seq1 = pF1KB0401.tfa, 513 bp
seq2 = pF1KB0401/gi568815580f_3153248.tfa (gi568815580f:3153248_3377934), 224687 bp

>pF1KB0401 513
>gi568815580f:3153248_3377934 (Chr18)

1-181  (100001-100181)   100% ->
182-343  (100642-100803)   100% ->
344-513  (102499-102668)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAGCAAAAGAACAAAGACCAAGACCAAGAAGCGCCCTCAGCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAGCAAAAGAACAAAGACCAAGACCAAGAAGCGCCCTCAGCGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACATCCAATGTGTTTGCTATGTTTGACCAGTCACAGATTCAGGAGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACATCCAATGTGTTTGCTATGTTTGACCAGTCACAGATTCAGGAGTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAGAGGCCTTCAACATGATTGATCAGAACAGAGATGGTTTCATCGACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AAGAGGCCTTCAACATGATTGATCAGAACAGAGATGGTTTCATCGACAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAGATTTGCATGATATGCTTGCTTCATTGG         GGAAGAATCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100151 GAAGATTTGCATGATATGCTTGCTTCATTGGGTA...TAGGGAAGAATCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AACTGATGAGTATCTAGATGCCATGATGAATGAGGCTCCAGGCCCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100652 AACTGATGAGTATCTAGATGCCATGATGAATGAGGCTCCAGGCCCCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATTTCACCATGTTCCTCACCATGTTTGGTGAGAAGTTAAATGGCACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100702 ATTTCACCATGTTCCTCACCATGTTTGGTGAGAAGTTAAATGGCACAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCTGAAGATGTCATCAGAAATGCCTTTGCTTGCTTTGATGAAGAAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100752 CCTGAAGATGTCATCAGAAATGCCTTTGCTTGCTTTGATGAAGAAGCAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TG         GCACCATACAGGAAGATTACTTGAGAGAGCTGCTGACAA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100802 TGGTA...CAGGCACCATACAGGAAGATTACTTGAGAGAGCTGCTGACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCATGGGGGATCGGTTTACAGATGAGGAAGTGGATGAGCTGTACAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102538 CCATGGGGGATCGGTTTACAGATGAGGAAGTGGATGAGCTGTACAGAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCACCTATTGATAAAAAGGGGAATTTCAATTACATCGAGTTCACACGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102588 GCACCTATTGATAAAAAGGGGAATTTCAATTACATCGAGTTCACACGCAT

    500     .    :    .    :    .    :
    483 CCTGAAACATGGAGCCAAAGACAAAGATGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 102638 CCTGAAACATGGAGCCAAAGACAAAGATGAC