seq1 = pF1KA1780.tfa, 3420 bp
seq2 = pF1KA1780/gi568815593f_127231309.tfa (gi568815593f:127231309_127557281), 325973 bp

>pF1KA1780 3420
>gi568815593f:127231309_127557281 (Chr5)

1-116  (100001-100116)   100% ->
117-218  (107812-107913)   100% ->
219-319  (109222-109322)   100% ->
320-412  (138602-138694)   100% ->
413-659  (165224-165470)   100% ->
660-780  (167368-167488)   100% ->
781-917  (171238-171374)   100% ->
918-1130  (179081-179293)   99% ->
1131-1305  (186330-186504)   100% ->
1306-1426  (187812-187932)   100% ->
1427-1590  (188736-188899)   100% ->
1591-1693  (191362-191464)   100% ->
1694-1840  (202055-202201)   100% ->
1841-1975  (203379-203513)   100% ->
1976-2104  (204053-204181)   100% ->
2105-2233  (207131-207259)   100% ->
2234-2362  (209431-209559)   100% ->
2363-2491  (211690-211818)   100% ->
2492-2728  (214149-214385)   100% ->
2729-2856  (216249-216376)   100% ->
2857-2980  (217791-217914)   100% ->
2981-3025  (223258-223302)   100% ->
3026-3232  (224093-224299)   100% ->
3233-3420  (225820-226007)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTATTTCTTTGAACTCATGCCTGAGCTTTATTTGTTTATTGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTATTTCTTTGAACTCATGCCTGAGCTTTATTTGTTTATTGTTATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACTGGATTGGGACAGCATCACCTCTGAATCTTGAAGACCCTAATGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCACTGGATTGGGACAGCATCACCTCTGAATCTTGAAGACCCTAATGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTAGCCACTGGGAAAG         CTACTCAGTGACTGTGCAAGAGTCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100101 GTAGCCACTGGGAAAGGTA...CAGCTACTCAGTGACTGTGCAAGAGTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TACCCACATCCCTTTGATCAAATTTACTACACGAGCTGCACTGACATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107837 TACCCACATCCCTTTGATCAAATTTACTACACGAGCTGCACTGACATTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAACTGGTTTAAATGCACGCGGCACAG         AGTCAGCTATCGGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107887 AAACTGGTTTAAATGCACGCGGCACAGGTA...TAGAGTCAGCTATCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGCCTATCGACATGGGGAGAAGACTATGTATAGGCGCAAGTCTCAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109236 CAGCCTATCGACATGGGGAGAAGACTATGTATAGGCGCAAGTCTCAGTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTCCTGGATTTTATGAAAGCGGGGAAATGTGTGTCC         CCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 109286 TGTCCTGGATTTTATGAAAGCGGGGAAATGTGTGTCCGTA...CAGCCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTGTGCTGATAAATGTGTCCATGGTCGCTGTATTGCTCCAAACACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138606 CTGTGCTGATAAATGTGTCCATGGTCGCTGTATTGCTCCAAACACCTGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGTGTGAGCCTGGCTGGGGAGGGACCAACTGCTCCAGTG         CC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 138656 AGTGTGAGCCTGGCTGGGGAGGGACCAACTGCTCCAGTGGTA...CAGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TGCGATGGTGATCACTGGGGTCCCCACTGCACCAGCCGGTGCCAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165226 TGCGATGGTGATCACTGGGGTCCCCACTGCACCAGCCGGTGCCAGTGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAATGGGGCTCTGTGCAACCCCATCACCGGGGCTTGCCACTGTGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165276 AAATGGGGCTCTGTGCAACCCCATCACCGGGGCTTGCCACTGTGCTGCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GCTTCCGGGGCTGGCGCTGCGAGGACCGCTGTGAGCAGGGCACCTATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165326 GCTTCCGGGGCTGGCGCTGCGAGGACCGCTGTGAGCAGGGCACCTATGGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AACGACTGTCATCAGAGATGCCAGTGCCAGAATGGAGCCACCTGCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165376 AACGACTGTCATCAGAGATGCCAGTGCCAGAATGGAGCCACCTGCGACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTCACGGGGGAATGCCGCTGCCCACCAGGATACACCGGAGCCTT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 165426 CGTCACGGGGGAATGCCGCTGCCCACCAGGATACACCGGAGCCTTGTA..

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    660     CTGTGAGGATCTTTGTCCTCCTGGTAAACATGGTCCACAGTGTGAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165476 .CAGCTGTGAGGATCTTTGTCCTCCTGGTAAACATGGTCCACAGTGTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CAGAGATGCCCTTGTCAAAATGGAGGAGTGTGTCATCACGTCACTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 167414 CAGAGATGCCCTTGTCAAAATGGAGGAGTGTGTCATCACGTCACTGGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATGCTCTTGCCCTTCTGGCTGGATG         GGCACAGTGTGTGGTC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 167464 ATGCTCTTGCCCTTCTGGCTGGATGGTA...CAGGGCACAGTGTGTGGTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCCTTGCCCCGAGGGTCGCTTTGGAAAGAACTGTTCCCAAGAATGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171254 AGCCTTGCCCCGAGGGTCGCTTTGGAAAGAACTGTTCCCAAGAATGCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TGCCATAATGGAGGGACGTGTGATGCTGCCACAGGCCAATGTCATTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171304 TGCCATAATGGAGGGACGTGTGATGCTGCCACAGGCCAATGTCATTGCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TCCAGGATACACAGGGGAACG         GTGCCAGGATGAGTGTCCTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 171354 TCCAGGATACACAGGGGAACGGTA...TAGGTGCCAGGATGAGTGTCCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TTGGGACCTATGGCGTTCTCTGTGCTGAGACCTGCCAGTGTGTCAACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179101 TTGGGACCTATGGCGTTCTCTGTGCTGAGACCTGCCAGTGTGTCAACGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GGGAAGTGTTACCACGTGAGCGGCGCATGCCTCTGTGAAGCAGGCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179151 GGGAAGTGTTACCACGTGAGCGGCGCATGCCTCTGTGAAGCAGGCTTTGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGGCGAGCGCTGCGAAGCACGCCTGTGTCCTGAGGGGCTCTACGGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179201 TGGCGAGCGCTGCGAAGCACGCCTGTGTCCTGAGGGGCTCTACGGCATCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AATGTGACAAACGGTGTCCCTGCCACTTGGAAAACACTCATAG       
        |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||>>>...>
 179251 AATGTGACAAACGGTGTCCCTGCCACCTGGAAAACACTCATAGGTG...C

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1131   CTGTCACCCCATGTCTGGAGAGTGTGCCTGCAAGCCGGGCTGGTCAGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186328 AGCTGTCACCCCATGTCTGGAGAGTGTGCCTGCAAGCCGGGCTGGTCAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 ACTCTACTGTAATGAGACATGTTCTCCTGGATTCTACGGGGAAGCTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186378 ACTCTACTGTAATGAGACATGTTCTCCTGGATTCTACGGGGAAGCTTGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 AGCAGATCTGCAGCTGCCAAAATGGGGCAGACTGTGACAGTGTGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186428 AGCAGATCTGCAGCTGCCAAAATGGGGCAGACTGTGACAGTGTGACTGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AAGTGCACCTGTGCCCCAGGATTCAAA         GGAATTGACTGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 186478 AAGTGCACCTGTGCCCCAGGATTCAAAGTG...TAGGGAATTGACTGCTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TACCCCATGCCCTCTGGGAACCTATGGGATAAACTGTTCCTCTCGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187826 TACCCCATGCCCTCTGGGAACCTATGGGATAAACTGTTCCTCTCGCTGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GCTGTAAAAATGATGCAGTCTGCTCTCCTGTGGACGGGTCTTGTACTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187876 GCTGTAAAAATGATGCAGTCTGCTCTCCTGTGGACGGGTCTTGTACTTGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 AAGGCAG         GCTGGCACGGGGTGGACTGCTCCATCAGATGTCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 187926 AAGGCAGGTA...CAGGCTGGCACGGGGTGGACTGCTCCATCAGATGTCC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CAGTGGCACATGGGGCTTTGGCTGTAACTTAACATGCCAGTGCCTCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188770 CAGTGGCACATGGGGCTTTGGCTGTAACTTAACATGCCAGTGCCTCAACG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GGGGAGCCTGCAACACCCTGGACGGGACCTGCACGTGTGCACCTGGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188820 GGGGAGCCTGCAACACCCTGGACGGGACCTGCACGTGTGCACCTGGATGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CGCGGGGAGAAATGCGAACTTCCCTGCCAG         GATGGCACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 188870 CGCGGGGAGAAATGCGAACTTCCCTGCCAGGTA...CAGGATGGCACGTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CGGGCTGAACTGTGCTGAGCGCTGCGACTGCAGCCACGCAGATGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191373 CGGGCTGAACTGTGCTGAGCGCTGCGACTGCAGCCACGCAGATGGCTGCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACCCTACCACGGGCCATTGCCGCTGCCTCCCCGGATGGTCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 191423 ACCCTACCACGGGCCATTGCCGCTGCCTCCCCGGATGGTCAGGTG...CA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1694  GTGTCCACTGTGACAGCGTGTGTGCTGAGGGACGCTGGGGCCCCAACTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202054 GGTGTCCACTGTGACAGCGTGTGTGCTGAGGGACGCTGGGGCCCCAACTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CTCCCTGCCCTGCTACTGTAAAAATGGGGCTTCATGCTCCCCTGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202104 CTCCCTGCCCTGCTACTGTAAAAATGGGGCTTCATGCTCCCCTGATGATG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 GCATCTGCGAGTGTGCACCAGGCTTCCGAGGCACCACTTGTCAGAGGA  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 202154 GCATCTGCGAGTGTGCACCAGGCTTCCGAGGCACCACTTGTCAGAGGAGT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1841        TCTGCTCCCCTGGTTTTTATGGGCATCGCTGCAGCCAGACATG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202204 A...CAGTCTGCTCCCCTGGTTTTTATGGGCATCGCTGCAGCCAGACATG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 CCCACAGTGCGTTCACAGCAGCGGGCCCTGCCACCACATCACCGGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203422 CCCACAGTGCGTTCACAGCAGCGGGCCCTGCCACCACATCACCGGCCTGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1934 GTGACTGCTTGCCTGGCTTCACAGGCGCCCTCTGCAATGAAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 203472 GTGACTGCTTGCCTGGCTTCACAGGCGCCCTCTGCAATGAAGGTA...CA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1976  TGTGTCCCAGTGGCAGATTTGGGAAAAACTGTGCAGGAATTTGTACCTG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204052 GTGTGTCCCAGTGGCAGATTTGGGAAAAACTGTGCAGGAATTTGTACCTG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CACCAACAACGGAACCTGTAACCCCATTGACAGATCTTGTCAGTGTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204102 CACCAACAACGGAACCTGTAACCCCATTGACAGATCTTGTCAGTGTTACC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CCGGTTGGATTGGCAGTGACTGCTCTCAAC         CATGTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 204152 CCGGTTGGATTGGCAGTGACTGCTCTCAACGTA...CAGCATGTCCACCT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2116 GCCCACTGGGGCCCAAACTGCATCCACACGTGCAACTGCCATAATGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207142 GCCCACTGGGGCCCAAACTGCATCCACACGTGCAACTGCCATAATGGAGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 TTTCTGCAGCGCCTACGATGGGGAATGTAAATGCACTCCTGGCTGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207192 TTTCTGCAGCGCCTACGATGGGGAATGTAAATGCACTCCTGGCTGGACAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 GGCTCTACTGCACTCAGA         GATGTCCTCTAGGGTTTTATGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 207242 GGCTCTACTGCACTCAGAGTA...CAGGATGTCCTCTAGGGTTTTATGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 AAAGATTGTGCACTGATATGCCAATGTCAAAACGGAGCTGACTGCGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209454 AAAGATTGTGCACTGATATGCCAATGTCAAAACGGAGCTGACTGCGACCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CATTTCTGGGCAGTGTACTTGCCGCACTGGATTCATGGGACGGCACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209504 CATTTCTGGGCAGTGTACTTGCCGCACTGGATTCATGGGACGGCACTGTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 AGCAGA         AGTGCCCTTCAGGAACATATGGCTATGGCTGTCGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209554 AGCAGAGTA...TAGAGTGCCCTTCAGGAACATATGGCTATGGCTGTCGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CAGATATGTGATTGTCTGAACAACTCCACCTGCGACCACATCACTGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 211725 CAGATATGTGATTGTCTGAACAACTCCACCTGCGACCACATCACTGGGAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 CTGTTACTGCAGCCCCGGATGGAAGGGAGCGAGATGTGATCAAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 211775 CTGTTACTGCAGCCCCGGATGGAAGGGAGCGAGATGTGATCAAGGTA...

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2492    CTGGTGTTATCATAGTTGGAAATCTGAACAGCTTAAGCCGAACCAGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214146 TAGCTGGTGTTATCATAGTTGGAAATCTGAACAGCTTAAGCCGAACCAGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 ACTGCTCTCCCTGCTGATTCCTACCAGATCGGGGCCATTGCAGGCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214196 ACTGCTCTCCCTGCTGATTCCTACCAGATCGGGGCCATTGCAGGCATCAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CATTCTTGTCCTAGTTGTTCTCTTCCTACTGGCATTGTTCATTATTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214246 CATTCTTGTCCTAGTTGTTCTCTTCCTACTGGCATTGTTCATTATTTATA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 GACACAAGCAGAAGGGAAAGGAATCAAGCATGCCAGCAGTTACCTACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 214296 GACACAAGCAGAAGGGAAAGGAATCAAGCATGCCAGCAGTTACCTACACC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 CCTGCTATGAGGGTCGTCAATGCAGATTATACCATTTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 214346 CCTGCTATGAGGGTCGTCAATGCAGATTATACCATTTCAGGTA...CAGG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 AACCCTTCCTCACAGCAATGGTGGAAACGCTAATAGCCACTACTTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216250 AACCCTTCCTCACAGCAATGGTGGAAACGCTAATAGCCACTACTTCACCA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 ATCCCAGTTACCACACGCTCACCCAGTGTGCCACATCCCCTCACGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 216300 ATCCCAGTTACCACACGCTCACCCAGTGTGCCACATCCCCTCACGTCAAC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 AACAGGGACAGGATGACTGTCACGAAG         TCAAAAAACAATCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 216350 AACAGGGACAGGATGACTGTCACGAAGGTG...CAGTCAAAAAACAATCA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2871 ACTGTTTGTGAATCTTAAAAATGTGAACCCTGGGAAGAGAGGCCCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217805 ACTGTTTGTGAATCTTAAAAATGTGAACCCTGGGAAGAGAGGCCCTGTGG

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 GGGACTGCACTGGGACATTGCCGGCTGACTGGAAACATGGCGGCTACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217855 GGGACTGCACTGGGACATTGCCGGCTGACTGGAAACATGGCGGCTACCTC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 AACGAGCTCG         GTGCTTTTGGACTTGACAGAAGCTATATGGG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 217905 AACGAGCTCGGTG...CAGGTGCTTTTGGACTTGACAGAAGCTATATGGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3012 AAAATCCTTAAAAG         ACCTGGGAAAGAATTCTGAATATAATT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 223289 AAAATCCTTAAAAGGTA...CAGACCTGGGAAAGAATTCTGAATATAATT

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3053 CAAGTAACTGCTCCCTAAGCAGTTCTGAGAACCCATATGCCACTATTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224120 CAAGTAACTGCTCCCTAAGCAGTTCTGAGAACCCATATGCCACTATTAAA

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3103 GACCCACCTGTACTTATCCCGAAAAGCTCAGAGTGTGGTTATGTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224170 GACCCACCTGTACTTATCCCGAAAAGCTCAGAGTGTGGTTATGTGGAGAT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3153 GAAATCGCCGGCACGAAGAGATTCCCCATATGCAGAGATCAATAACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 224220 GAAATCGCCGGCACGAAGAGATTCCCCATATGCAGAGATCAATAACTCAA

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3203 CTTCAGCCAACAGGAATGTCTATGAAGTTG         AACCTACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 224270 CTTCAGCCAACAGGAATGTCTATGAAGTTGGTG...CAGAACCTACAGTG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3244 AGTGTTGTCCAAGGAGTATTCAGCAATAATGGGCGTCTCTCCCAGGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225831 AGTGTTGTCCAAGGAGTATTCAGCAATAATGGGCGTCTCTCCCAGGATCC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3294 ATATGACCTCCCAAAGAACAGTCACATCCCTTGTCATTATGACCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225881 ATATGACCTCCCAAAGAACAGTCACATCCCTTGTCATTATGACCTGCTGC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3344 CAGTCCGAGACAGTTCATCCTCCCCTAAGCAAGAGGACAGTGGAGGTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 225931 CAGTCCGAGACAGTTCATCCTCCCCTAAGCAAGAGGACAGTGGTGGTAGC

   3600     .    :    .    :    .
   3394 AGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||
 225981 AGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGTGAA