seq1 = pF1KA1198.tfa, 1587 bp
seq2 = pF1KA1198/gi568815579r_12480488.tfa (gi568815579r:12480488_12710680), 230193 bp

>pF1KA1198 1587
>gi568815579r:12480488_12710680 (Chr19)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-162  (101479-101523)   100% ->
163-289  (127125-127251)   100% ->
290-350  (127771-127831)   100% ->
351-1587  (128957-130193)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCAGGAATTCCAGTCTCAGTTTCCAGATGGAGCGACCCCTCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCAGGAATTCCAGTCTCAGTTTCCAGATGGAGCGACCCCTCGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAAGTCCAGAGCAAGTGGTCGTCTAGTCAAGGCCGCACAGGAACAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAAGTCCAGAGCAAGTGGTCGTCTAGTCAAGGCCGCACAGGAACAGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTCTGATGTCCTCCAG         ATGCAGAACAGTGAACACCATGGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTCTGATGTCCTCCAGGTA...TAGATGCAGAACAGTGAACACCATGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAAAGCATCAAGACTCAAACT         GACTCCATCTCCCTTGAGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101503 CAAAGCATCAAGACTCAAACTGTA...TAGGACTCCATCTCCCTTGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTGGCTGTGAACTTCACCCTGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127145 TGTGGCTGTGAACTTCACCCTGGAGGAGTGGGCTTTGCTGGATCCTGGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAGGAATATCTACAGAGATGTGATGCGGGCAACCTTCAAGAACCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127195 AGAGGAATATCTACAGAGATGTGATGCGGGCAACCTTCAAGAACCTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TGTATAG         GGGAAAAATGGAAAGACCAGGATATTGAAGATGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127245 TGTATAGGTA...TAGGGGAAAAATGGAAAGACCAGGATATTGAAGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACACAAAAACCAGGGAAGAAATCTAAG         AAGTCCTATGGTTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 127805 ACACAAAAACCAGGGAAGAAATCTAAGGTG...CAGAAGTCCTATGGTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAGCACTCTGTGAAAATAAAGAAGATTGTCCATGTGGAAAAAGCACTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128971 AAGCACTCTGTGAAAATAAAGAAGATTGTCCATGTGGAAAAAGCACTAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CAGATTCCTGATCTTAATACGAACCTGGAAACTCCTACTGGATTAAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129021 CAGATTCCTGATCTTAATACGAACCTGGAAACTCCTACTGGATTAAAACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ATGTGACTGCAGTGTGTGTGGGGAAGTCTTCATGCATCAGGTCTCCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129071 ATGTGACTGCAGTGTGTGTGGGGAAGTCTTCATGCATCAGGTCTCCCTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATAGGCACATGAGATCTCACACTGAACAGAAACCAAATGAGTGTCACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129121 ATAGGCACATGAGATCTCACACTGAACAGAAACCAAATGAGTGTCACGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATGGAGAGAAGCCACATAAATGCAAAGAATGTGGGAAAACCTTCACTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129171 TATGGAGAGAAGCCACATAAATGCAAAGAATGTGGGAAAACCTTCACTCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAGCTCCAGTATTCGAACCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129221 CAGCTCCAGTATTCGAACCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGAATGTAAGGAATGTGGCAAAGCCTTCGCATTTCTCTTTTCCTTTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129271 ATGAATGTAAGGAATGTGGCAAAGCCTTCGCATTTCTCTTTTCCTTTCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AACCATATAAGAATTCATACTGGAGAGACACCCTATGAATGTAAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129321 AACCATATAAGAATTCATACTGGAGAGACACCCTATGAATGTAAGGAATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TGGGAAGGCATTCAGATATCTCACTGCTCTTCGGCGCCATGAAAAAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129371 TGGGAAGGCATTCAGATATCTCACTGCTCTTCGGCGCCATGAAAAAAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAAACAGTGTGGAAAAGCCTTTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129421 ACACTGGAGAGAAACCCTACAAATGTAAACAGTGTGGAAAAGCCTTTATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TATTACCAGCCTTTTCTAACCCACGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129471 TATTACCAGCCTTTTCTAACCCACGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAACC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TTATGAATGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGTTGTCCCACGTACTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129521 TTATGAATGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGTTGTCCCACGTACTTAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GGAGTCATGAGAAAACTCATACTGGAGAGAAACCTTTTGTATGTAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129571 GGAGTCATGAGAAAACTCATACTGGAGAGAAACCTTTTGTATGTAGGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TGTGGGAGAGCCTTCTTTTCTCACTCAAGCCTTCGAAAACACGTGAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129621 TGTGGGAGAGCCTTCTTTTCTCACTCAAGCCTTCGAAAACACGTGAAAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CCACACCGGAGTTCAACCTTATACATGTAAGAAATGTGGGGAAGCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129671 CCACACCGGAGTTCAACCTTATACATGTAAGAAATGTGGGGAAGCCTTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AGTCATCTAGTTCCTGTGAAGTGCACGAAAGAACTCATTTTGGAGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129721 AGTCATCTAGTTCCTGTGAAGTGCACGAAAGAACTCATTTTGGAGAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CCCTATGAATGTAAACAATGTGGTAAAGCCTTCAATTCTTCAAGTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129771 CCCTATGAATGTAAACAATGTGGTAAAGCCTTCAATTCTTCAAGTTACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TCAGTTGCACGAAAGAGTTCACACTGGCGAGAAAACTTACGAATGTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129821 TCAGTTGCACGAAAGAGTTCACACTGGCGAGAAAACTTACGAATGTAAAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 AATGTGGTAAAGCCTTTCTTTATTCCACTCACTTTCGAATCCATGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129871 AATGTGGTAAAGCCTTTCTTTATTCCACTCACTTTCGAATCCATGAAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ACCCATACTAGAGAGAAACCCTATGAATGCAAACAGTGTGGTCGGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129921 ACCCATACTAGAGAGAAACCCTATGAATGCAAACAGTGTGGTCGGGTCTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CATTTACTTCAGTCACCTTCGAAGGCACGAAAGAAGTCACACTGGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129971 CATTTACTTCAGTCACCTTCGAAGGCACGAAAGAAGTCACACTGGAGTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1415 AACCATGTGAGTGTAAGCAGTGTGGCAAAGCTTTCACTTGTTTAAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130021 AACCATGTGAGTGTAAGCAGTGTGGCAAAGCTTTCACTTGTTTAAATTCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1465 CTGAAAGTACACAAAAGAATTCATACTGGAGAAAGACCCTTTCAGTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130071 CTGAAAGTACACAAAAGAATTCATACTGGAGAAAGACCCTTTCAGTGTAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1515 ACAATGTGGTAAAGCCTTCAGTTACTCAAAGTCTTTGCACGTGCACGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130121 ACAATGTGGTAAAGCCTTCAGTTACTCAAAGTCTTTGCACGTGCACGAAA

   1600     .    :    .    :
   1565 GGACTCATAGTAGACAGAAGCCC
        |||||||||||||||||||||||
 130171 GGACTCATAGTAGACAGAAGCCC