Result of SIM4 for
pF1KA1838
seq1 = pF1KA1838.tfa, 2730 bp
seq2 = pF1KA1838/gi568815592f_170217391.tfa (gi568815592f:170217391_170504587), 287197 bp
>pF1KA1838 2730
>gi568815592f:170217391_170504587 (Chr6)
1-1734 (100001-101734) 100% ->
1735-1915 (105689-105869) 99% ->
1916-2017 (113059-113160) 100% ->
2018-2190 (130761-130933) 100% ->
2191-2283 (140836-140928) 100% ->
2284-2490 (170897-171103) 100% ->
2491-2599 (173623-173731) 100% ->
2600-2692 (178097-178189) 100% ->
2693-2730 (187160-187197) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGGTGTGAGAGGTTTGCAAGGATTTGTGGGAAGTACCTGCCCACATAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGGGTGTGAGAGGTTTGCAAGGATTTGTGGGAAGTACCTGCCCACATAT
50 . : . : . : . : . :
51 ATGTACAGTAGTAAATTTCAAAGAACTGGCAGAGCACCACCGAAGCAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 ATGTACAGTAGTAAATTTCAAAGAACTGGCAGAGCACCACCGAAGCAAGT
100 . : . : . : . : . :
101 ATCCTGGATGTACCCCTACCATTGTGGTTGATGCCATGTGTTGTCTCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 ATCCTGGATGTACCCCTACCATTGTGGTTGATGCCATGTGTTGTCTCAGA
150 . : . : . : . : . :
151 TATTGGTATACTCCAGAATCTTGGATCTGCGGTGGCCAGTGGCGAGAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 TATTGGTATACTCCAGAATCTTGGATCTGCGGTGGCCAGTGGCGAGAATA
200 . : . : . : . : . :
201 CTTTTCTGCTTTGCGAGATTTTGTTAAAACTTTTACGGCAGCTGGGATCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CTTTTCTGCTTTGCGAGATTTTGTTAAAACTTTTACGGCAGCTGGGATCA
250 . : . : . : . : . :
251 AGTTGATATTCTTCTTTGATGGCATGGTGGAGCAGGATAAGAGAGATGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AGTTGATATTCTTCTTTGATGGCATGGTGGAGCAGGATAAGAGAGATGAA
300 . : . : . : . : . :
301 TGGGTGAAACGAAGGCTCAAGAACAACAGGGAGATATCCAGGATTTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 TGGGTGAAACGAAGGCTCAAGAACAACAGGGAGATATCCAGGATTTTTCA
350 . : . : . : . : . :
351 TTACATCAAGTCACACAAGGAGCAGCCAGGCAGAAATATGTTCTTCATCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 TTACATCAAGTCACACAAGGAGCAGCCAGGCAGAAATATGTTCTTCATCC
400 . : . : . : . : . :
401 CCTCAGGGCTAGCTGTGTTTACACGATTTGCTCTAAAGACACTGGGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CCTCAGGGCTAGCTGTGTTTACACGATTTGCTCTAAAGACACTGGGCCAG
450 . : . : . : . : . :
451 GAAACTTTGTGTTCTTTGCAGGAAGCAGATTATGAGGTAGCTTCCTATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 GAAACTTTGTGTTCTTTGCAGGAAGCAGATTATGAGGTAGCTTCCTATGG
500 . : . : . : . : . :
501 CCTCCAGCATAACTGTCTTGGGATTCTGGGGGAAGACACTGATTACCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 CCTCCAGCATAACTGTCTTGGGATTCTGGGGGAAGACACTGATTACCTAA
550 . : . : . : . : . :
551 TCTATGACACTTGTCCCTACTTTTCAATTAGCGAGCTCTGCCTAGAGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 TCTATGACACTTGTCCCTACTTTTCAATTAGCGAGCTCTGCCTAGAGAGC
600 . : . : . : . : . :
601 CTGGACACCGTCATGCTCTGCAGAGAGAAGCTCTGTGAGAGTCTGGGCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 CTGGACACCGTCATGCTCTGCAGAGAGAAGCTCTGTGAGAGTCTGGGCCT
650 . : . : . : . : . :
651 CTGTGTGGCCGACCTTCCTCTTCTGGCCTGCCTCCTTGGCAACGACATAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 CTGTGTGGCCGACCTTCCTCTTCTGGCCTGCCTCCTTGGCAACGACATAA
700 . : . : . : . : . :
701 TCCCAGAGGGCATGTTTGAAAGCTTTAGGTACAAATGCTTATCGTCCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 TCCCAGAGGGCATGTTTGAAAGCTTTAGGTACAAATGCTTATCGTCCTAC
750 . : . : . : . : . :
751 ACCTCTGTAAAAGAGAACTTTGACAAAAAAGGTAACATCATATTAGCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 ACCTCTGTAAAAGAGAACTTTGACAAAAAAGGTAACATCATATTAGCTGT
800 . : . : . : . : . :
801 GTCAGACCATATATCGAAAGTTCTTTACTTGTATCAAGGTGAGAAAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 GTCAGACCATATATCGAAAGTTCTTTACTTGTATCAAGGTGAGAAAAAAT
850 . : . : . : . : . :
851 TAGAAGAGATATTACCTCTGGGACCAAACAAAGCTCTTTTTTATAAAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100851 TAGAAGAGATATTACCTCTGGGACCAAACAAAGCTCTTTTTTATAAAGGA
900 . : . : . : . : . :
901 ATGGCATCATATCTTTTACCAGGACAAAAATCTCCATGGTTTTTCCAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100901 ATGGCATCATATCTTTTACCAGGACAAAAATCTCCATGGTTTTTCCAAAA
950 . : . : . : . : . :
951 ACCCAAAGGTGTAATAACTTTGGACAAACAAGTAATATCCACGAGTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100951 ACCCAAAGGTGTAATAACTTTGGACAAACAAGTAATATCCACGAGTTCAG
1000 . : . : . : . : . :
1001 ACGCCGAATCCAGGGAAGAAGTTCCCATGTGTTCAGATGCTGAATCCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101001 ACGCCGAATCCAGGGAAGAAGTTCCCATGTGTTCAGATGCTGAATCCAGG
1050 . : . : . : . : . :
1051 CAAGAAGTTCCCATGTGTACAGGCCCTGAATCCAGGCGAGAAGTTCCCGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101051 CAAGAAGTTCCCATGTGTACAGGCCCTGAATCCAGGCGAGAAGTTCCCGT
1100 . : . : . : . : . :
1101 GTATACAGATTCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTGTTCAGACCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101101 GTATACAGATTCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTGTTCAGACCCTG
1150 . : . : . : . : . :
1151 AACCCAGGCAAGAAGTTCCCACGTGTACAGGCCCTGAATCCAGGCGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101151 AACCCAGGCAAGAAGTTCCCACGTGTACAGGCCCTGAATCCAGGCGAGAA
1200 . : . : . : . : . :
1201 GTTCCCATGTGTTCAGACCCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101201 GTTCCCATGTGTTCAGACCCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTGTAC
1250 . : . : . : . : . :
1251 AGGCCCTGAAGCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGACTCTGAACCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101251 AGGCCCTGAAGCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGACTCTGAACCCA
1300 . : . : . : . : . :
1301 GGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGACTCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101301 GGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGACTCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCC
1350 . : . : . : . : . :
1351 ATGTATACAGGCTCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101351 ATGTATACAGGCTCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGGCCC
1400 . : . : . : . : . :
1401 TGAATCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGGCCCTGAATCCAGGCAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101401 TGAATCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTATACAGGCCCTGAATCCAGGCAAG
1450 . : . : . : . : . :
1451 AAGTTTTAATACGGACAGACCCTGAATCTAGGCAAGAAATTATGTGTACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101451 AAGTTTTAATACGGACAGACCCTGAATCTAGGCAAGAAATTATGTGTACA
1500 . : . : . : . : . :
1501 GGCCATGAATCCAAACAGGAAGTTCCCATATGTACAGATCCTATATCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101501 GGCCATGAATCCAAACAGGAAGTTCCCATATGTACAGATCCTATATCCAA
1550 . : . : . : . : . :
1551 GCAAGAAGACTCCATGTGTACACACGCTGAAATCAATCAAAAATTACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101551 GCAAGAAGACTCCATGTGTACACACGCTGAAATCAATCAAAAATTACCTG
1600 . : . : . : . : . :
1601 TAGCAACAGATTTTGAATTTAAGCTAGAAGCTCTCATGTGTACAAACCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101601 TAGCAACAGATTTTGAATTTAAGCTAGAAGCTCTCATGTGTACAAACCCT
1650 . : . : . : . : . :
1651 GAAATTAAACAAGAAGACCCCACAAATGTGGGGCCTGAAGTAAAGCAACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101651 GAAATTAAACAAGAAGACCCCACAAATGTGGGGCCTGAAGTAAAGCAACA
1700 . : . : . : . : . :
1701 AGTAACCATGGTTTCAGACACTGAAATCTTAAAG GTTGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
101701 AGTAACCATGGTTTCAGACACTGAAATCTTAAAGGTA...CAGGTTGCTA
1750 . : . : . : . : . :
1742 GAACACATCACGTCCAAGCAGAAAGCTACCTGGTGTACAACATCATGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105696 GAACACATCACGTCCAAGCAGAAAGCTACCTGGTGTACAACATCATGAGC
1800 . : . : . : . : . :
1792 AGTGGAGAGATTGAATGCAGCAACACCCTAGAAGATGAGCTTGACCAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105746 AGTGGAGAGATTGAATGCAGCAACACCCTAGAAGATGAGCTTGACCAGGC
1850 . : . : . : . : . :
1842 CTTACCCAGCCAGGCCTTCATTTACCGTCCCATTCGACAGCGGGTCTACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105796 CTTACCCAGCCAGGCCTTCATTTACCGTCCCATTCGACAGCGGGTCTACT
1900 . : . : . : . : . :
1892 CACTCTTACTGGGGGACTGTCAAG ATGTCACCAGCACCTGC
|||||||||||| |||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
105846 CACTCTTACTGGAGGACTGTCAAGGTG...CAGATGTCACCAGCACCTGC
1950 . : . : . : . : . :
1933 CTAGCTGTCAAGGAGTGGTTTGTGTATCCTGGGAACCCACTGAGGCACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113076 CTAGCTGTCAAGGAGTGGTTTGTGTATCCTGGGAACCCACTGAGGCACCC
2000 . : . : . : . : . :
1983 GGACCTCGTCAGGCCGCTGCAGATGACCATTCCAG GGGGAA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
113126 GGACCTCGTCAGGCCGCTGCAGATGACCATTCCAGGTA...TAGGGGGAA
2050 . : . : . : . : . :
2024 CGCCTAGTTTGAAAATATTATGGCTGAACCAAGAGCCAGAAATACAGGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130767 CGCCTAGTTTGAAAATATTATGGCTGAACCAAGAGCCAGAAATACAGGTT
2100 . : . : . : . : . :
2074 CGGCGCTTGGACACACTCCTAGCCTGTTTCAATCTTTCCTCCTCAAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130817 CGGCGCTTGGACACACTCCTAGCCTGTTTCAATCTTTCCTCCTCAAGAGA
2150 . : . : . : . : . :
2124 AGAGCTGCAGGCTGTCGAAAGCCCATTTCAAGCTTTGTGCTGCCTCTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130867 AGAGCTGCAGGCTGTCGAAAGCCCATTTCAAGCTTTGTGCTGCCTCTTGA
2200 . : . : . : . : . :
2174 TCTACCTCTTTGTCCAG GTGGACACGCTTTGCCTGGAGGAT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
130917 TCTACCTCTTTGTCCAGGTA...CAGGTGGACACGCTTTGCCTGGAGGAT
2250 . : . : . : . : . :
2215 TTGCATGCGTTTATTGCGCAGGCCTTGTGCCTCCAAGGAAAATCCACCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140860 TTGCATGCGTTTATTGCGCAGGCCTTGTGCCTCCAAGGAAAATCCACCTC
2300 . : . : . : . : . :
2265 GCAGCTTGTAAATCTACAG CCTGATTACATCAACCCCAGAG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
140910 GCAGCTTGTAAATCTACAGGTA...CAGCCTGATTACATCAACCCCAGAG
2350 . : . : . : . : . :
2306 CCGTGCAGCTGGGCTCCCTTCTCGTCCGCGGCCTCACCACTCTGGTTTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170919 CCGTGCAGCTGGGCTCCCTTCTCGTCCGCGGCCTCACCACTCTGGTTTTA
2400 . : . : . : . : . :
2356 GTCAACAGCGCATGTGGCTTCCCCTGGAAGACGAGTGATTTCATGCCCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
170969 GTCAACAGCGCATGTGGCTTCCCCTGGAAGACGAGTGATTTCATGCCCTG
2450 . : . : . : . : . :
2406 GAATGTATTTGACGGGAAGCTTTTTCATCAGAAGTACTTGCAATCTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
171019 GAATGTATTTGACGGGAAGCTTTTTCATCAGAAGTACTTGCAATCTGAAA
2500 . : . : . : . : . :
2456 AGGGTTATGCTGTGGAGGTTCTTTTAGAACAAAAT AGATCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
171069 AGGGTTATGCTGTGGAGGTTCTTTTAGAACAAAATGTG...CAGAGATCT
2550 . : . : . : . : . :
2497 CGGCTCACCAAATTCCACAACCTGAAGGCAGTCGTCTGCAAGGCCTGCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173629 CGGCTCACCAAATTCCACAACCTGAAGGCAGTCGTCTGCAAGGCCTGCAT
2600 . : . : . : . : . :
2547 GAAGGAGAACAGACGCATCACTGGCCGAGCCCACTGGGGCTCACACCACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173679 GAAGGAGAACAGACGCATCACTGGCCGAGCCCACTGGGGCTCACACCACG
2650 . : . : . : . : . :
2597 CAG GGAGGTGGGGAAGACAGGGCTCCAGCTACCACAGGACG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
173729 CAGGTG...CAGGGAGGTGGGGAAGACAGGGCTCCAGCTACCACAGGACG
2700 . : . : . : . : . :
2638 GGCTCTGGGTATAGCCGTTCCAGTCAGGGACAGCCGTGGAGAGACCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178135 GGCTCTGGGTATAGCCGTTCCAGTCAGGGACAGCCGTGGAGAGACCAGGG
2750 . : . : . : . : . :
2688 ACCAG GAAGCAGACAGTATGAGCATGACCAGTGGAGAAGGT
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
178185 ACCAGGTA...CAGGAAGCAGACAGTATGAGCATGACCAGTGGAGAAGGT
2800
2729 AC
||
187196 AC