seq1 = pF1KA1861.tfa, 2871 bp
seq2 = pF1KA1861/gi568815591f_93139864.tfa (gi568815591f:93139864_93458433), 318570 bp

>pF1KA1861 2871
>gi568815591f:93139864_93458433 (Chr7)

11-81  (100001-100071)   100% ->
82-204  (112790-112912)   100% ->
205-276  (113997-114068)   100% ->
277-330  (116646-116699)   100% ->
331-401  (117531-117601)   100% ->
402-519  (118296-118413)   100% ->
520-555  (118494-118529)   100% ->
556-638  (119687-119769)   100% ->
639-681  (131357-131399)   100% ->
682-780  (132772-132870)   100% ->
781-921  (136302-136442)   100% ->
922-1054  (151840-151972)   100% ->
1055-1146  (154682-154773)   100% ->
1147-1241  (156879-156973)   100% ->
1242-1340  (157282-157380)   100% ->
1341-1431  (163597-163687)   100% ->
1432-1608  (165965-166141)   100% ->
1609-1727  (168961-169079)   100% ->
1728-1834  (171303-171409)   100% ->
1835-1956  (183748-183869)   100% ->
1957-2037  (194254-194334)   100% ->
2038-2186  (201564-201712)   100% ->
2187-2283  (208848-208944)   100% ->
2284-2442  (210012-210170)   100% ->
2443-2564  (213777-213898)   100% ->
2565-2754  (216028-216217)   100% ->
2755-2871  (218454-218570)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     11 AGGGTCTGAAAAGCCCTCAAGAAAGCCTCAGTGATCTTGGTGCCATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGGGTCTGAAAAGCCCTCAAGAAAGCCTCAGTGATCTTGGTGCCATAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     61 AGTCTCCGGGTCCCTGGAAAG         GAAGAATTCAGGGAACTTCG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 AGTCTCCGGGTCCCTGGAAAGGTA...AAGGAAGAATTCAGGGAACTTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    102 AGAACAGCCAAGTGACCCTCAAGCTGAACAAGAGCTTATTAATAGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112810 AGAACAGCCAAGTGACCCTCAAGCTGAACAAGAGCTTATTAATAGTATTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    152 AACAAGTATATTTTTCTGTGGATTCATTTGATATTGTTAAATATGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112860 AACAAGTATATTTTTCTGTGGATTCATTTGATATTGTTAAATATGAGCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    202 GAG         AAGCTTCCACCTGTTCTCAATTTGCAAGAATTAGAGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112910 GAGGTA...TAGAAGCTTCCACCTGTTCTCAATTTGCAAGAATTAGAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    243 GTATAGAGACAAATTGAAACAACAGCAAGCTGCA         GTATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 114035 GTATAGAGACAAATTGAAACAACAGCAAGCTGCAGTA...TAGGTATCTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    284 AAAAAGTGGCAGATTTAATCCTTGAAAAACAGCCTGCTTATGTAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116653 AAAAAGTGGCAGATTTAATCCTTGAAAAACAGCCTGCTTATGTAAAGGTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331       GAACTTGAAAGAGTTACCTCATTGCAGACAGGTCTTCAATTAGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116703 ...TAGGAACTTGAAAGAGTTACCTCATTGCAGACAGGTCTTCAATTAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    375 TGCTGTTATCTGTACAAATGGGAGAAG         ACACTTGAATATTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 117575 TGCTGTTATCTGTACAAATGGGAGAAGGTA...CAGACACTTGAATATTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    416 CAAAGGAAGGTTTTACTCAAGCTAGTTTAGGCCTTCTTGCAAATCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118310 CAAAGGAAGGTTTTACTCAAGCTAGTTTAGGCCTTCTTGCAAATCAAAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    466 AAACGTCAGTTGCTGATTGGACTTCTGAAATCTCTGAGAACTATAAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118360 AAACGTCAGTTGCTGATTGGACTTCTGAAATCTCTGAGAACTATAAAAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    516 ATTG         CAAAGAACAGATGTACGGTTAAGTGAAATGCTGGAG 
        ||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 118410 ATTGGTA...CAGCAAAGAACAGATGTACGGTTAAGTGAAATGCTGGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556         GAGGAAGATTATCCAGGAGCTATTCAGTTGTGCCTTGAATGT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118531 TA...AAGGAGGAAGATTATCCAGGAGCTATTCAGTTGTGCCTTGAATGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598 CAAAAAGCTGCCAGCACTTTTAAACATTACAGTTGTATAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 119729 CAAAAAGCTGCCAGCACTTTTAAACATTACAGTTGTATAAGGTA...TAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    639 TGAACTGAATTCAAAGCTGCAAGATACTTTGGAACAGATTGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 131357 TGAACTGAATTCAAAGCTGCAAGATACTTTGGAACAGATTGAGGTA...T

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    682   GAACAGCTGGACGTAGCTCTTTCCAAAATCTGCAAGAATTTTGACATT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132770 AGGAACAGCTGGACGTAGCTCTTTCCAAAATCTGCAAGAATTTTGACATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    730 AACCATTATACCAAGGTTCAACAAGCTTATCGACTTCTTGGAAAAACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132820 AACCATTATACCAAGGTTCAACAAGCTTATCGACTTCTTGGAAAAACACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    780 G         ACAGCAATGGATCAACTTCATATGCACTTCACCCAAGCCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132870 GGTT...CAGACAGCAATGGATCAACTTCATATGCACTTCACCCAAGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    821 TTCACAACACCGTGTTTCAAGTTGTTCTTGGTTATGTGGAACTATGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136342 TTCACAACACCGTGTTTCAAGTTGTTCTTGGTTATGTGGAACTATGTGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    871 GGAAACACAGACACAAAATTCCAAAAGCTGCAATATAAGGATCTCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136392 GGAAACACAGACACAAAATTCCAAAAGCTGCAATATAAGGATCTCTGTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    921 A         CATGTTACACCAGACAGCTATATTCCATGCCTTGCAGACC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136442 AGTA...TAGCATGTTACACCAGACAGCTATATTCCATGCCTTGCAGACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    962 TGTGCAAAGCACTATGGGAAGTTATGCTCAGCTATTATAGGACTATGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151880 TGTGCAAAGCACTATGGGAAGTTATGCTCAGCTATTATAGGACTATGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1012 TGGCATGAAAAGCATGACAATGAGGATACTGCTTCAGCTTCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 151930 TGGCATGAAAAGCATGACAATGAGGATACTGCTTCAGCTTCTGGTA...C

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1055   AAGGGAGTAATATGATAGGTACTGAAGAAACTAATTTTGATCGTGGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154680 AGAAGGGAGTAATATGATAGGTACTGAAGAAACTAATTTTGATCGTGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1103 ACATAAAAAAGAAATTAGAACATGGACTTACACGAATATGGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 154730 ACATAAAAAAGAAATTAGAACATGGACTTACACGAATATGGCAGGTT...

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147    GATGTTCAGCTAAAAGTAAAAACCTACTTGCTTGGAACTGATTTGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156876 CAGGATGTTCAGCTAAAAGTAAAAACCTACTTGCTTGGAACTGATTTGTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1194 TATATTCAAATATGATGATTTCATCTTTGTTTTGGATATAATCAGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 156926 TATATTCAAATATGATGATTTCATCTTTGTTTTGGATATAATCAGCAGGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242        GTTGATGCAAGTTGGAGAAGAATTTTGTGGTAGCAAGTCTGAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156976 A...TAGGTTGATGCAAGTTGGAGAAGAATTTTGTGGTAGCAAGTCTGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1285 GTTTTACAGGAATCTATTAGAAAACAAAGTGTCAATTATTTCAAGAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157325 GTTTTACAGGAATCTATTAGAAAACAAAGTGTCAATTATTTCAAGAATTA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1335 CCATAG         AACACGGCTCGATGAACTGAGAATGTTCTTAGAGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157375 CCATAGGTA...AAGAACACGGCTCGATGAACTGAGAATGTTCTTAGAGA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1376 ATGAGACTTGGGAACTTTGTCCTGTTAAGTCAAATTTCAGCATCTTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163632 ATGAGACTTGGGAACTTTGTCCTGTTAAGTCAAATTTCAGCATCTTGCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1426 CTTCAT         GAATTTAAATTCATGGAACAGTCTCGCTCCCCATC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163682 CTTCATGTA...TAGGAATTTAAATTCATGGAACAGTCTCGCTCCCCATC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1467 AGTTTCACCTAGTAAACAGCCAGTCTCAACTTCTTCAAAAACAGTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166000 AGTTTCACCTAGTAAACAGCCAGTCTCAACTTCTTCAAAAACAGTGACCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1517 TGTTTGAGCAGTACTGTAGTGGTGGGAATCCATTTGAAATTCAGGCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 166050 TGTTTGAGCAGTACTGTAGTGGTGGGAATCCATTTGAAATTCAGGCCAAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1567 CACAAAGATGAAGAAACAGAAGATGTCTTAGCTTCTAATGGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 166100 CACAAAGATGAAGAAACAGAAGATGTCTTAGCTTCTAATGGGGTA...CA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1609  TATGAATCTGATGAACAAGAAAAGAGTGCCTATCAAGAGTATGACAGTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168960 GTATGAATCTGATGAACAAGAAAAGAGTGCCTATCAAGAGTATGACAGTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1658 ACAGTGATGTTCCTGAGGAACTCAAACGAGACTATGTGGATGAGCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 169010 ACAGTGATGTTCCTGAGGAACTCAAACGAGACTATGTGGATGAGCAGACA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1708 GGAGATGGTCCTGTGAAAAG         TGTTTCTCGGGAAACTCTAAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 169060 GGAGATGGTCCTGTGAAAAGGTG...AAGTGTTTCTCGGGAAACTCTAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1749 AAGCAGGAAGAAATCAGATTACAGTCTAAATAAAGTGAATGCACCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171324 AAGCAGGAAGAAATCAGATTACAGTCTAAATAAAGTGAATGCACCTATCT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1799 TAACAAATACAACATTGAACGTCATAAGACTTGTTG         GAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 171374 TAACAAATACAACATTGAACGTCATAAGACTTGTTGGTA...CAGGAAAA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1840 TATATGCAGATGATGAACATTCTTAAGCCAATTGCCTTTGATGTTATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183753 TATATGCAGATGATGAACATTCTTAAGCCAATTGCCTTTGATGTTATTCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1890 TTTCATGTCTCAACTATTTGATTATTACTTGTATGCAATATATACCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183803 TTTCATGTCTCAACTATTTGATTATTACTTGTATGCAATATATACCTTTT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1940 TTGGTCGGAATGATTCA         TTGGAATCAACTGGACTCGGCCTT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 183853 TTGGTCGGAATGATTCAGTA...CAGTTGGAATCAACTGGACTCGGCCTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1981 AGTAGTAGTAGACTAAGAACAACTCTAAACAGAATACAAGAAAGCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194278 AGTAGTAGTAGACTAAGAACAACTCTAAACAGAATACAAGAAAGCCTTAT

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2031 TGATCTA         GAAGTTTCAGCTGATCCTACTGCCACACTCACAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194328 TGATCTAGTA...CAGGAAGTTTCAGCTGATCCTACTGCCACACTCACAG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2072 CAGCAGAAGAAAGAAAGGAGAAGGTGCCAAGTCCACACCTCAGTCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201598 CAGCAGAAGAAAGAAAGGAGAAGGTGCCAAGTCCACACCTCAGTCACCTA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2122 GTGGTTTTGACATCTGGGGATACGCTGTATGGGTTGGCAGAAAGAGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201648 GTGGTTTTGACATCTGGGGATACGCTGTATGGGTTGGCAGAAAGAGTGGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2172 AGCCACGGAATCCTT         GGTATTCTTGGCTGAACAGTTTGAGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 201698 AGCCACGGAATCCTTGTA...TAGGGTATTCTTGGCTGAACAGTTTGAGT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2213 TCCTTCAGCCACATCTGGATGCTGTGATGCCTGCAGTCAAAAAGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208874 TCCTTCAGCCACATCTGGATGCTGTGATGCCTGCAGTCAAAAAGCCCTTT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2263 CTTCAGCAGTTCTATTCTCAG         ACAGTCTCAACCGCCAGTGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 208924 CTTCAGCAGTTCTATTCTCAGGTC...CAGACAGTCTCAACCGCCAGTGA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2304 ACTACGGAAACCAATTTACTGGATTGTAGCTGGTAAAGCCCTTGATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210032 ACTACGGAAACCAATTTACTGGATTGTAGCTGGTAAAGCCCTTGATTATG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2354 AACAGATGCTGCTTCTCATGGCTAATGTGAAATGGGATGTAAAAGAAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210082 AACAGATGCTGCTTCTCATGGCTAATGTGAAATGGGATGTAAAAGAAATT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2404 ATGTCACAGCACAACATATATGTAGATGCACTATTAAAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 210132 ATGTCACAGCACAACATATATGTAGATGCACTATTAAAGGCA...TAGGA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2445 ATTTGAGCAGTTTAACAGGAGGCTAAATGAAGTTTCTAAGAGAGTTCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213779 ATTTGAGCAGTTTAACAGGAGGCTAAATGAAGTTTCTAAGAGAGTTCGCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2495 TACCCTTGCCTGTGTCTAATATACTTTGGGAACATTGTATACGATTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213829 TACCCTTGCCTGTGTCTAATATACTTTGGGAACATTGTATACGATTGGCT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2545 AATCGAACTATTGTAGAAGG         ATATGCCAATGTCAAGAAATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 213879 AATCGAACTATTGTAGAAGGGTA...TAGATATGCCAATGTCAAGAAATG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2586 CAGTAATGAGGGTCGTGCCCTGATGCAATTGGATTTTCAACAGTTTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216049 CAGTAATGAGGGTCGTGCCCTGATGCAATTGGATTTTCAACAGTTTTTAA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2636 TGAAACTTGAAAAACTAACAGATATTAGACCCATTCCTGATAAAGAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216099 TGAAACTTGAAAAACTAACAGATATTAGACCCATTCCTGATAAAGAATTT

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2686 GTAGAAACTTATATTAAAGCTTATTACCTAACTGAGAATGACATGGAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216149 GTAGAAACTTATATTAAAGCTTATTACCTAACTGAGAATGACATGGAACG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2736 GTGGATCAAAGAGCACAGG         GAATATTCAACGAAGCAGCTGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 216199 GTGGATCAAAGAGCACAGGGTG...CAGGAATATTCAACGAAGCAGCTGA

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2777 CCAATCTGGTGAATGTTTGCCTGGGATCCCATATCAATAAGAAAGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218476 CCAATCTGGTGAATGTTTGCCTGGGATCCCATATCAATAAGAAAGCAAGA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   2827 CAAAAACTTCTAGCAGCTATAGATGATATAGACAGACCTAAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 218526 CAAAAACTTCTAGCAGCTATAGATGATATAGACAGACCTAAAAGA