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seq2 = pF1KA1903/gi568815584r_45104112.tfa (gi568815584r:45104112_45347286), 243175 bp

>pF1KA1903 3396
>gi568815584r:45104112_45347286 (Chr14)

(complement)

1-544  (100001-100544)   100% ->
545-658  (104413-104526)   100% ->
659-1143  (104769-105253)   100% ->
1144-1217  (109566-109639)   100% ->
1218-1348  (111343-111473)   100% ->
1349-1436  (114467-114554)   100% ->
1437-1594  (115989-116146)   100% ->
1595-1746  (119473-119624)   100% ->
1747-1840  (120451-120544)   100% ->
1841-2669  (122541-123369)   100% ->
2670-2842  (128833-129005)   100% ->
2843-3003  (130108-130268)   100% ->
3004-3152  (136759-136907)   100% ->
3153-3240  (141117-141204)   100% ->
3241-3295  (142834-142888)   100% ->
3296-3396  (143075-143175)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTGCAACACCTTTGAAACATTCAAGAATTTACTTACCTCCAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTGCAACACCTTTGAAACATTCAAGAATTTACTTACCTCCAGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTTCTCAAAGGAGAAATCTACCCATGGATGCAATCTTTTTTGACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTTCTCAAAGGAGAAATCTACCCATGGATGCAATCTTTTTTGACAGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCCTTCAGGCACACTTACTCCTGTAAAAGATTTGGTGAAATATCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCCTTCAGGCACACTTACTCCTGTAAAAGATTTGGTGAAATATCAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTCCTTAAAATTGAATGACCATAAAAAGAATCAGTTCCTAAAAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTCCTTAAAATTGAATGACCATAAAAAGAATCAGTTCCTAAAAATGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AACTTTTAACAATAAAAATATATTTCAATCAACTATGCTAACAGAGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AACTTTTAACAATAAAAATATATTTCAATCAACTATGCTAACAGAGGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTACCTCTAACAGTTCTCTTGATATCAGTGCTATAAAGCCCAACAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTACCTCTAACAGTTCTCTTGATATCAGTGCTATAAAGCCCAACAAGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGATTAAAAAATAAAGCAAACTATGAATCACCAGGAAAAATATTTCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGATTAAAAAATAAAGCAAACTATGAATCACCAGGAAAAATATTTCTAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGAAAGAAAAAGTACTGCGTGACAAGCAAGAACAGCCATCAAGAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGAAAGAAAAAGTACTGCGTGACAAGCAAGAACAGCCATCAAGAAACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTAGTTTGTTGGAACCACAGAAAAGTGGAAATAATGAAACCTTCACTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTAGTTTGTTGGAACCACAGAAAAGTGGAAATAATGAAACCTTCACTCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACAGAGTTGAAAAAAAAAAATTGCAGCATACCTACCTATGTGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACAGAGTTGAAAAAAAAAAATTGCAGCATACCTACCTATGTGAAGAAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAAAACAACAAATCATTCCAGTCAGATGACAGTTCACTAAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100501 GGAAAACAACAAATCATTCCAGTCAGATGACAGTTCACTAAGAGGTT...

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    545    CCTCAGTCCAAGGAGTTCCTCTAGAATCATCAAATAATGATATTTTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104410 TAGCCTCAGTCCAAGGAGTTCCTCTAGAATCATCAAATAATGATATTTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTCCCGGTCAAACAAAAGATTCAGTGCCAGCAGGAAAAGAAAGCACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104460 CTCCCGGTCAAACAAAAGATTCAGTGCCAGCAGGAAAAGAAAGCACCACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCACAATTTAACTTACG         AACTTCCAACTCTGAACCAAGAAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 104510 GCACAATTTAACTTACGGTA...CAGAACTTCCAACTCTGAACCAAGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGGAAAATTTTTTGGCTGTAGAAGCCCGAAACAAGACATTAACTAGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104793 AGGAAAATTTTTTGGCTGTAGAAGCCCGAAACAAGACATTAACTAGAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CAGTTGGCTAAACAAATTTTTCACTCAAAGGAGAGTATAGTTGCAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104843 CAGTTGGCTAAACAAATTTTTCACTCAAAGGAGAGTATAGTTGCAACCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TAAATCCAAAAAGGACACGTTTGTTTTAGAAAGCGTTGATTCTGCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104893 TAAATCCAAAAAGGACACGTTTGTTTTAGAAAGCGTTGATTCTGCTGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AACAATTTCAAAATACTAATGCTGAGACTCTCAGTACTAATTGTATTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104943 AACAATTTCAAAATACTAATGCTGAGACTCTCAGTACTAATTGTATTCCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ATTAAAAATGGCAGCCTGTTAATGGTTTCTGATAGTGAGAGGACAACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104993 ATTAAAAATGGCAGCCTGTTAATGGTTTCTGATAGTGAGAGGACAACAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AGGGACTTCGCAACAGAAAGTTAAGGAAGGAAATGGAAAAACAGTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105043 AGGGACTTCGCAACAGAAAGTTAAGGAAGGAAATGGAAAAACAGTGCCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 GAGAGACAGGTCTTCCAGGTTCCATGAAAGATACATGTAAAATTGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105093 GAGAGACAGGTCTTCCAGGTTCCATGAAAGATACATGTAAAATTGTACTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCAACACCAAGACTTCATATAACAATACCTCGGAGGTCAAAAAGAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105143 GCAACACCAAGACTTCATATAACAATACCTCGGAGGTCAAAAAGAAATAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TTCAAAGCTTTCTCCTCCAAGAATATTTCAAACTGTTACAAATGGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105193 TTCAAAGCTTTCTCCTCCAAGAATATTTCAAACTGTTACAAATGGACTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AAAAAAATCAG         GTAGTTCAGCTACAGGAATGGATGATTAAA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 105243 AAAAAAATCAGGTG...TAGGTAGTTCAGCTACAGGAATGGATGATTAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AGCATCAATAATAATACTGCTATATGTGTAGAAGGAAAATTGAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 109596 AGCATCAATAATAATACTGCTATATGTGTAGAAGGAAAATTGATGTA...

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1218    AGACGTCACTAACATATATTGGCACAGTAATGTAATTATAGAGCGGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111340 TAGAGACGTCACTAACATATATTGGCACAGTAATGTAATTATAGAGCGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 TTGAGCACAACAAACTTAGGACTATATCAGGCAACGTTTATATATTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111390 TTGAGCACAACAAACTTAGGACTATATCAGGCAACGTTTATATATTAAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGCATGATAGACCAAATTTCCATGAAAGAAGCAG         GATATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 111440 GGCATGATAGACCAAATTTCCATGAAAGAAGCAGGTA...TAGGATATCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 AAATTATCTCATAAGGAAATTTATGTTTGGATTTCCAGAAAATTGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114474 AAATTATCTCATAAGGAAATTTATGTTTGGATTTCCAGAAAATTGGAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGCACATTGATAATTTTCTGGAACAATTAAG         GGCTGGTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 114524 AGCACATTGATAATTTTCTGGAACAATTAAGGTA...AAGGGCTGGTGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 AAGAACAGGGAAAAGACCAAACAAAAACAGAAAACTGGAAGATCTGTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115999 AAGAACAGGGAAAAGACCAAACAAAAACAGAAAACTGGAAGATCTGTCCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 TGACATAAGGAAATCAATGAAAAATGATGCACGAGAAAACCAAACAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116049 TGACATAAGGAAATCAATGAAAAATGATGCACGAGAAAACCAAACAGATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CTGCTCAAAGAGCCACCACCACTTACGATTTTGATTGTGATAATTTGG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 116099 CTGCTCAAAGAGCCACCACCACTTACGATTTTGATTGTGATAATTTGGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1595        AACTGAAGAGTAATAAGCACAGTGAGTCACCAGGAGCTACAGA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116149 A...TAGAACTGAAGAGTAATAAGCACAGTGAGTCACCAGGAGCTACAGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 ATTAAACATGTGCCACAGTAATTGCCAAAATAAACCAACATTAAGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119516 ATTAAACATGTGCCACAGTAATTGCCAAAATAAACCAACATTAAGGTTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CAGATGACCAAGTAAATAATACTATTCAAAATGGAGGAGGAGATGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119566 CAGATGACCAAGTAAATAATACTATTCAAAATGGAGGAGGAGATGACTTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 TCTAATCAG         GAATTAATTGGAAAAAAAGAATATAAAATGTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 119616 TCTAATCAGGTA...AAGGAATTAATTGGAAAAAAAGAATATAAAATGTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 TTCAAAGAAACTAAAAATTGGTGAAAGAACAAATGAAAGGATAATAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120483 TTCAAAGAAACTAAAAATTGGTGAAAGAACAAATGAAAGGATAATAAAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 GTCAGAAGCAAG         AGACAACTGAAGAATTGGATGTATCCATT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 120533 GTCAGAAGCAAGGTA...AAGAGACAACTGAAGAATTGGATGTATCCATT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1870 GATATTCTAACCTCAAGGGAACAGTTTTTCTCAGATGAAGAAAGAAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122570 GATATTCTAACCTCAAGGGAACAGTTTTTCTCAGATGAAGAAAGAAAATA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 CATGGCCATCAATCAGAAGAAAGCTTATATTTTAGTAACACCACTTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122620 CATGGCCATCAATCAGAAGAAAGCTTATATTTTAGTAACACCACTTAAAT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 CTAGAAAAGTGATAGAGCAAAGATGCATGAGGTATAATCTGTCCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122670 CTAGAAAAGTGATAGAGCAAAGATGCATGAGGTATAATCTGTCCGCTGGC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 ACCATCAAAGCAGTAACAGATTTTGTAATACCAGAGTGTCAAAAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122720 ACCATCAAAGCAGTAACAGATTTTGTAATACCAGAGTGTCAAAAAAAAAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 TCCCATCAGCAAGTCCATGGGGACTTTAGAAAATACATTTGAAGGTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122770 TCCCATCAGCAAGTCCATGGGGACTTTAGAAAATACATTTGAAGGTCATA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2120 AAAGTAAAAACAAGGAAGATTGCGATGAACGTGACTTACTTACTGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122820 AAAGTAAAAACAAGGAAGATTGCGATGAACGTGACTTACTTACTGTCAAC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2170 CGGAAAATAAAAATATCTAACCTTGAAAAGGAACAAATGCTCACCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122870 CGGAAAATAAAAATATCTAACCTTGAAAAGGAACAAATGCTCACCTCTGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2220 CTTTAAGAAAAATACCAGACTATTACCAAAATTGAAGAAAATAGAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122920 CTTTAAGAAAAATACCAGACTATTACCAAAATTGAAGAAAATAGAAAATC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 AGGTAGCTATGTCATTTTATAAGCATCAGTCCTCACCAGATTTGTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122970 AGGTAGCTATGTCATTTTATAAGCATCAGTCCTCACCAGATTTGTCAAGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 GAAGAAAGTGAAACAGAAAAGGAAATTAAAAGGAAAGCTGAAGTTAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123020 GAAGAAAGTGAAACAGAAAAGGAAATTAAAAGGAAAGCTGAAGTTAAGAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 AACCAAAGCAGGAAACACCAAAGAAGCAGTGGTTCACCTGAGAAAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123070 AACCAAAGCAGGAAACACCAAAGAAGCAGTGGTTCACCTGAGAAAGAGCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2420 CAAGAAACACAAGTAATATTCCAGTGATTTTGGAACCTGAAACTGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123120 CAAGAAACACAAGTAATATTCCAGTGATTTTGGAACCTGAAACTGAAGAA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2470 AGTGAAAATGAATTTTATATCAAACAAAAGAAAGCTAGACCTTCCGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123170 AGTGAAAATGAATTTTATATCAAACAAAAGAAAGCTAGACCTTCCGTCAA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2520 AGAAACTCTTCAGAAGTCTGGTGTTAGGAAAGAGTTTCCAATTACTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123220 AGAAACTCTTCAGAAGTCTGGTGTTAGGAAAGAGTTTCCAATTACTGAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2570 CAGTAGGATCTGATAAGACAAATAGGCATCCCTTAGAATGCTTACCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123270 CAGTAGGATCTGATAAGACAAATAGGCATCCCTTAGAATGCTTACCTGGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2620 TTAATTCAGGATAAGGAATGGAATGAGAAGGAGTTACAGAAACTTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123320 TTAATTCAGGATAAGGAATGGAATGAGAAGGAGTTACAGAAACTTCATTG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2670          TGCTTTTGCATCTCTTCCAAAGCACAAACCTGGTTTCTGGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123370 GTA...TAGTGCTTTTGCATCTCTTCCAAAGCACAAACCTGGTTTCTGGT

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2711 CAGAGGTAGCTGCGGCTGTAGGTTCTCGATCTCCTGAAGAATGCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128874 CAGAGGTAGCTGCGGCTGTAGGTTCTCGATCTCCTGAAGAATGCCAGAGG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2761 AAATACATGGAAAATCCCAGAGGAAAAGGATCCCAGAAACATGTCACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128924 AAATACATGGAAAATCCCAGAGGAAAAGGATCCCAGAAACATGTCACTAA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2811 GAAGAAGCCAGCCAATTCCAAAGGCCAAAATG         GCAAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 128974 GAAGAAGCCAGCCAATTCCAAAGGCCAAAATGGTA...AAGGCAAGAGAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2852 GTGATGCTGATCAGAAACAAACTATTAAGATAACTGCCAAAGTGGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130117 GTGATGCTGATCAGAAACAAACTATTAAGATAACTGCCAAAGTGGGAACT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2902 CTTAAAAGGAAGCAACAGATGAGGGAATTTCTGGAACAGTTGCCAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130167 CTTAAAAGGAAGCAACAGATGAGGGAATTTCTGGAACAGTTGCCAAAAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2952 TGACCATGATGATTTTTTCAGTACAACACCTTTACAGCATCAAAGAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130217 TGACCATGATGATTTTTTCAGTACAACACCTTTACAGCATCAAAGAATAC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3002 TG         TTGCCAAGTTTCCAGGACAGTGAAGATGATGATGATATT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130267 TGGTA...TAGTTGCCAAGTTTCCAGGACAGTGAAGATGATGATGATATT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3043 CTGCCAAATATGGACAAAAATCCAACAACTCCATCATCAGTTATCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136798 CTGCCAAATATGGACAAAAATCCAACAACTCCATCATCAGTTATCTTTCC

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3093 ATTGGTAAAAACTCCTCAATGTCAGCATGTCAGTCCTGGCATGCTAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136848 ATTGGTAAAAACTCCTCAATGTCAGCATGTCAGTCCTGGCATGCTAGGTT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3143 CTATAAATAG         GAATGACTGTGATAAATATGTTTTTCGTATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 136898 CTATAAATAGGTA...CAGGAATGACTGTGATAAATATGTTTTTCGTATG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3184 CAAAAATATCATAAAAGTAATGGTGGTATTGTCTGGGGCAACATCAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141148 CAAAAATATCATAAAAGTAATGGTGGTATTGTCTGGGGCAACATCAAGAA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3234 AAAATTA         GTTGAAACTGATTTCTCAACTCCAACACCAAGAA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141198 AAAATTAGTA...TAGGTTGAAACTGATTTCTCAACTCCAACACCAAGAA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3275 GGAAAACCCCATTTAACACAG         ACTTAGGAGAAAACTCTGGT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 142868 GGAAAACCCCATTTAACACAGGTA...CAGACTTAGGAGAAAACTCTGGT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3316 ATTGGAAAACTTTTCACTAATGCTGTGGAATCTTTAGATGAAGAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143095 ATTGGAAAACTTTTCACTAATGCTGTGGAATCTTTAGATGAAGAAGAGAA

   3500     .    :    .    :    .    :
   3366 AGATTATTATTTTTCGAACTCTGATTCTGCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 143145 AGATTATTATTTTTCGAACTCTGATTCTGCA