGCCAGTAAACAG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
104658 AAATAAAGTA...CAGTTGGATTTATTCTTCCTTGCCTGCCAGTAAACAG
750 . : . : . : . : . :
715 ATGCTGGCAGTATCAGCTACTTATCCCGAATTTTTGGCTAATGCTTTGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104816 ATGCTGGCAGTATCAGCTACTTATCCCGAATTTTTGGCTAATGCTTTGAC
800 . : . : . : . : . :
765 AAAGTACATGAGAGATCCCACTTTTGTAAGACTGAATTCCAGTGATCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104866 AAAGTACATGAGAGATCCCACTTTTGTAAGACTGAATTCCAGTGATCCAA
850 . : . : . : . : . :
815 GTCTCATAG GTTTGAAGCAGTATTACAAAGTTGTCAATTCA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
104916 GTCTCATAGGTG...TAGGTTTGAAGCAGTATTACAAAGTTGTCAATTCA
900 . : . : . : . : . :
856 TACCCTTTGGCACATAAGGTTTTTGAGGAAAAGACTCAGCATTTACAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105095 TACCCTTTGGCACATAAGGTTTTTGAGGAAAAGACTCAGCATTTACAGGA
950 . : . : . : . : . :
906 ACTGTTCAGCAGAATTCCATTTAATCAAGCTTTAGTCTTTTCTAATTTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105145 ACTGTTCAGCAGAATTCCATTTAATCAAGCTTTAGTCTTTTCTAATTTGC
1000 . : . : . : . : . :
956 ACAGCAG AGCACAACATTTGGCTGATATCCTTTCTTCTAAA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
105195 ACAGCAGGTA...TAGAGCACAACATTTGGCTGATATCCTTTCTTCTAAA
1050 . : . : . : . : . :
997 GGCTTTCCTGCTGAGTGCATTTCAG GCAATATGAATCAGAA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
105336 GGCTTTCCTGCTGAGTGCATTTCAGGTA...TAGGCAATATGAATCAGAA
1100 . : . : . : . : . :
1038 TCAGCGTCTTGATGCTATGGCTAAACTGAAGCATTTTCATTGCAGAGTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
106347 TCAGCGTCTTGATGCTATGGCTAAACTGAAGCACTTTCATTGCAGAGTCC
1150 . : . : . : . : . :
1088 TCATTTCCACAGATTTG ACTTCTCGTGGGATTGATGCTGAG
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
106397 TCATTTCCACAGATTTGGTA...AAGACTTCTCGTGGGATTGATGCTGAG
1200 . : . : . : . : . :
1129 AAGGTGAATCTGGTTGTAAATCTGGATGTACCATTGGATTGGGAGACATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106777 AAGGTGAATCTGGTTGTAAATCTGGATGTACCATTGGATTGGGAGACATA
1250 . : . : . : . : . :
1179 CATGCATCGGATTGGGAGAGCTGGCCGTTTTG GTACATTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
106827 CATGCATCGGATTGGGAGAGCTGGCCGTTTTGGTA...TAGGTACATTGG
1300 . : . : . : . : . :
1220 GGCTGACAGTGACCTACTGTTGCCGGGGAGAGGAAGAAAATATGATGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106991 GGCTGACAGTGACCTACTGTTGCCGGGGAGAGGAAGAAAATATGATGATG
1350 . : . : . : . : . :
1270 AGAATTGCCCAGAAATGTAATATCAACCTTCTCCCTTTACCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
107041 AGAATTGCCCAGAAATGTAATATCAACCTTCTCCCTTTACCAGGTA...T
1400 . : . : . : . : . :
1313 ATCCCATTCCTTCTGGTCTGATGGAAGAATGTGTGGATTGGGATGTGG
>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109811 AGATCCCATTCCTTCTGGTCTGATGGAAGAATGTGTGGATTGGGATGTGG
1450 . : . : . : . : . :
1361 AAGTTAAAGCTGCTGTGCATACATATGGTATAGCAAGTGTACCTAACCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109861 AAGTTAAAGCTGCTGTGCATACATATGGTATAGCAAGTGTACCTAACCAA
1500 . : . : . : . : . :
1411 CCCTTAAAAAAGCAAATTCAGAAAATAGAGAGAACCCTTCAAATTCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109911 CCCTTAAAAAAGCAAATTCAGAAAATAGAGAGAACCCTTCAAATTCAGAA
1550 . : . : . : . : . :
1461 AGCTCATGGTGACCACATGGCTTCCTCTAGAAATAATTCTGTATCTGGAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
109961 AGCTCATGGTGACCACATGGCTTCCTCTAGAAATAATTCTGTATCTGGAC
1600 . : . : . : . : . :
1511 TATCAGTCAAATCAAAAAATAATACCAAACAAAAGCTTCCTGTGAAAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110011 TATCAGTCAAATCAAAAAATAATACCAAACAAAAGCTTCCTGTGAAAAGC
1650 . : . : . : . : . :
1561 CACTCAGAATGTGGAATCATAGAAAAAGCAACGTCACCAAAAGAACTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110061 CACTCAGAATGTGGAATCATAGAAAAAGCAACGTCACCAAAAGAACTGGG
1700 . : . : . : . : . :
1611 CTGTGACAGGCAATCCGAAGAGCAAATGAAGAATTCTGTTCAGACTCCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110111 CTGTGACAGGCAATCCGAAGAGCAAATGAAGAATTCTGTTCAGACTCCCG
1750 . : . : . : . : . :
1661 TTGAAAACTCCACCAACAGTCAGCACCAGGTCAAAGAAGCTTTACCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110161 TTGAAAACTCCACCAACAGTCAGCACCAGGTCAAAGAAGCTTTACCTGTG
1800 . : . : . : . : . :
1711 TCACTCCCCCAGATTCCTTGTCTGTCTTCCTTTAAAATCCATCAGCCATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110211 TCACTCCCCCAGATTCCTTGTCTGTCTTCCTTTAAAATCCATCAGCCATA
1850 . : . : . : . : . :
1761 CACGTTGACTTTTGCTGAATTGGTAGAGGATTATGAACATTATATTAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110261 CACGTTGACTTTTGCTGAATTGGTAGAGGATTATGAACATTATATTAAAG
1900 . : . : . : . : . :
1811 AGGGGTTAGAGAAACCTGTGGAAATCATCAGGCACTACACAGGCCCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110311 AGGGGTTAGAGAAACCTGTGGAAATCATCAGGCACTACACAGGCCCTGGG
1950 . : . : . : . : . :
1861 GATCAGACTGTGAATCCTCAAAATGGTTTTGTGAGAAATAAAGTTACTGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
110361 GATCAGACTGTGAATCCTCAAAATGGTTTTGTGAGAAATAAAGTTATTGA
2000 . : . : . : . : . :
1911 ACAGAGAGTCCCTGTATTGGCAAGTAGTAGCCAATCTGGAGACTCTGAGA
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
110411 ACAGAGAGTCCCTGTGTTGGCAAGTAGTAGCCAATCTGGAGACTCTGAGA
2050 . : . : . : . : . :
1961 GTGACAGTGATTCTTACAGCTCAAGAACCTCTTCCCAGAGCAAAGGAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110461 GTGACAGTGATTCTTACAGCTCAAGAACCTCTTCCCAGAGCAAAGGAAAT
2100 . : . : . : . : . :
2011 AAGTCATACTTGGAAGGCTCTTCTGATAATCAGCTGAAAGACTCTGAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110511 AAGTCATACTTGGAAGGCTCTTCTGATAATCAGCTGAAAGACTCTGAATC
2150 . : . : . : . : . :
2061 TACGCCTGTGGATGATCGTATTTCTTTGGAACAACCACCAAATGGAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110561 TACGCCTGTGGATGATCGTATTTCTTTGGAACAACCACCAAATGGAAGTG
2200 . : . : . : . : . :
2111 ACACCCCCAATCCAGAGAAATATCAAGAATCACCTGGAATCCAGATGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110611 ACACCCCCAATCCAGAGAAATATCAAGAATCACCTGGAATCCAGATGAAG
2250 . : . : . : . : . :
2161 ACAAGACTTAAAGAGGGGGCTAGCCAGAGAGCTAAGCAGAGCCGGAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110661 ACAAGACTTAAAGAGGGGGCTAGCCAGAGAGCTAAGCAGAGCCGGAGAAA
2300 . : . : . : . : . :
2211 CCTACCCAGGCGGTCTTCCTTCAGATTGCAGACTGGAGCCCAGGAAGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
110711 CCTACCCAGGCGGTCTTCCTTCAGATTGCAGACTGAAGCCCAGGAAGATG
2350 . : . : . : . : . :
2261 ATTGGTATGACTGTCATAGGGAAATACGTCTGAGTTTTTCTGATACCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110761 ATTGGTATGACTGTCATAGGGAAATACGTCTGAGTTTTTCTGATACCTAT
2400 . : . : . : . : . :
2311 CAGGATTATGAGGAGTACTGGAGAGCTTACTACAGGGCATGGCAAGAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110811 CAGGATTATGAGGAGTACTGGAGAGCTTACTACAGGGCATGGCAAGAATA
2450 . : . : . : . : . :
2361 TTATGCTGCCGCTTCTCATTCATATTATTGGAATGCTCAGAGACATCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110861 TTATGCTGCCGCTTCTCATTCATATTATTGGAATGCTCAGAGACATCCAA
2500 . : . : . : . : . :
2411 GTTGGATGGCAGCTTATCACATGAATACCATTTATCTACAAGAAATGATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
110911 GTTGGATGGCAGCTTATCACATGAATACCATTTATCTACAAGAAATGATG
2550 . :
2461 CATAGTAACCAG
||||||||||||
110961 CATAGTAACCAG