Result of SIM4 for
pF1KA1346
seq1 = pF1KA1346.tfa, 2901 bp
seq2 = pF1KA1346/gi568815577r_26737582.tfa (gi568815577r:26737582_26944954), 207373 bp
>pF1KA1346 2901
>gi568815577r:26737582_26944954 (Chr21)
(complement)
1-730 (100001-100730) 99% ->
731-1077 (102270-102616) 100% ->
1078-1210 (102965-103097) 100% ->
1211-1378 (103790-103957) 100% ->
1379-1665 (104393-104679) 100% ->
1666-1852 (104894-105080) 100% ->
1853-2028 (105193-105368) 100% ->
2029-2204 (106341-106516) 100% ->
2205-2901 (106677-107373) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGCAGCGAGCTGTGCCCGAGGGGTTCGGAAGGCGCAAGCTGGGCAGCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGCAGCGAGCTGTGCCCGAGGGGTTCGGAAGGCGCAAGCTGGGCAGCGA
50 . : . : . : . : . :
51 CATGGGGAACGCGGAGCGGGCTCCGGGGTCTCGGAGCTTTGGGCCCGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
100051 CATGGGGAACGCGGAGCGGGCTCCGGGGTCTCGGAGCTTTGGGCCAGTAC
100 . : . : . : . : . :
101 CCACGCTGCTGCTGCTCGCCGCGGCGCTACTGGCCGTGTCGGACGCACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCACGCTGCTGCTGCTCGCCGCGGCGCTACTGGCCGTGTCGGACGCACTC
150 . : . : . : . : . :
151 GGGCGCCCCTCCGAGGAGGACGAGGAGCTAGTGGTGCCGGAGCTGGAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGGCGCCCCTCCGAGGAGGACGAGGAGCTAGTGGTGCCGGAGCTGGAGCG
200 . : . : . : . : . :
201 CGCCCCGGGACACGGGACCACGCGCCTCCGCCTGCACGCCTTTGACCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CGCCCCGGGACACGGGACCACGCGCCTCCGCCTGCACGCCTTTGACCAGC
250 . : . : . : . : . :
251 AGCTGGATCTGGAGCTGCGGCCCGACAGCAGCTTTTTGGCGCCCGGCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AGCTGGATCTGGAGCTGCGGCCCGACAGCAGCTTTTTGGCGCCCGGCTTC
300 . : . : . : . : . :
301 ACGCTCCAGAACGTGGGGCGCAAATCCGGGTCCGAGACGCCGCTTCCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 ACGCTCCAGAACGTGGGGCGCAAATCCGGGTCCGAGACGCCGCTTCCGGA
350 . : . : . : . : . :
351 AACCGACCTGGCGCACTGCTTCTACTCCGGCACCGTGAATGGCGATCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 AACCGACCTGGCGCACTGCTTCTACTCCGGCACCGTGAATGGCGATCCCA
400 . : . : . : . : . :
401 GCTCGGCTGCCGCCCTCAGCCTCTGCGAGGGCGTGCGCGGCGCCTTCTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 GCTCGGCTGCCGCCCTCAGCCTCTGCGAGGGCGTGCGCGGCGCCTTCTAC
450 . : . : . : . : . :
451 CTGCTGGGGGAGGCGTATTTCATCCAGCCGCTGCCCGCCGCCAGCGAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 CTGCTGGGGGAGGCGTATTTCATCCAGCCGCTGCCCGCCGCCAGCGAGCG
500 . : . : . : . : . :
501 CCTCGCCACCGCCGCCCCAGGGGAGAAGCCGCCGGCACCACTACAGTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 CCTCGCCACCGCCGCCCCAGGGGAGAAGCCGCCGGCACCACTACAGTTCC
550 . : . : . : . : . :
551 ACCTCCTGCGGCGGAATCGGCAGGGCGACGTAGGCGGCACGTGCGGGGTG
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
100551 ACCTCCTGCGGCGGAATCGGCAGGGCGACGTCGGCGGCACGTGCGGGGTC
600 . : . : . : . : . :
601 GTGGACGACGAGCCCCGGCCGACTGGGAAAGCGGAGACCGAAGACGAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 GTGGACGACGAGCCCCGGCCGACTGGGAAAGCGGAGACCGAAGACGAGGA
650 . : . : . : . : . :
651 CGAAGGGACTGAGGGCGAGGACGAAGGGCCTCAGTGGTCGCCGCAGGACC
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
100651 CGAAGGGACTGAGGGCGAGGACGAAGGGGCTCAGTGGTCGCCGCAGGACC
700 . : . : . : . : . :
701 CGGCACTGCAAGGCGTAGGACAGCCCACAG GAACTGGAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
100701 CGGCACTGCAAGGCGTAGGACAGCCCACAGGTA...CAGGAACTGGAAGC
750 . : . : . : . : . :
742 ATAAGAAAGAAGCGATTTGTGTCCAGTCACCGCTATGTGGAAACCATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102281 ATAAGAAAGAAGCGATTTGTGTCCAGTCACCGCTATGTGGAAACCATGCT
800 . : . : . : . : . :
792 TGTGGCAGACCAGTCGATGGCAGAATTCCACGGCAGTGGTCTAAAGCATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102331 TGTGGCAGACCAGTCGATGGCAGAATTCCACGGCAGTGGTCTAAAGCATT
850 . : . : . : . : . :
842 ACCTTCTCACGTTGTTTTCGGTGGCAGCCAGATTGTACAAACACCCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102381 ACCTTCTCACGTTGTTTTCGGTGGCAGCCAGATTGTACAAACACCCCAGC
900 . : . : . : . : . :
892 ATTCGTAATTCAGTTAGCCTGGTGGTGGTGAAGATCTTGGTCATCCACGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102431 ATTCGTAATTCAGTTAGCCTGGTGGTGGTGAAGATCTTGGTCATCCACGA
950 . : . : . : . : . :
942 TGAACAGAAGGGGCCGGAAGTGACCTCCAATGCTGCCCTCACTCTGCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102481 TGAACAGAAGGGGCCGGAAGTGACCTCCAATGCTGCCCTCACTCTGCGGA
1000 . : . : . : . : . :
992 ACTTTTGCAACTGGCAGAAGCAGCACAACCCACCCAGTGACCGGGATGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102531 ACTTTTGCAACTGGCAGAAGCAGCACAACCCACCCAGTGACCGGGATGCA
1050 . : . : . : . : . :
1042 GAGCACTATGACACAGCAATTCTTTTCACCAGACAG GACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
102581 GAGCACTATGACACAGCAATTCTTTTCACCAGACAGGTA...TAGGACTT
1100 . : . : . : . : . :
1083 GTGTGGGTCCCAGACATGTGATACTCTTGGGATGGCTGATGTTGGAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102970 GTGTGGGTCCCAGACATGTGATACTCTTGGGATGGCTGATGTTGGAACTG
1150 . : . : . : . : . :
1133 TGTGTGATCCGAGCAGAAGCTGCTCCGTCATAGAAGATGATGGTTTACAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103020 TGTGTGATCCGAGCAGAAGCTGCTCCGTCATAGAAGATGATGGTTTACAA
1200 . : . : . : . : . :
1183 GCTGCCTTCACCACAGCCCATGAATTAG GCCACGTGTTTAA
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
103070 GCTGCCTTCACCACAGCCCATGAATTAGGTA...TAGGCCACGTGTTTAA
1250 . : . : . : . : . :
1224 CATGCCACATGATGATGCAAAGCAGTGTGCCAGCCTTAATGGTGTGAACC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103803 CATGCCACATGATGATGCAAAGCAGTGTGCCAGCCTTAATGGTGTGAACC
1300 . : . : . : . : . :
1274 AGGATTCCCACATGATGGCGTCAATGCTTTCCAACCTGGACCACAGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103853 AGGATTCCCACATGATGGCGTCAATGCTTTCCAACCTGGACCACAGCCAG
1350 . : . : . : . : . :
1324 CCTTGGTCTCCTTGCAGTGCCTACATGATTACATCATTTCTGGATAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103903 CCTTGGTCTCCTTGCAGTGCCTACATGATTACATCATTTCTGGATAATGG
1400 . : . : . : . : . :
1374 TCATG GGGAATGTTTGATGGACAAGCCTCAGAATCCCATAC
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103953 TCATGGTG...CAGGGGAATGTTTGATGGACAAGCCTCAGAATCCCATAC
1450 . : . : . : . : . :
1415 AGCTCCCAGGCGATCTCCCTGGCACCTCGTACGATGCCAACCGGCAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104429 AGCTCCCAGGCGATCTCCCTGGCACCTCGTACGATGCCAACCGGCAGTGC
1500 . : . : . : . : . :
1465 CAGTTTACATTTGGGGAGGACTCCAAACACTGCCCCGATGCAGCCAGCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104479 CAGTTTACATTTGGGGAGGACTCCAAACACTGCCCCGATGCAGCCAGCAC
1550 . : . : . : . : . :
1515 ATGTAGCACCTTGTGGTGTACCGGCACCTCTGGTGGGGTGCTGGTGTGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104529 ATGTAGCACCTTGTGGTGTACCGGCACCTCTGGTGGGGTGCTGGTGTGTC
1600 . : . : . : . : . :
1565 AAACCAAACACTTCCCGTGGGCGGATGGCACCAGCTGTGGAGAAGGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104579 AAACCAAACACTTCCCGTGGGCGGATGGCACCAGCTGTGGAGAAGGGAAA
1650 . : . : . : . : . :
1615 TGGTGTATCAACGGCAAGTGTGTGAACAAAACCGACAGAAAGCATTTTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104629 TGGTGTATCAACGGCAAGTGTGTGAACAAAACCGACAGAAAGCATTTTGA
1700 . : . : . : . : . :
1665 T ACGCCTTTTCATGGAAGCTGGGGAATGTGGGGGCCTTGGG
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104679 TGTG...TAGACGCCTTTTCATGGAAGCTGGGGAATGTGGGGGCCTTGGG
1750 . : . : . : . : . :
1706 GAGACTGTTCGAGAACGTGCGGTGGAGGAGTCCAGTACACGATGAGGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104934 GAGACTGTTCGAGAACGTGCGGTGGAGGAGTCCAGTACACGATGAGGGAA
1800 . : . : . : . : . :
1756 TGTGACAACCCAGTCCCAAAGAATGGAGGGAAGTACTGTGAAGGCAAACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
104984 TGTGACAACCCAGTCCCAAAGAATGGAGGGAAGTACTGTGAAGGCAAACG
1850 . : . : . : . : . :
1806 AGTGCGCTACAGATCCTGTAACCTTGAGGACTGTCCAGACAATAATG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
105034 AGTGCGCTACAGATCCTGTAACCTTGAGGACTGTCCAGACAATAATGGTG
1900 . : . : . : . : . :
1853 GAAAAACCTTTAGAGAGGAACAATGTGAAGCACACAACGAGTTT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105084 ...CAGGAAAAACCTTTAGAGAGGAACAATGTGAAGCACACAACGAGTTT
1950 . : . : . : . : . :
1897 TCAAAAGCTTCCTTTGGGAGTGGGCCTGCGGTGGAATGGATTCCCAAGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105237 TCAAAAGCTTCCTTTGGGAGTGGGCCTGCGGTGGAATGGATTCCCAAGTA
2000 . : . : . : . : . :
1947 CGCTGGCGTCTCACCAAAGGACAGGTGCAAGCTCATCTGCCAAGCCAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105287 CGCTGGCGTCTCACCAAAGGACAGGTGCAAGCTCATCTGCCAAGCCAAAG
2050 . : . : . : . : . :
1997 GCATTGGCTACTTCTTCGTTTTGCAGCCCAAG GTTGTAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
105337 GCATTGGCTACTTCTTCGTTTTGCAGCCCAAGGTA...CAGGTTGTAGAT
2100 . : . : . : . : . :
2038 GGTACTCCATGTAGCCCAGATTCCACCTCTGTCTGTGTGCAAGGACAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106350 GGTACTCCATGTAGCCCAGATTCCACCTCTGTCTGTGTGCAAGGACAGTG
2150 . : . : . : . : . :
2088 TGTAAAAGCTGGTTGTGATCGCATCATAGACTCCAAAAAGAAGTTTGATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106400 TGTAAAAGCTGGTTGTGATCGCATCATAGACTCCAAAAAGAAGTTTGATA
2200 . : . : . : . : . :
2138 AATGTGGTGTTTGCGGGGGAAATGGATCTACTTGTAAAAAAATATCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106450 AATGTGGTGTTTGCGGGGGAAATGGATCTACTTGTAAAAAAATATCAGGA
2250 . : . : . : . : . :
2188 TCAGTTACTAGTGCAAA ACCTGGATATCATGATATCATCAC
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
106500 TCAGTTACTAGTGCAAAGTA...CAGACCTGGATATCATGATATCATCAC
2300 . : . : . : . : . :
2229 AATTCCAACTGGAGCCACCAACATCGAAGTGAAACAGCGGAACCAGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106701 AATTCCAACTGGAGCCACCAACATCGAAGTGAAACAGCGGAACCAGAGGG
2350 . : . : . : . : . :
2279 GATCCAGGAACAATGGCAGCTTTCTTGCCATCAAAGCTGCTGATGGCACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106751 GATCCAGGAACAATGGCAGCTTTCTTGCCATCAAAGCTGCTGATGGCACA
2400 . : . : . : . : . :
2329 TATATTCTTAATGGTGACTACACTTTGTCCACCTTAGAGCAAGACATTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106801 TATATTCTTAATGGTGACTACACTTTGTCCACCTTAGAGCAAGACATTAT
2450 . : . : . : . : . :
2379 GTACAAAGGTGTTGTCTTGAGGTACAGCGGCTCCTCTGCGGCATTGGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106851 GTACAAAGGTGTTGTCTTGAGGTACAGCGGCTCCTCTGCGGCATTGGAAA
2500 . : . : . : . : . :
2429 GAATTCGCAGCTTTAGCCCTCTCAAAGAGCCCTTGACCATCCAGGTTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106901 GAATTCGCAGCTTTAGCCCTCTCAAAGAGCCCTTGACCATCCAGGTTCTT
2550 . : . : . : . : . :
2479 ACTGTGGGCAATGCCCTTCGACCTAAAATTAAATACACCTACTTCGTAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106951 ACTGTGGGCAATGCCCTTCGACCTAAAATTAAATACACCTACTTCGTAAA
2600 . : . : . : . : . :
2529 GAAGAAGAAGGAATCTTTCAATGCTATCCCCACTTTTTCAGCATGGGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107001 GAAGAAGAAGGAATCTTTCAATGCTATCCCCACTTTTTCAGCATGGGTCA
2650 . : . : . : . : . :
2579 TTGAAGAGTGGGGCGAATGTTCTAAGTCATGTGAATTGGGTTGGCAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107051 TTGAAGAGTGGGGCGAATGTTCTAAGTCATGTGAATTGGGTTGGCAGAGA
2700 . : . : . : . : . :
2629 AGACTGGTAGAATGCCGAGACATTAATGGACAGCCTGCTTCCGAGTGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107101 AGACTGGTAGAATGCCGAGACATTAATGGACAGCCTGCTTCCGAGTGTGC
2750 . : . : . : . : . :
2679 AAAGGAAGTGAAGCCAGCCAGCACCAGACCTTGTGCAGACCATCCCTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107151 AAAGGAAGTGAAGCCAGCCAGCACCAGACCTTGTGCAGACCATCCCTGCC
2800 . : . : . : . : . :
2729 CCCAGTGGCAGCTGGGGGAGTGGTCATCATGTTCTAAGACCTGTGGGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107201 CCCAGTGGCAGCTGGGGGAGTGGTCATCATGTTCTAAGACCTGTGGGAAG
2850 . : . : . : . : . :
2779 GGTTACAAAAAAAGAAGCTTGAAGTGTCTGTCCCATGATGGAGGGGTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107251 GGTTACAAAAAAAGAAGCTTGAAGTGTCTGTCCCATGATGGAGGGGTGTT
2900 . : . : . : . : . :
2829 ATCTCATGAGAGCTGTGATCCTTTAAAGAAACCTAAACATTTCATAGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107301 ATCTCATGAGAGCTGTGATCCTTTAAAGAAACCTAAACATTTCATAGACT
2950 . : . :
2879 TTTGCACAATGGCAGAATGCAGT
|||||||||||||||||||||||
107351 TTTGCACAATGGCAGAATGCAGT