Result of SIM4 for
pF1KA1902
seq1 = pF1KA1902.tfa, 3279 bp
seq2 = pF1KA1902/gi568815596f_152235604.tfa (gi568815596f:152235604_152747902), 512299 bp
>pF1KA1902 3279
>gi568815596f:152235604_152747902 (Chr2)
1-117 (100001-100117) 100% ->
118-201 (286340-286423) 98% ->
202-282 (307136-307216) 100% ->
283-359 (313418-313494) 98% ->
360-443 (323137-323220) 100% ->
444-596 (325280-325432) 100% ->
597-705 (339533-339641) 100% ->
706-782 (343285-343361) 100% ->
783-876 (345353-345446) 100% ->
877-951 (371736-371810) 100% ->
952-1062 (375892-376002) 100% ->
1063-1212 (379248-379397) 100% ->
1213-1314 (381488-381589) 100% ->
1315-1627 (383243-383555) 100% ->
1628-1840 (383906-384115) 97% ->
1841-1965 (389835-389959) 100% ->
1966-2168 (390922-391124) 100% ->
2169-2403 (392696-392930) 100% ->
2404-2472 (394053-394121) 100% ->
2473-2553 (394222-394302) 100% ->
2554-2683 (396405-396534) 100% ->
2684-2847 (400824-400987) 100% ->
2848-2949 (401970-402071) 100% ->
2950-3048 (404355-404453) 100% ->
3049-3172 (405188-405311) 100% ->
3173-3279 (412193-412299) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGCAACGCAGGGAGCATGGATTCGCAGCAGACCGATTTCAGGGCGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGGCAACGCAGGGAGCATGGATTCGCAGCAGACCGATTTCAGGGCGCA
50 . : . : . : . : . :
51 CAACGTGCCTTTGAAGCTGCCGATGCCAGAGCCAGGTGAACTGGAGGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CAACGTGCCTTTGAAGCTGCCGATGCCAGAGCCAGGTGAACTGGAGGAGC
100 . : . : . : . : . :
101 GATTTGCCATCGTGCTG AACGCTATGAACCTACCTCCTGAC
|||||||||||||||||>>>...>>>|| |||||||||||||||||||||
100101 GATTTGCCATCGTGCTGGTA...CAGAATGCTATGAACCTACCTCCTGAC
150 . : . : . : . : . :
142 AAAGCCAGGTTACTGCGGCAGTATGATAATGAGAAAAAATGGGAACTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
286364 AAAGCCAGGTTACTGCGGCAGTATGATAATGAGAAAAAATGGGAACTGAT
200 . : . : . : . : . :
192 TTGTGATCAG GAACGATTCCAGGTGAAGAATCCTCCCCATA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
286414 TTGTGATCAGGTA...CAGGAACGATTCCAGGTGAAGAATCCTCCCCATA
250 . : . : . : . : . :
233 CATACATTCAAAAGCTCAAAGGCTATCTGGATCCAGCTGTAACCAGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307167 CATACATTCAAAAGCTCAAAGGCTATCTGGATCCAGCTGTAACCAGGAAG
300 . : . : . : . : . :
283 AAATTCAGACGGCGTGTTCAAGAATCTACACAAGTGCTAAG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
307217 GTA...TAGAAATTCAGACGGCGTGTTCAAGAATCTACACAAGTGCTAAG
350 . : . : . : . : . :
324 AGAACTGGAAATTTCTTTAAGAACTAACCACATTGG ATGGG
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||>>>...>>>|||||
313459 AGAACTGGAAATTTCTTTGAGAACTAACCACATTGGGTA...CAGATGGG
400 . : . : . : . : . :
365 TCAGAGAATTTCTGAATGAAGAAAACAAAGGTCTTGATGTTCTAGTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
323142 TCAGAGAATTTCTGAATGAAGAAAACAAAGGTCTTGATGTTCTAGTGGAA
450 . : . : . : . : . :
415 TATCTCTCATTTGCACAGTACGCGGTAAC TTTTGACTTTGA
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
323192 TATCTCTCATTTGCACAGTACGCGGTAACGTA...TAGTTTTGACTTTGA
500 . : . : . : . : . :
456 AAGTGTGGAGAGTACTGTGGAGAGCTCGGTGGACAAATCAAAGCCCTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325292 AAGTGTGGAGAGTACTGTGGAGAGCTCGGTGGACAAATCAAAGCCCTGGA
550 . : . : . : . : . :
506 GTAGGTCCATCGAGGACCTGCACAGAGGGAGCAACCTGCCCTCACCTGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
325342 GTAGGTCCATCGAGGACCTGCACAGAGGGAGCAACCTGCCCTCACCTGTG
600 . : . : . : . : . :
556 GGCAACAGTGTCTCCCGCTCTGGAAGACATTCTGCACTGCG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
325392 GGCAACAGTGTCTCCCGCTCTGGAAGACATTCTGCACTGCGGTG...TAG
650 . : . : . : . : . :
597 ATATAATACATTGCCAAGCAGAAGAACTCTGAAAAATTCAAGATTAGTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
339533 ATATAATACATTGCCAAGCAGAAGAACTCTGAAAAATTCAAGATTAGTGA
700 . : . : . : . : . :
647 GTAAGAAAGATGATGTGCATGTCTGTATCATGTGTTTACGTGCCATCATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
339583 GTAAGAAAGATGATGTGCATGTCTGTATCATGTGTTTACGTGCCATCATG
750 . : . : . : . : . :
697 AATTATCAG TATGGTTTCAACATGGTCATGTCTCATCCACA
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
339633 AATTATCAGGTA...TAGTATGGTTTCAACATGGTCATGTCTCATCCACA
800 . : . : . : . : . :
738 CGCTGTCAATGAGATTGCACTAAGCCTGAACAACAAGAATCCCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
343317 CGCTGTCAATGAGATTGCACTAAGCCTGAACAACAAGAATCCCAGGTA..
850 . : . : . : . : . :
783 AACAAAAGCCCTTGTCTTAGAACTGTTGGCAGCCGTTTGTCTTGTC
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
343367 .CAGAACAAAAGCCCTTGTCTTAGAACTGTTGGCAGCCGTTTGTCTTGTC
900 . : . : . : . : . :
829 AGAGGCGGGCATGAAATCATTTTATCAGCATTTGATAACTTTAAAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
345399 AGAGGCGGGCATGAAATCATTTTATCAGCATTTGATAACTTTAAAGAGGT
950 . : . : . : . : . :
877 GTTTGTGGAGAAAAACAGCGCTTTGAGAAGTTGATGGAACATT
>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
345449 A...CAGGTTTGTGGAGAAAAACAGCGCTTTGAGAAGTTGATGGAACATT
1000 . : . : . : . : . :
920 TCAGGAATGAAGACAATAACATAGATTTTATG GTGGCTTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
371779 TCAGGAATGAAGACAATAACATAGATTTTATGGTG...CAGGTGGCTTCT
1050 . : . : . : . : . :
961 ATGCAGTTTATTAATATTGTAGTCCATTCAGTAGAAGATATGAATTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
375901 ATGCAGTTTATTAATATTGTAGTCCATTCAGTAGAAGATATGAATTTCAG
1100 . : . : . : . : . :
1011 AGTTCACCTGCAGTATGAATTTACCAAATTAGGCCTGGACGAATACTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
375951 AGTTCACCTGCAGTATGAATTTACCAAATTAGGCCTGGACGAATACTTGG
1150 . : . : . : . : . :
1061 AC AAGCTGAAACACACTGAGAGTGACAAGCTTCAAGTCCAG
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
376001 ACGTG...TAGAAGCTGAAACACACTGAGAGTGACAAGCTTCAAGTCCAG
1200 . : . : . : . : . :
1102 ATCCAGGCTTACCTGGACAATGTTTTTGATGTAGGAGCTCTACTGGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
379287 ATCCAGGCTTACCTGGACAATGTTTTTGATGTAGGAGCTCTACTGGAAGA
1250 . : . : . : . : . :
1152 TGCTGAAACTAAGAATGCTGCCTTGGAGAGGGTGGAAGAACTGGAAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
379337 TGCTGAAACTAAGAATGCTGCCTTGGAGAGGGTGGAAGAACTGGAAGAAA
1300 . : . : . : . : . :
1202 ACATTTCTCAT TTATCTGAAAAACTGCAAGACACAGAGAAT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
379387 ACATTTCTCATGTA...CAGTTATCTGAAAAACTGCAAGACACAGAGAAT
1350 . : . : . : . : . :
1243 GAAGCCATGTCCAAGATTGTGGAACTGGAAAAGCAACTCATGCAGAGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
381518 GAAGCCATGTCCAAGATTGTGGAACTGGAAAAGCAACTCATGCAGAGGAA
1400 . : . : . : . : . :
1293 CAAGGAGCTGGATGTCGTTCGG GAAATCTACAAAGATGCAA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
381568 CAAGGAGCTGGATGTCGTTCGGGTA...CAGGAAATCTACAAAGATGCAA
1450 . : . : . : . : . :
1334 ATACTCAAGTTCACACATTAAGAAAAATGGTCAAAGAAAAAGAAGAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383262 ATACTCAAGTTCACACATTAAGAAAAATGGTCAAAGAAAAAGAAGAAGCA
1500 . : . : . : . : . :
1384 ATTCAAAGACAGTCTACCCTGGAAAAAAAGATTCATGAGCTAGAGAAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383312 ATTCAAAGACAGTCTACCCTGGAAAAAAAGATTCATGAGCTAGAGAAACA
1550 . : . : . : . : . :
1434 AGGGACCATTAAAATTCAGAAGAAAGGGGATGGGGATATCGCCATACTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383362 AGGGACCATTAAAATTCAGAAGAAAGGGGATGGGGATATCGCCATACTGC
1600 . : . : . : . : . :
1484 CAGTTGTGGCTTCTGGCACATTGTCCATGGGGTCAGAAGTGGTAGCAGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383412 CAGTTGTGGCTTCTGGCACATTGTCCATGGGGTCAGAAGTGGTAGCAGGT
1650 . : . : . : . : . :
1534 AACTCTGTGGGACCCACAATGGGGGCCGCTTCCTCAGGACCCTTGCCCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
383462 AACTCTGTGGGACCCACAATGGGGGCCGCTTCCTCAGGACCCTTGCCCCC
1700 . : . : . : . : . :
1584 TCCTCCACCACCACTGCCTCCCTCATCAGACACACCTGAAACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
383512 TCCTCCACCACCACTGCCTCCCTCATCAGACACACCTGAAACAGGTA...
1750 . : . : . : . : . :
1628 TGCAAAATGGTCCAGTAACACCACCTATGCCACCGCCGCCGCCGCCA
>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||---
383903 TAGTGCAAAATGGTCCAGTAACACCACCTATGCCACCGCCGCCGCCG
1800 . : . : . : . : . :
1675 CCCCCTCCTCCACCTCCTCCTCCCCCACCGCCCCCTCCCCCTCCTCCTCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
383950 CCCCCTCCTCCACCTCCTCCTCCCCCACCGCCCCCTCCGCCTCCTCCTCT
1850 . : . : . : . : . :
1725 CCCAGGCCCTGCATCTGAGACTGTACCAGCTCCTCCCTTAGCACCTCCCC
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
384000 CCCAGGCCCTGCAGCTGAGACTGTACCAGCTCCTCCCTTAGCACCTCCCC
1900 . : . : . : . : . :
1775 TTCCCTCTGCACCTCCGCTGCCTGGAACATCTTCACCCACAGTGGTTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
384050 TTCCCTCTGCACCTCCGCTGCCTGGAACATCTTCACCCACAGTGGTTTTC
1950 . : . : . : . : . :
1825 AACTCAGGATTAGCAG CTGTGAAAATTAAGAAGCCAATCAA
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
384100 AACTCAGGATTAGCAGGTA...TAGCTGTGAAAATTAAGAAGCCAATCAA
2000 . : . : . : . : . :
1866 GACGAAGTTCAGAATGCCAGTGTTTAACTGGGTTGCTCTGAAGCCCAATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
389860 GACGAAGTTCAGAATGCCAGTGTTTAACTGGGTTGCTCTGAAGCCCAATC
2050 . : . : . : . : . :
1916 AGATCAATGGCACAGTCTTCAATGAAATTGATGATGAGCGAATTCTGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
389910 AGATCAATGGCACAGTCTTCAATGAAATTGATGATGAGCGAATTCTGGAG
2100 . : . : . : . : . :
1966 GATTTAAATGTGGATGAATTTGAGGAAATATTCAAGACAAA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
389960 GTA...TAGGATTTAAATGTGGATGAATTTGAGGAAATATTCAAGACAAA
2150 . : . : . : . : . :
2007 AGCCCAAGGACCTGCCATTGATCTTTCTTCAAGCAAACAGAAGATACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
390963 AGCCCAAGGACCTGCCATTGATCTTTCTTCAAGCAAACAGAAGATACCAC
2200 . : . : . : . : . :
2057 AGAAGGGATCAAACAAAGTGACATTACTAGAAGCAAACAGGGCCAAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
391013 AGAAGGGATCAAACAAAGTGACATTACTAGAAGCAAACAGGGCCAAAAAT
2250 . : . : . : . : . :
2107 CTTGCCATAACTTTAAGGAAAGCTGGAAAGACTGCTGATGAAATATGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
391063 CTTGCCATAACTTTAAGGAAAGCTGGAAAGACTGCTGATGAAATATGTAA
2300 . : . : . : . : . :
2157 AGCTATTCATGT ATTTGACTTGAAGACACTGCCTGTGGACT
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
391113 AGCTATTCATGTGTA...TAGATTTGACTTGAAGACACTGCCTGTGGACT
2350 . : . : . : . : . :
2198 TTGTGGAATGCTTGATGCGGTTCCTACCAACTGAGAATGAAGTGAAAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
392725 TTGTGGAATGCTTGATGCGGTTCCTACCAACTGAGAATGAAGTGAAAGTG
2400 . : . : . : . : . :
2248 CTTCGGCTCTACGAGCGGGAAAGGAAGCCTCTGGAAAACTTGTCAGATGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
392775 CTTCGGCTCTACGAGCGGGAAAGGAAGCCTCTGGAAAACTTGTCAGATGA
2450 . : . : . : . : . :
2298 AGATCGGTTCATGATGCAGTTTAGTAAAATCGAGAGGCTCATGCAGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
392825 AGATCGGTTCATGATGCAGTTTAGTAAAATCGAGAGGCTCATGCAGAAGA
2500 . : . : . : . : . :
2348 TGACCATCATGGCCTTCATTGGGAACTTTGCTGAAAGCATTCAGATGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
392875 TGACCATCATGGCCTTCATTGGGAACTTTGCTGAAAGCATTCAGATGCTG
2550 . : . : . : . : . :
2398 ACTCCT CAACTACATGCGATTATAGCAGCATCTGTCTCTAT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
392925 ACTCCTGTG...TAGCAACTACATGCGATTATAGCAGCATCTGTCTCTAT
2600 . : . : . : . : . :
2439 AAAGTCGTCCCAAAAACTCAAGAAAATTCTGGAG ATCATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
394088 AAAGTCGTCCCAAAAACTCAAGAAAATTCTGGAGGCA...CAGATCATCT
2650 . : . : . : . : . :
2480 TAGCCCTTGGAAACTACATGAATAGCAGTAAAAGAGGAGCAGTTTATGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
394229 TAGCCCTTGGAAACTACATGAATAGCAGTAAAAGAGGAGCAGTTTATGGA
2700 . : . : . : . : . :
2530 TTTAAACTTCAGAGTTTAGATCTG CTCTTAGATACAAAGTC
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
394279 TTTAAACTTCAGAGTTTAGATCTGGTG...CAGCTCTTAGATACAAAGTC
2750 . : . : . : . : . :
2571 AACAGACAGAAAGCAAACACTGTTGCACTATATATCCAATGTGGTGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396422 AACAGACAGAAAGCAAACACTGTTGCACTATATATCCAATGTGGTGAAAG
2800 . : . : . : . : . :
2621 AAAAATATCACCAAGTGTCCCTGTTTTATAATGAGCTTCATTATGTGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
396472 AAAAATATCACCAAGTGTCCCTGTTTTATAATGAGCTTCATTATGTGGAA
2850 . : . : . : . : . :
2671 AAAGCTGCTGCAG TCTCCCTTGAGAATGTTTTGCTGGATGT
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
396522 AAAGCTGCTGCAGGTA...TAGTCTCCCTTGAGAATGTTTTGCTGGATGT
2900 . : . : . : . : . :
2712 CAAGGAGCTCCAGAGGGGAATGGACTTGACCAAGAGAGAGTACACCATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
400852 CAAGGAGCTCCAGAGGGGAATGGACTTGACCAAGAGAGAGTACACCATGC
2950 . : . : . : . : . :
2762 ATGACCATAACACGCTGCTGAAGGAGTTCATCCTCAACAATGAGGGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
400902 ATGACCATAACACGCTGCTGAAGGAGTTCATCCTCAACAATGAGGGGAAG
3000 . : . : . : . : . :
2812 CTGAAGAAGCTGCAGGATGATGCCAAGATCGCACAG GATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
400952 CTGAAGAAGCTGCAGGATGATGCCAAGATCGCACAGGCA...CAGGATGC
3050 . : . : . : . : . :
2853 CTTTGATGATGTTGTGAAGTATTTTGGAGAAAACCCCAAGACAACACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
401975 CTTTGATGATGTTGTGAAGTATTTTGGAGAAAACCCCAAGACAACACCAC
3100 . : . : . : . : . :
2903 CCTCTGTCTTCTTTCCTGTCTTTGTCCGGTTTGTGAAAGCATATAAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
402025 CCTCTGTCTTCTTTCCTGTCTTTGTCCGGTTTGTGAAAGCATATAAGGTA
3150 . : . : . : . : . :
2950 CAAGCAGAAGAGGAAAATGAGCTGAGGAAAAAGCAGGAACAAGC
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
402075 ...CAGCAAGCAGAAGAGGAAAATGAGCTGAGGAAAAAGCAGGAACAAGC
3200 . : . : . : . : . :
2994 TCTCATGGAAAAACTCCTAGAGCAAGAAGCTCTGATGGAGCAGCAGGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404399 TCTCATGGAAAAACTCCTAGAGCAAGAAGCTCTGATGGAGCAGCAGGATC
3250 . : . : . : . : . :
3044 CAAAG TCTCCTTCTCATAAATCAAAGAGGCAGCAGCAAGAG
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404449 CAAAGGTA...CAGTCTCCTTCTCATAAATCAAAGAGGCAGCAGCAAGAG
3300 . : . : . : . : . :
3085 TTAATTGCAGAATTAAGAAGACGACAAGTTAAAGATAACAGACATGTATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405224 TTAATTGCAGAATTAAGAAGACGACAAGTTAAAGATAACAGACATGTATA
3350 . : . : . : . : . :
3135 TGAGGGAAAAGATGGTGCCATTGAAGATATTATCACAG ATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
405274 TGAGGGAAAAGATGGTGCCATTGAAGATATTATCACAGGTA...CAGATC
3400 . : . : . : . : . :
3176 TTAGAAACCAACCATACAGACGAGCCGATGCGGTGAGGAGAAGCGTCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
412196 TTAGAAACCAACCATACAGACGAGCCGATGCGGTGAGGAGAAGCGTCAGG
3450 . : . : . : . : . :
3226 CGGCGCTTTGATGATCAGAACTTGCGTTCTGTTAATGGTGCCGAAATAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
412246 CGGCGCTTTGATGATCAGAACTTGCGTTCTGTTAATGGTGCCGAAATAAC
3500
3276 AATG
||||
412296 AATG