seq1 = pF1KA1364.tfa, 2844 bp
seq2 = pF1KA1364/gi568815576r_17741779.tfa (gi568815576r:17741779_18006812), 265034 bp

>pF1KA1364 2844
>gi568815576r:17741779_18006812 (Chr22)

(complement)

1-264  (100001-100264)   100% ->
265-472  (101974-102181)   100% ->
473-589  (104066-104182)   100% ->
590-691  (104834-104935)   100% ->
692-847  (105816-105971)   100% ->
848-948  (107265-107365)   100% ->
949-1206  (109832-110089)   100% ->
1207-1322  (110452-110567)   100% ->
1323-1449  (111403-111529)   100% ->
1450-1546  (112909-113005)   100% ->
1547-1694  (115181-115328)   100% ->
1695-1891  (117583-117779)   100% ->
1892-2004  (119378-119490)   100% ->
2005-2067  (119581-119643)   100% ->
2068-2241  (120762-120935)   100% ->
2242-2428  (134790-134976)   99% ->
2429-2517  (140801-140889)   100% ->
2518-2605  (141827-141914)   100% ->
2606-2844  (164796-165034)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGAGGAAGCATGAGACCATGAACCCAGCTCATGTCCTCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGAGGAAGCATGAGACCATGAACCCAGCTCATGTCCTCTTTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGTTTGTCCAGGCCACCACCTGCAAGGGAACCCTCAAGGCTTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGTTTGTCCAGGCCACCACCTGCAAGGGAACCCTCAAGGCTTTCCAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTCTGTGACCACCTGGAACTAAAGCCAAAGGACTACCGCTCCTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTCTGTGACCACCTGGAACTAAAGCCAAAGGACTACCGCTCCTTCTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACAAGCTCAAGTCCAAGCTTAACTACTGGAAAGCCAAAGCCCTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACAAGCTCAAGTCCAAGCTTAACTACTGGAAAGCCAAAGCCCTCTGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAAATTGGACAAACGGGGCAGTCACAAAGACTACAAAAAGGGAAAAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAAATTGGACAAACGGGGCAGTCACAAAGACTACAAAAAGGGAAAAGCGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCACTAACACCAAG         TGTCTCATCATTGGGGCTGGCCCCTGT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCACTAACACCAAGGTA...CAGTGTCTCATCATTGGGGCTGGCCCCTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGTCTCCGTACAGCCATCGACTTATCCTTACTGGGGGCCAAGGTGGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GGTCTCCGTACAGCCATCGACTTATCCTTACTGGGGGCCAAGGTGGTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TATTGAGAAACGAGATGCCTTCTCCCGCAACAACGTCTTGCATCTCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 TATTGAGAAACGAGATGCCTTCTCCCGCAACAACGTCTTGCATCTCTGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CATTCACCATACATGATCTACGAGGTCTGGGTGCCAAGAAGTTCTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 CATTCACCATACATGATCTACGAGGTCTGGGTGCCAAGAAGTTCTATGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGTTCTGTGCTGGAGCCATCGACCATATCA         GTATCCGTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 102151 AAGTTCTGTGCTGGAGCCATCGACCATATCAGTA...CAGGTATCCGTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCTCCAACTAATACTTTTGAAAGTAGCCTTGATCCTAGGCATTGAAATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104076 GCTCCAACTAATACTTTTGAAAGTAGCCTTGATCCTAGGCATTGAAATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ACGTCAATGTGGAATTCCAAGGACTTATACAGCCTCCTGAGGACCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104126 ACGTCAATGTGGAATTCCAAGGACTTATACAGCCTCCTGAGGACCAAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AATGAAC         GGATAGGCTGGCGGGCACTGGTGCACCCCAAGAC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104176 AATGAACGTA...CAGGGATAGGCTGGCGGGCACTGGTGCACCCCAAGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCATCCTGTGTCAGAGTATGAATTTGAAGTGATCATCGGTGGGGATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104868 TCATCCTGTGTCAGAGTATGAATTTGAAGTGATCATCGGTGGGGATGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGAGGAACACCTTGGAAG         GGTTTCGTCGGAAAGAATTCCGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104918 GGAGGAACACCTTGGAAGGTA...CAGGGTTTCGTCGGAAAGAATTCCGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGCAAACTGGCCATCGCCATCACGGCAAATTTTATCAACCGAAATACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105839 GGCAAACTGGCCATCGCCATCACGGCAAATTTTATCAACCGAAATACAAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 AGCAGAAGCTAAAGTGGAAGAGATCAGTGGTGTGGCTTTTATATTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105889 AGCAGAAGCTAAAGTGGAAGAGATCAGTGGTGTGGCTTTTATATTCAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AAAAATTTTTCCAGGAACTGAGGGAAGCCACAG         GTATTGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105939 AAAAATTTTTCCAGGAACTGAGGGAAGCCACAGGTT...CAGGTATTGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTGGAGAACATCGTTTACTACAAAGATGACACACACTATTTCGTTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107273 TTGGAGAACATCGTTTACTACAAAGATGACACACACTATTTCGTTATGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 AGCCAAAAAGCAGAGTTTGCTGGACAAAGGAGTGATACTACAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 107323 AGCCAAAAAGCAGAGTTTGCTGGACAAAGGAGTGATACTACATGTG...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    949   GACTACGCCGACACAGAGCTCCTGCTTTCCCGAGAAAACGTGGACCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109830 AGGACTACGCCGACACAGAGCTCCTGCTTTCCCGAGAAAACGTGGACCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAGGCTCTGCTCAGCTATGCCAGGGAGGCGGCAGACTTCTCTACCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109880 GAGGCTCTGCTCAGCTATGCCAGGGAGGCGGCAGACTTCTCTACCCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCAGCTGCCGTCTCTGGATTTTGCCATCAATCACTATGGGCAGCCCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109930 GCAGCTGCCGTCTCTGGATTTTGCCATCAATCACTATGGGCAGCCCGATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TGGCCATGTTTGACTTCACTTGTATGTATGCCTCCGAGAACGCCGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109980 TGGCCATGTTTGACTTCACTTGTATGTATGCCTCCGAGAACGCCGCCTTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GTGCGGGAGCAGAACGGACACCAGTTACTAGTGGCTCTGGTCGGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110030 GTGCGGGAGCAGAACGGACACCAGTTACTAGTGGCTCTGGTCGGGGACAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CCTCCTAGAG         CCTTTCTGGCCAATGGGAACAGGAATAGCCC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 110080 CCTCCTAGAGGTG...CAGCCTTTCTGGCCAATGGGAACAGGAATAGCCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GGGGCTTTCTAGCTGCTATGGACTCTGCCTGGATGGTCCGAAGTTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110483 GGGGCTTTCTAGCTGCTATGGACTCTGCCTGGATGGTCCGAAGTTGGTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 CTAGGAACGAGCCCTTTGGAAGTGCTGGCAGAGAG         GGAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 110533 CTAGGAACGAGCCCTTTGGAAGTGCTGGCAGAGAGGTA...CAGGGAAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TATTTACAGGTTGCTGCCTCAGACCACCCCTGAGAATGTGAGTAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111409 TATTTACAGGTTGCTGCCTCAGACCACCCCTGAGAATGTGAGTAAGAACT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TCAGCCAGTACAGTATCGACCCTGTCACTCGGTATCCCAATATCAACGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111459 TCAGCCAGTACAGTATCGACCCTGTCACTCGGTATCCCAATATCAACGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AACTTCCTCCGGCCAAGCCAG         GTGCGCCATTTATATGATAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 111509 AACTTCCTCCGGCCAAGCCAGGTA...CAGGTGCGCCATTTATATGATAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGGCGAAACAAAAGATATTCACCTGGAAATGGAGAGCCTGGTGAATTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112929 TGGCGAAACAAAAGATATTCACCTGGAAATGGAGAGCCTGGTGAATTCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GAACCACCCCCAAATTGACTCGCAATG         AGTCTGTAGCTCGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 112979 GAACCACCCCCAAATTGACTCGCAATGGTG...TAGAGTCTGTAGCTCGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 TCAAGCAAACTGCTGGGTTGGTGCCAGAGGCAGACAGATGGCTATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115195 TCAAGCAAACTGCTGGGTTGGTGCCAGAGGCAGACAGATGGCTATGCAGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 GGTAAACGTGACAGATCTCACCATGTCCTGGAAAAGTGGCTTGGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115245 GGTAAACGTGACAGATCTCACCATGTCCTGGAAAAGTGGCTTGGCCCTTT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GTGCAATTATCCATAGATACCGCCCTGACCTGAT         AGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 115295 GTGCAATTATCCATAGATACCGCCCTGACCTGATGTA...CAGAGATTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GATTCTTTGGATGAGCAAAATGTGGAGAAGAATAACCAACTGGCCTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117590 GATTCTTTGGATGAGCAAAATGTGGAGAAGAATAACCAACTGGCCTTTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CATTGCTGAGAAGGAATTGGGCATTTCTCCCATCATGACAGGCAAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117640 CATTGCTGAGAAGGAATTGGGCATTTCTCCCATCATGACAGGCAAAGAAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 TGGCCTCCGTGGGGGAGCCTGATAAGCTGTCCATGGTGATGTACCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117690 TGGCCTCCGTGGGGGAGCCTGATAAGCTGTCCATGGTGATGTACCTGACT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CAGTTCTACGAGATGTTTAAGGACTCCCTCCCCTCTAGCG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 117740 CAGTTCTACGAGATGTTTAAGGACTCCCTCCCCTCTAGCGGTA...CAGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 CACCTTGGACCTAAATGCCGAGGAGAAAGCAGTCCTGATAGCCAGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119379 CACCTTGGACCTAAATGCCGAGGAGAAAGCAGTCCTGATAGCCAGCACCA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 GATCCCCTATCTCCTTCCTAAGCAAACTTGGCCAGACCATCTCTCGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119429 GATCCCCTATCTCCTTCCTAAGCAAACTTGGCCAGACCATCTCTCGGAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 CGTTCTCCCAAG         GATAAAAAGGAAAAGGACTTGGATGGTGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 119479 CGTTCTCCCAAGGTA...CAGGATAAAAAGGAAAAGGACTTGGATGGTGC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TGGGAAGAGGAGAAAGACCAGTCAATCAGAGGAG         GAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 119610 TGGGAAGAGGAGAAAGACCAGTCAATCAGAGGAGGTG...CAGGAGGAAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 CTCCTCGGGGCCACAGAGGAGAAAGACCGACCCTGGTGAGCACTCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120769 CTCCTCGGGGCCACAGAGGAGAAAGACCGACCCTGGTGAGCACTCTGACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 GACAGGAGGATGGACGTTGCCGTTGGGAACCAGAACAAAGTGAAGTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120819 GACAGGAGGATGGACGTTGCCGTTGGGAACCAGAACAAAGTGAAGTACAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 GGCGACCCAGCTGCTGGCCAAATTTGAAGAGAATGCGCCCGCACAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120869 GGCGACCCAGCTGCTGGCCAAATTTGAAGAGAATGCGCCCGCACAGTCCA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2225 TCGGCATACGGAGACAG         GGCTCCATGAAGAAGGAGTTCCCA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| 
 120919 TCGGCATACGGAGACAGGTA...CAGGGCTCCATGAAGAAGGAGTTCCCG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 CAGAACCTGGGAGGCAGCGACACATGCTACTTCTGCCAGAAGCGGGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134814 CAGAACCTGGGAGGCAGCGACACATGCTACTTCTGCCAGAAGCGGGTCTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CGTGATGGAGAGGCTGAGTGCCGAGGGCAAGTTCTTCCACCGGAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134864 CGTGATGGAGAGGCTGAGTGCCGAGGGCAAGTTCTTCCACCGGAGCTGCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TCAAGTGCGAGTACTGCGCCACCACCCTGCGCCTCTCGGCCTACGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134914 TCAAGTGCGAGTACTGCGCCACCACCCTGCGCCTCTCGGCCTACGCCTAC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2416 GACATCGAGGATG         GTAAATTCTACTGTAAGCCACACTACTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 134964 GACATCGAGGATGGTG...CAGGTAAATTCTACTGTAAGCCACACTACTG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2457 CTATCGACTCTCTGGCTACGCACAAAGGAAGAGACCGGCAGTGGCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140829 CTATCGACTCTCTGGCTACGCACAAAGGAAGAGACCGGCAGTGGCTCCCC

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2507 TGTCTGGAAAG         GAGGCCAAAGGACCCCTGCAGGATGGCGCC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 140879 TGTCTGGAAAGGTA...TAGGAGGCCAAAGGACCCCTGCAGGATGGCGCC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 ACCACAGATGCAAACGGACGGGCCAACGCCGTGGCCAGCTCCACTGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141857 ACCACAGATGCAAACGGACGGGCCAACGCCGTGGCCAGCTCCACTGAGAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2598 AACCCCAG         GTTCAGGCGTGAACGGCCTGGAGGAGCCCAGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 141907 AACCCCAGGTA...CAGGTTCAGGCGTGAACGGCCTGGAGGAGCCCAGCA

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 TCGCCAAGCGACTGAGGGGCACCCCAGAGCGGATCGAGCTGGAGAACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164829 TCGCCAAGCGACTGAGGGGCACCCCAGAGCGGATCGAGCTGGAGAACTAC

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 CGCCTGTCCCTGAGGCAGGCTGAGGCACTGCAGGAGGTACCGGAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164879 CGCCTGTCCCTGAGGCAGGCTGAGGCACTGCAGGAGGTACCGGAGGAGAC

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2739 TCAGGCCGAGCACAACCTGAGCAGCGTGCTGGACACGGGCGCCGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164929 TCAGGCCGAGCACAACCTGAGCAGCGTGCTGGACACGGGCGCCGAGGAGG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2789 ACGTCGCCAGCAGGTCAGCACGCAGGGCTGCAGGGCGCCCACCCGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164979 ACGTCGCCAGCAGGTCAGCACGCAGGGCTGCAGGGCGCCCACCCGCCACA

   3000     .
   2839 CGGCCC
        ||||||
 165029 CGGCCC