seq1 = pF1KA1625.tfa, 2271 bp
seq2 = pF1KA1625/gi568815591r_98930587.tfa (gi568815591r:98930587_99243780), 313194 bp

>pF1KA1625 2271
>gi568815591r:98930587_99243780 (Chr7)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-94  (181944-181982)   100% ->
95-203  (183074-183182)   100% ->
204-337  (186230-186363)   100% ->
338-403  (186511-186576)   100% ->
404-479  (188916-188991)   100% ->
480-721  (191335-191576)   100% ->
722-806  (192340-192424)   100% ->
807-884  (192789-192866)   100% ->
885-1031  (194072-194218)   100% ->
1032-1230  (195899-196097)   100% ->
1231-1334  (197980-198083)   100% ->
1335-1449  (201549-201663)   100% ->
1450-1628  (203225-203403)   100% ->
1629-1766  (205256-205393)   100% ->
1767-1887  (206594-206714)   100% ->
1888-2089  (208065-208266)   100% ->
2090-2174  (210660-210744)   100% ->
2175-2271  (213098-213194)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAACCCCGGGACACGCAGGAACGGCTCCAGCATCAAGATCCGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAACCCCGGGACACGCAGGAACGGCTCCAGCATCAAGATCCGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACAG         TGTTATGTGCCAAGAACCTTGCAAAGAAAGACTTCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACAGGTA...TAGTGTTATGTGCCAAGAACCTTGCAAAGAAAGACTTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCA         GGCTCCCTGACCCTTTTGCAAAGATTGTCGTGGATGGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181980 TCAGTA...TAGGGCTCCCTGACCCTTTTGCAAAGATTGTCGTGGATGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCTGGGCAGTGCCACTCAACCGACACTGTGAAAAACACATTGGACCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183112 TCTGGGCAGTGCCACTCAACCGACACTGTGAAAAACACATTGGACCCAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GTGGAACCAGCACTATGATCT         ATATGTTGGGAAAACGGATT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 183162 GTGGAACCAGCACTATGATCTGTG...CAGATATGTTGGGAAAACGGATT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 CGATAACCATTAGCGTGTGGAACCATAAGAAAATTCACAAGAAACAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186250 CGATAACCATTAGCGTGTGGAACCATAAGAAAATTCACAAGAAACAGGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GCTGGCTTCCTGGGCTGTGTGCGGCTGCTCTCCAATGCCATCAGCAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186300 GCTGGCTTCCTGGGCTGTGTGCGGCTGCTCTCCAATGCCATCAGCAGATT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AAAAGATACCGGAT         ACCAGCGTTTGGATCTATGCAAACTAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 186350 AAAAGATACCGGATGTA...CAGACCAGCGTTTGGATCTATGCAAACTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ACCCCTCAGATACTGATGCAGTTCGTGGCCAGATAGTGG         TC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 186538 ACCCCTCAGATACTGATGCAGTTCGTGGCCAGATAGTGGGTA...TAGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 AGTTTACAGACACGAGACAGAATAGGAACCGGCGGCTCGGTGGTGGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188918 AGTTTACAGACACGAGACAGAATAGGAACCGGCGGCTCGGTGGTGGACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CAGAGGACTGTTAGAAAATGAAGG         AACGGTGTATGAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 188968 CAGAGGACTGTTAGAAAATGAAGGGTA...CAGAACGGTGTATGAAGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CCGGGCCTGGGAGGCCGCTCAGCTGCTTCATGGAGGAACCAGCCCCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191352 CCGGGCCTGGGAGGCCGCTCAGCTGCTTCATGGAGGAACCAGCCCCTTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 ACAGATAGCACCGGTGCTGCTGCTGGAGGAGGGAATTGCAGGTTCGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191402 ACAGATAGCACCGGTGCTGCTGCTGGAGGAGGGAATTGCAGGTTCGTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 GTCCCCAAGTCAAGATCAAAGACTTCAGGCACAGCGGCTTCGAAACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191452 GTCCCCAAGTCAAGATCAAAGACTTCAGGCACAGCGGCTTCGAAACCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATGTGCGAGGTTCACTACAGACGCCCCAGAACCGACCACACGGCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191502 ATGTGCGAGGTTCACTACAGACGCCCCAGAACCGACCACACGGCCACCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCCCCGGAACTGCCCGAAGGCTACG         AACAAAGAACAACAGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 191552 TCCCCGGAACTGCCCGAAGGCTACGGTG...TAGAACAAAGAACAACAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CCAGGGCCAAGTTTACTTTTTGCATACACAGACTGGAGTTAGCACGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192356 CCAGGGCCAAGTTTACTTTTTGCATACACAGACTGGAGTTAGCACGTGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ACGACCCCAGGATACCAAG         TCCCTCGGGGACCATTCCTGGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 192406 ACGACCCCAGGATACCAAGGTA...CAGTCCCTCGGGGACCATTCCTGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GGAGATGCAGCTTTTCTATACGAATTCCTTCTACAAGGCCATACATCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192811 GGAGATGCAGCTTTTCTATACGAATTCCTTCTACAAGGCCATACATCTGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GCCCAG         AGACCTTAACAGTGTGAACTGTGATGAACTTGGAC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192861 GCCCAGGTT...TAGAGACCTTAACAGTGTGAACTGTGATGAACTTGGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CACTGCCGCCAGGCTGGGAAGTCAGAAGTACAGTTTCTGGGAGGATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194107 CACTGCCGCCAGGCTGGGAAGTCAGAAGTACAGTTTCTGGGAGGATATAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TTTGTAGATCATAATAACCGAACAACCCAGTTTACAGACCCAAGGTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 194157 TTTGTAGATCATAATAACCGAACAACCCAGTTTACAGACCCAAGGTTACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CCACATCATGAA         TCACCAGTGCCAACTCAAGGAGCCCAGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 194207 CCACATCATGAAGTA...AAGTCACCAGTGCCAACTCAAGGAGCCCAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 AGCCGCTGCCACTGCCCAGTGAGGGCTCTCTGGAGGACGAGGAGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195928 AGCCGCTGCCACTGCCCAGTGAGGGCTCTCTGGAGGACGAGGAGCTTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GCCCAGAGATACGAAAGAGATCTAGTCCAGAAGCTGAAAGTCCTCAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 195978 GCCCAGAGATACGAAAGAGATCTAGTCCAGAAGCTGAAAGTCCTCAGACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CGAACTGTCGCTTCAGCAGCCCCAAGCTGGTCATTGCCGCATCGAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196028 CGAACTGTCGCTTCAGCAGCCCCAAGCTGGTCATTGCCGCATCGAAGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CCAGAGAAGAAATCTTTGAG         GAGTCTTACCGCCAGATAATG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 196078 CCAGAGAAGAAATCTTTGAGGTA...CAGGAGTCTTACCGCCAGATAATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AAGATGCGACCGAAAGACTTGAAAAAACGGCTGATGGTGAAATTCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198001 AAGATGCGACCGAAAGACTTGAAAAAACGGCTGATGGTGAAATTCCGTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GGAAGAAGGTTTGGATTACGGTGGTGTGGCCAG         GGAGTGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 198051 GGAAGAAGGTTTGGATTACGGTGGTGTGGCCAGGTG...CAGGGAGTGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TTTACTTGCTGTGCCATGAAATGCTGAATCCTTATTACGGGCTCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201557 TTTACTTGCTGTGCCATGAAATGCTGAATCCTTATTACGGGCTCTTCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TATTCTACGGACAATATTTACATGTTGCAAATAAATCCGGATTCTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201607 TATTCTACGGACAATATTTACATGTTGCAAATAAATCCGGATTCTTCAAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 CAACCCC         GACCACTTGTCTTATTTCCACTTTGTGGGGCGGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201657 CAACCCCGTA...CAGGACCACTTGTCTTATTTCCACTTTGTGGGGCGGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 TCATGGGGCTGGCTGTGTTCCATGGACACTACATCAACGGGGGCTTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203259 TCATGGGGCTGGCTGTGTTCCATGGACACTACATCAACGGGGGCTTCACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GTGCCCTTCTACAAGCAGCTGCTGGGGAAGCCCATCCAGCTCTCAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203309 GTGCCCTTCTACAAGCAGCTGCTGGGGAAGCCCATCCAGCTCTCAGATCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1584 GGAATCTGTGGACCCAGAGCTGCATAAGAGCTTGGTGTGGATCCT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 203359 GGAATCTGTGGACCCAGAGCTGCATAAGAGCTTGGTGTGGATCCTGTA..

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629     AGAGAACGACATCACGCCTGTACTGGACCACACCTTCTGCGTGGAA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203409 .CAGAGAGAACGACATCACGCCTGTACTGGACCACACCTTCTGCGTGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 CACAACGCCTTCGGGCGGATCCTGCAGCATGAACTGAAACCCAATGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205302 CACAACGCCTTCGGGCGGATCCTGCAGCATGAACTGAAACCCAATGGCAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 AAATGTGCCAGTCACAGAGGAGAATAAGAAAGAATACGTCCG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 205352 AAATGTGCCAGTCACAGAGGAGAATAAGAAAGAATACGTCCGGTA...CA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1767  GTTGTATGTAAACTGGAGGTTTATGAGAGGAATCGAAGCCCAGTTCTTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206593 GGTTGTATGTAAACTGGAGGTTTATGAGAGGAATCGAAGCCCAGTTCTTA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1816 GCTCTGCAGAAGGGGTTCAATGAGCTCATCCCTCAACATCTGCTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206643 GCTCTGCAGAAGGGGTTCAATGAGCTCATCCCTCAACATCTGCTGAAGCC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 TTTTGACCAGAAGGAACTGGAG         CTGATCATAGGCGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 206693 TTTTGACCAGAAGGAACTGGAGGTA...CAGCTGATCATAGGCGGCCTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1907 ATAAAATAGACTTGAACGACTGGAAGTCGAACACGCGGCTGAAGCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208084 ATAAAATAGACTTGAACGACTGGAAGTCGAACACGCGGCTGAAGCACTGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1957 GTGGCCGACAGCAACATCGTGCGGTGGTTCTGGCAAGCGGTGGAGACGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208134 GTGGCCGACAGCAACATCGTGCGGTGGTTCTGGCAAGCGGTGGAGACGTT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 CGATGAAGAAAGGAGGGCCAGGCTCCTGCAGTTTGTGACTGGGTCCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208184 CGATGAAGAAAGGAGGGCCAGGCTCCTGCAGTTTGTGACTGGGTCCACGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GAGTCCCGCTCCAAGGCTTCAAGGCTTTGCAAG         GTTCTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 208234 GAGTCCCGCTCCAAGGCTTCAAGGCTTTGCAAGGTG...AAGGTTCTACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2098 GGCGCGGCAGGGCCCCGGCTGTTCACCATCCACCTGATAGACGCGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210668 GGCGCGGCAGGGCCCCGGCTGTTCACCATCCACCTGATAGACGCGAACAC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 AGACAACCTTCCGAAGGCCCATACCTG         CTTTAACCGGATCG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 210718 AGACAACCTTCCGAAGGCCCATACCTGGTA...CAGCTTTAACCGGATCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2189 ACATTCCACCATATGAGTCCTATGAGAAGCTCTACGAGAAGCTGCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213112 ACATTCCACCATATGAGTCCTATGAGAAGCTCTACGAGAAGCTGCTGACA

   2400     .    :    .    :    .    :
   2239 GCCGTGGAGGAGACCTGCGGGTTTGCTGTGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 213162 GCCGTGGAGGAGACCTGCGGGTTTGCTGTGGAG