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seq2 = pF1KA1526/gi568815589r_114302757.tfa (gi568815589r:114302757_114604801), 302045 bp

>pF1KA1526 2721
>gi568815589r:114302757_114604801 (Chr9)

(complement)

1-618  (100001-100618)   99% ->
619-837  (126031-126249)   100% ->
838-963  (138410-138535)   100% ->
964-1166  (178389-178591)   100% ->
1167-1203  (179778-179814)   100% ->
1204-1416  (180256-180468)   99% ->
1417-1626  (181279-181488)   100% ->
1627-1698  (196784-196855)   100% ->
1699-2236  (197910-198447)   100% ->
2237-2418  (200725-200906)   100% ->
2419-2541  (201463-201585)   100% ->
2542-2721  (201866-202045)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACGCGCCGCTGGACGGCCTGTCGGTGAGCTCGTCCTCCACCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACGCGCCGCTGGACGGCCTGTCGGTGAGCTCGTCCTCCACCGGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGGCTCGGCGGCCGGGGCGGGCGGCGGCGGGGGCGCGGGGCTGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGGCTCGGCGGCCGGGGCGGGCGGCGGCGGGGGCGCGGGGCTGCGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACTGTCTGCCAACGTACGCCAGCTGCACCAAGCGCTGACCGCGCTGCTG
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACTGTCTGCCAACGTGCGCCAGCTGCACCAAGCGCTGACCGCGCTGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCGAGGCGGAGCGGGAGCAGTTCACCCACTGCCTGAACGCTTACCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCGAGGCGGAGCGGGAGCAGTTCACCCACTGCCTGAACGCTTACCACGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCCGCAACGTCTTCGACCTGGTGCGCACCCTGCGCGTGCTGCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCCGCAACGTCTTCGACCTGGTGCGCACCCTGCGCGTGCTGCTGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTCCGGTCAAGCGGCGCCTGCTGCCCATGCTTCGTCTGGTCATCCCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTCCGGTCAAGCGGCGCCTGCTGCCCATGCTTCGTCTGGTCATCCCGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCGACCAGCTGCTCTTCGACCAATACACGGCCGAGGGCCTCTACCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCGACCAGCTGCTCTTCGACCAATACACGGCCGAGGGCCTCTACCTGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCACCACCCCCTACAGGCAGCCCGCCTGGGGCGGCCCCGACAGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGCCACCACCCCCTACAGGCAGCCCGCCTGGGGCGGCCCCGACAGCGCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCCAGGGGAGGTGCGCCTGGTGAGTTTGCGGCGTGCCAAGGCCCACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCCAGGGGAGGTGCGCCTGGTGAGTTTGCGGCGTGCCAAGGCCCACGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTTGGGCTTCAGCATCCGTGGGGGCTCGGAGCACGGCGTGGGCATCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTTGGGCTTCAGCATCCGTGGGGGCTCGGAGCACGGCGTGGGCATCTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGTGTCTCTGGTGGAACCAGGCTCTCTAGCTGAGAAGGAAGGACTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGTGTCTCTGGTGGAACCAGGCTCTCTAGCTGAGAAGGAAGGACTGCGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCGGGGACCAGATTCTGCGCGTCAACGACAAATCCCTGGCCCGGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCGGGGACCAGATTCTGCGCGTCAACGACAAATCCCTGGCCCGGGTGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACGCGGAGGCCGTCAAG         GCTCTGAAGGGCTCCAAGAAGCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100601 CACGCGGAGGCCGTCAAGGTA...TAGGCTCTGAAGGGCTCCAAGAAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGTGCTGTCTGTGTACTCAGCAGGGCGCATCCCTGGGGGCTACGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126054 GGTGCTGTCTGTGTACTCAGCAGGGCGCATCCCTGGGGGCTACGTCACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACCACATCTACACCTGGGTGGACCCGCAGGGCCGCAGCATCTCCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126104 ACCACATCTACACCTGGGTGGACCCGCAGGGCCGCAGCATCTCCCCACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TCGGGCCTGCCCCAGCCCCACGGTGGTGCCCTGAGGCAGCAGGAGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126154 TCGGGCCTGCCCCAGCCCCACGGTGGTGCCCTGAGGCAGCAGGAGGGTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CCGGAGGAGCACCCTGCACCTCCTGCAAGGAGGGGATGAGAAAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 126204 CCGGAGGAGCACCCTGCACCTCCTGCAAGGAGGGGATGAGAAAAAGGTG.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838      GTGAACCTGGTGCTGGGGGACGGCCGGTCCCTGGGCCTCACGATC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126254 ..CAGGTGAACCTGGTGCTGGGGGACGGCCGGTCCCTGGGCCTCACGATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CGTGGGGGAGCTGAGTACGGCCTTGGCATTTACATCACTGGCGTGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138455 CGTGGGGGAGCTGAGTACGGCCTTGGCATTTACATCACTGGCGTGGACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AGGCTCTGAAGCAGAAGGCAGCGGGCTCAAG         GTTGGGGACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 138505 AGGCTCTGAAGCAGAAGGCAGCGGGCTCAAGGTG...CAGGTTGGGGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGATTCTAGAAGTGAATGGGCGGAGCTTTCTCAACATCCTACACGACGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178399 AGATTCTAGAAGTGAATGGGCGGAGCTTTCTCAACATCCTACACGACGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GCTGTCAGGCTGCTTAAGTCATCTCGGCACCTCATCCTGACAGTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178449 GCTGTCAGGCTGCTTAAGTCATCTCGGCACCTCATCCTGACAGTGAAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CGTCGGGAGGCTGCCCCATGCCCGCACCACTGTGGACGAGACCAAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 178499 CGTCGGGAGGCTGCCCCATGCCCGCACCACTGTGGACGAGACCAAGTGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCGCCAGTTCCCGGATCAGGGAGACCATGGCGAACTCGGCAGG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 178549 TCGCCAGTTCCCGGATCAGGGAGACCATGGCGAACTCGGCAGGGTC...C

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1167   GTTTCTTGGCGATCTCACAACAGAAGGAATAAACAAG         CC
        >>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 179776 AGGTTTCTTGGCGATCTCACAACAGAAGGAATAAACAAGGTA...CAGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 AGGATTTTACAAGGGCCCAGCCGGCTCCCAGGTGACCCTGAGCAGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180258 AGGATTTTACAAGGGCCCAGCCGGCTCCCAGGTGACCCTGAGCAGCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GGAACCAGACACGAGTGCTGCTGGAGGAGCAGGCTCGGCACCTGCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180308 GGAACCAGACACGAGTGCTGCTGGAGGAGCAGGCTCGGCACCTGCTGAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GAGCAGGAACACGCCACCATGGCCTACTACCTGGATGAGTACCGTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 180358 GAGCAGGAACACGCCACCATGGCCTACTACCTGGATGAGTACCGTGGTGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CAGCGTCTCTGTGGAGGCCCTCGTCATGGCCCTGTTCAAGCTGCTCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 180408 CAGCGTCTCTGTGGAGGCCCTCGTCATGGCCCTGTTCAAGCTGCTCAACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CCCACGCCAAG         TTCTCACTCCTCTCTGAGGTGAGAGGCACC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 180458 CCCACGCCAAGGTG...CAGTTCTCACTCCTCTCTGAGGTGAGAGGCACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 ATTTCCCCGCAAGACCTAGAACGCTTCGACCACCTGGTGCTGAGGCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181309 ATTTCCCCGCAAGACCTAGAACGCTTCGACCACCTGGTGCTGAGGCGTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GATTGAGTCCATGAAGGCGCGGCAGCCCCCAGGCCCCGGGGCTGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181359 GATTGAGTCCATGAAGGCGCGGCAGCCCCCAGGCCCCGGGGCTGGGGACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CCTACTCCATGGTCTCCTACAGTGACACGGGTTCATCCACAGGCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181409 CCTACTCCATGGTCTCCTACAGTGACACGGGTTCATCCACAGGCAGCCAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 GGCACCTCCACCACCGTCAGCTCGGCCAGG         AACACTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 181459 GGCACCTCCACCACCGTCAGCTCGGCCAGGGTG...TAGAACACTCTGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CCTGGAGGAAACTGGCGAGGCTGTCCAGGGCAATATCAACGCCCTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196795 CCTGGAGGAAACTGGCGAGGCTGTCCAGGGCAATATCAACGCCCTCCCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ATGTGTCCGTG         GATGATGTCAGATCCACCTCCCAGGGGCTG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 196845 ATGTGTCCGTGGTA...CAGGATGATGTCAGATCCACCTCCCAGGGGCTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1729 TCAAGCTTCAAGCCACTGCCTCGCCCACCACCTCTGGCCCAAGGCAACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197940 TCAAGCTTCAAGCCACTGCCTCGCCCACCACCTCTGGCCCAAGGCAACGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CCTCCCACTAGGCCAGCCAAGGAAGCTGGGGAGAGAGGACCTCCAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197990 CCTCCCACTAGGCCAGCCAAGGAAGCTGGGGAGAGAGGACCTCCAGCCAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 CTTCCTCCATGCCTTCCTGCTCGGGCACTGTCTTCTCGGCTCCACAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198040 CTTCCTCCATGCCTTCCTGCTCGGGCACTGTCTTCTCGGCTCCACAGAAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 CGCAGCCCGCCAGCGGGCACCGCACCCACCCCAGGGACCTCCTCTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198090 CGCAGCCCGCCAGCGGGCACCGCACCCACCCCAGGGACCTCCTCTGCACA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1929 GGACTTGCCCTCTTCCCCCATCTATGCCTCCGTCTCCCCTGCCAACCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198140 GGACTTGCCCTCTTCCCCCATCTATGCCTCCGTCTCCCCTGCCAACCCCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1979 GCTCCAAGAGGCCGCTGGACGCCCATCTGGCCCTGGTCAACCAACACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198190 GCTCCAAGAGGCCGCTGGACGCCCATCTGGCCCTGGTCAACCAACACCCC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2029 ATCGGCCCCTTCCCACGGGTCCAGTCACCCCCGCACCTGAAAAGCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198240 ATCGGCCCCTTCCCACGGGTCCAGTCACCCCCGCACCTGAAAAGCCCCTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2079 TGCAGAGGCCACAGTGGCTGGGGGCTGCCTTCTGCCCCCATCACCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198290 TGCAGAGGCCACAGTGGCTGGGGGCTGCCTTCTGCCCCCATCACCCTCTG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2129 GCCACCCAGACCAGACAGGCACAAACCAGCACTTTGTCATGGTGGAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198340 GCCACCCAGACCAGACAGGCACAAACCAGCACTTTGTCATGGTGGAGGTC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2179 CACCGCCCCGACAGCGAGCCAGACGTCAATGAAGTGAGGGCGCTGCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198390 CACCGCCCCGACAGCGAGCCAGACGTCAATGAAGTGAGGGCGCTGCCCCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2229 GACGCGCA         CAGCCTCTACGCTCTCCCAGCTCTCGGACAGCG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 198440 GACGCGCAGTG...CAGCAGCCTCTACGCTCTCCCAGCTCTCGGACAGCG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2270 GGCAGACTCTAAGCGAGGACAGTGGTGTGGATGCTGGCGAGGCAGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200758 GGCAGACTCTAAGCGAGGACAGTGGTGTGGATGCTGGCGAGGCAGAGGCC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2320 AGCGCCCCAGGCCGAGGAAGGCAGTCGGTGTCCACCAAGAGCAGGAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200808 AGCGCCCCAGGCCGAGGAAGGCAGTCGGTGTCCACCAAGAGCAGGAGTAG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2370 CAAGGAGCTGCCTCGGAACGAGAGGCCCACAGATGGGGCCAACAAACCG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 200858 CAAGGAGCTGCCTCGGAACGAGAGGCCCACAGATGGGGCCAACAAACCGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2419         CCTGGACTTCTGGAGCCCACGTCCACTCTGGTCCGTGTGAAG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200908 TG...CAGCCTGGACTTCTGGAGCCCACGTCCACTCTGGTCCGTGTGAAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2461 AAAAGTGCGGCCACCCTGGGCATCGCCATCGAGGGTGGCGCCAACACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201505 AAAAGTGCGGCCACCCTGGGCATCGCCATCGAGGGTGGCGCCAACACCCG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2511 CCAGCCCCTGCCTAGGATTGTCACTATTCAG         AGAGGCGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 201555 CCAGCCCCTGCCTAGGATTGTCACTATTCAGGTA...CAGAGAGGCGGCT

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 CAGCTCACAACTGTGGGCAGCTCAAGGTGGGCCACGTGATTCTGGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201876 CAGCTCACAACTGTGGGCAGCTCAAGGTGGGCCACGTGATTCTGGAAGTG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 AATGGGCTGACGCTTCGGGGCAAGGAGCACCGGGAGGCCGCCCGCATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201926 AATGGGCTGACGCTTCGGGGCAAGGAGCACCGGGAGGCCGCCCGCATTAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 CGCCGAGGCCTTCAAGACTAAGGACCGTGACTACATTGACTTTCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201976 CGCCGAGGCCTTCAAGACTAAGGACCGTGACTACATTGACTTTCTGGTCA

   2800     .    :    .    :
   2702 CTGAGTTCAATGTGATGCTC
        ||||||||||||||||||||
 202026 CTGAGTTCAATGTGATGCTC