seq1 = pF1KA1775.tfa, 2577 bp
seq2 = pF1KA1775/gi568815588f_84094761.tfa (gi568815588f:84094761_84314618), 219858 bp

>pF1KA1775 2577
>gi568815588f:84094761_84314618 (Chr10)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-151  (100734-100829)   100% ->
152-297  (101745-101890)   100% ->
298-348  (103026-103076)   100% ->
349-438  (104272-104361)   100% ->
439-525  (105841-105927)   98% ->
526-639  (107047-107160)   100% ->
640-783  (108220-108363)   100% ->
784-862  (109767-109845)   100% ->
863-963  (111067-111167)   100% ->
964-1167  (113414-113617)   100% ->
1168-1320  (113969-114121)   100% ->
1321-1485  (116241-116405)   100% ->
1486-1553  (116888-116955)   100% ->
1554-1782  (117419-117647)   99% ->
1783-2040  (118331-118588)   100% ->
2041-2577  (119322-119858)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGCGCTGCCGGTGGGCCGCCCTGGCCCTGGGGCTGCTGCGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGCGCTGCCGGTGGGCCGCCCTGGCCCTGGGGCTGCTGCGCCTCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGG         CTCAGGCCAACTTCGCCCCGCACTTCTTCGACAACG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGGGTG...CAGCTCAGGCCAACTTCGCCCCGCACTTCTTCGACAACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGTCGGCAGCACCAACGGAAACATGGCTCTGTTCAGCCTCCCAGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100770 GGGTCGGCAGCACCAACGGAAACATGGCTCTGTTCAGCCTCCCAGAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCCCTGTAG         GCTCTCACGTATACACCCTGAATGGGACAGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100820 ACCCCTGTAGGTG...CAGGCTCTCACGTATACACCCTGAATGGGACAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCTGAGGGAGACCCCATCTCCTACCACATCAGCTTTGACCCCAGCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101776 CCCTGAGGGAGACCCCATCTCCTACCACATCAGCTTTGACCCCAGCACTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GAAGCGTCTTTTCTGTTGACCCCACTTTTGGAAACATCACCCTGGTTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101826 GAAGCGTCTTTTCTGTTGACCCCACTTTTGGAAACATCACCCTGGTTGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCTGGACAGAGAG         AGGGAAGATGAGATTGAAGCCATCAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 101876 GAGCTGGACAGAGAGGTA...CAGAGGGAAGATGAGATTGAAGCCATCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAGCATTTCTGATGGCCTGAATCTG         GTGGCCGAAAAAGTCG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103052 CAGCATTTCTGATGGCCTGAATCTGGTG...CAGGTGGCCGAAAAAGTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGATCCTGGTGACCGATGCCAATGATGAGGCGCCCAGGTTCATCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104288 TGATCCTGGTGACCGATGCCAATGATGAGGCGCCCAGGTTCATCCAGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCTTATGTTGCCCTGGTTCCCGAG         GACATACCTGCTGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 104338 CCTTATGTTGCCCTGGTTCCCGAGGTA...CAGGACATACCTGCTGGGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CATCATCTTTAAGGTCCATGCGGTGGACAGGGACACAGGCTCTGGAGGGA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 105858 CATCATCTTTAAGGTCCATGCAGTGGACAGGGACACAGGCTCTGGAGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GTGTCACCTACTTCCTGCAG         AACCTGCACTCCCCATTTGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105908 GTGTCACCTACTTCCTGCAGGTA...TAGAACCTGCACTCCCCATTTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTGGACCGCCACAGCGGTGTGCTGCGCCTCCAGGCTGGGGCCACTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107068 GTGGACCGCCACAGCGGTGTGCTGCGCCTCCAGGCTGGGGCCACTCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTACGAGAGGTCCCGGACCCACTACATCACCGTGGTCGCCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107118 CTACGAGAGGTCCCGGACCCACTACATCACCGTGGTCGCCAAGGTA...C

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    640   GATGGCGGTGGGAGGCTTCATGGGGCTGATGTGGTGTTCTCAGCCACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108218 AGGATGGCGGTGGGAGGCTTCATGGGGCTGATGTGGTGTTCTCAGCCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 ACCACGGTCACGGTCAATGTGGAGGATGTTCAGGACATGGCCCCTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108268 ACCACGGTCACGGTCAATGTGGAGGATGTTCAGGACATGGCCCCTGTCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CGTGGGCACACCCTACTATGGCTATGTGTACGAGGACACCCTTCCG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 108318 CGTGGGCACACCCTACTATGGCTATGTGTACGAGGACACCCTTCCGGTG.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    784      GGCTCGGAGGTACTGAAGGTGGTCGCCATGGATGGAGACCGGGGC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108368 ..GAGGGCTCGGAGGTACTGAAGGTGGTCGCCATGGATGGAGACCGGGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAACCCAATCGAATTCTCTACAGCCTTGTAAATG         GGAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 109812 AAACCCAATCGAATTCTCTACAGCCTTGTAAATGGTG...CAGGGAACGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGGAGCCTTTGAAATTAATGAGACATCTGGAGCCATCTCCATCACTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111074 TGGAGCCTTTGAAATTAATGAGACATCTGGAGCCATCTCCATCACTCAGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 GCCCGGCCCAGCTCCAGAGAGAGGTGTATGAGCTGCATGTACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 111124 GCCCGGCCCAGCTCCAGAGAGAGGTGTATGAGCTGCATGTACAGGTA...

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    964    GTGACTGAAATGAGCCCTGCGGGGAGCCCAGCTGCCCAGGCCACCGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113411 CAGGTGACTGAAATGAGCCCTGCGGGGAGCCCAGCTGCCCAGGCCACCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 CCCAGTCACCATCAGGATTGTGGACCTCAACAACCACCCGCCAACATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113461 CCCAGTCACCATCAGGATTGTGGACCTCAACAACCACCCGCCAACATTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATGGAGAGAGCGGACCCCAAAACAGGTTTGAGCTGTCCATGAATGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113511 ATGGAGAGAGCGGACCCCAAAACAGGTTTGAGCTGTCCATGAATGAGCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 CCACCCCAGGGAGAGATCCTGCGGGGCCTCAAGATCACCGTCAATGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113561 CCACCCCAGGGAGAGATCCTGCGGGGCCTCAAGATCACCGTCAATGACTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CGACCAG         GGAGCCAATGCCAAATTCAACTTGCAGCTGGTGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113611 CGACCAGGTG...TAGGGAGCCAATGCCAAATTCAACTTGCAGCTGGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 GACCCAGGGGCATCTTCCGAGTGGTTCCACAGACAGTCCTGAATGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114003 GACCCAGGGGCATCTTCCGAGTGGTTCCACAGACAGTCCTGAATGAAGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CAAGTCACAATCATTGTGGAGAACTCAGCTGCCATTGACTTTGAAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114053 CAAGTCACAATCATTGTGGAGAACTCAGCTGCCATTGACTTTGAAAAGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CAAAGTATTAACCTTCAAG         CTCCTGGCTGTTGAAGTGAACA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 114103 CAAAGTATTAACCTTCAAGGTA...CAGCTCCTGGCTGTTGAAGTGAACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 CCCCAGAGAAGTTCAGTTCCACAGCGGATGTTGTGATCCAGCTCCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116263 CCCCAGAGAAGTTCAGTTCCACAGCGGATGTTGTGATCCAGCTCCTGGAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ACCAATGACAATGTCCCCAAGTTCGACTCCCTCTACTACGTTGCCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116313 ACCAATGACAATGTCCCCAAGTTCGACTCCCTCTACTACGTTGCCAGGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 TCCTGAGAACGCCCCAGGGGGCTCCAGCGTGGTGGCTGTCACA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 116363 TCCTGAGAACGCCCCAGGGGGCTCCAGCGTGGTGGCTGTCACAGTG...C

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1486   GCTGTGGATCCAGATACAGGACCCTGGGGCGAAGTGAAATATTCCACC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116886 AGGCTGTGGATCCAGATACAGGACCCTGGGGCGAAGTGAAATATTCCACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 TATGGGACTGGGGCAGACCT         CTTCCTGATCCACCCATCCAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 116936 TATGGGACTGGGGCAGACCTGTA...CAGCTTCCTGATCCACCCATCCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TGGGCTTATCTACACCCAGCCCTGGGCTAGCCTGGACGCTGAGGCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117440 TGGGCTTATCTACACCCAGCCCTGGGCTAGCCTGGACGCTGAGGCCACTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 CCAGGTACAACTTCTATGTGAAGGCAGAGGACATGGAGGGCAAGTACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 117490 CCAGGTACAACTTCTATGTGAAGGCAGAGGACATGGAAGGCAAGTACAGC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 GTAGCTGAGGTGTTTATCACACTGCTGGATGTCAATGACCACCCCCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117540 GTAGCTGAGGTGTTTATCACACTGCTGGATGTCAATGACCACCCCCCTCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GTTTGGAAAGAGCGTTCAGAAGAAGACGATGGTGCTAGGGACCCCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117590 GTTTGGAAAGAGCGTTCAGAAGAAGACGATGGTGCTAGGGACCCCAGTGA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 AAATTGAG         GCCATAGACGAGGATGCAGAGGAACCCAACAAC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 117640 AAATTGAGGTA...CAGGCCATAGACGAGGATGCAGAGGAACCCAACAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 CTGGTGGACTATTCCATCACCCATGCAGAGCCCGCCAACGTGTTCGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118364 CTGGTGGACTATTCCATCACCCATGCAGAGCCCGCCAACGTGTTCGACAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 CAATTCCCACACGGGGGAGATCTGGCTCAAGAATTCCATCCGCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118414 CAATTCCCACACGGGGGAGATCTGGCTCAAGAATTCCATCCGCTCCCTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ATGCCCTGCACAACATCACACCTGGAAGGGACTGCCTATGGTCCCTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118464 ATGCCCTGCACAACATCACACCTGGAAGGGACTGCCTATGGTCCCTAGAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1966 GTGCAGGCCAAGGACCGGGGCTCCCCATCCTTCAGCACCACAGCCTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118514 GTGCAGGCCAAGGACCGGGGCTCCCCATCCTTCAGCACCACAGCCTTACT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2016 CAAGATTGACATCACAGATGCTGAG         ACCCTCTCCCGGAGCC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 118564 CAAGATTGACATCACAGATGCTGAGGTG...CAGACCCTCTCCCGGAGCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 CCATGGCTGCCTTCCTGATACAGACCAAGGACAACCCCATGAAGGCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119338 CCATGGCTGCCTTCCTGATACAGACCAAGGACAACCCCATGAAGGCCGTG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2107 GGTGTGCTGGCCGGCACCATGGCCACCGTCGTGGCCATCACTGTCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119388 GGTGTGCTGGCCGGCACCATGGCCACCGTCGTGGCCATCACTGTCCTCAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2157 CTCCACCGCCACCTTCTGGCGCAACAAGAAGTCTAACAAGGTCCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119438 CTCCACCGCCACCTTCTGGCGCAACAAGAAGTCTAACAAGGTCCTGCCAA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2207 TGCGGCGGGTGCTCCGCAAGCGGCCCAGCCCTGCGCCCCGCACCATCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119488 TGCGGCGGGTGCTCCGCAAGCGGCCCAGCCCTGCGCCCCGCACCATCCGC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2257 ATTGAGTGGCTCAAGTCCAAGAGCACCAAAGCCGCTACCAAGTTCATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119538 ATTGAGTGGCTCAAGTCCAAGAGCACCAAAGCCGCTACCAAGTTCATGCT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 CAAAGAGAAACCTCCCAATGAGAACTGTAACAACAACAGCCCAGAAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119588 CAAAGAGAAACCTCCCAATGAGAACTGTAACAACAACAGCCCAGAAAGCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CTCTGCTCCCGAGAGCTCCGGCTCTCCCTCCACCACCCAGCGTGGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119638 CTCTGCTCCCGAGAGCTCCGGCTCTCCCTCCACCACCCAGCGTGGCGCCC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 AGCACTGGCGCAGCCCAGTGGACCGTGCCTACCGTCTCTGGCTCTCTCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 119688 AGCACTGGCGCAGCCCAGTGGACCGTGCCTACTGTCTCTGGCTCTCTCAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 TCCGCAGCCGACCCAACCCCCGCCAAAACCCAAAACTATGGGAAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119738 TCCGCAGCCGACCCAACCCCCGCCAAAACCCAAAACTATGGGAAGCCCCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TCCAGTCAACTCTGATCTCTGAGCTCAAGCAAAAGTTTGAGAAGAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119788 TCCAGTCAACTCTGATCTCTGAGCTCAAGCAAAAGTTTGAGAAGAAGAGT

   2700     .    :    .    :
   2557 GTGCACAACAAGGCTTACTTC
        |||||||||||||||||||||
 119838 GTGCACAACAAGGCTTACTTC