Result of SIM4 for
pF1KA1071
seq1 = pF1KA1071.tfa, 3252 bp
seq2 = pF1KA1071/gi568815575r_112678570.tfa (gi568815575r:112678570_112923126), 244557 bp
>pF1KA1071 3252
>gi568815575r:112678570_112923126 (ChrX)
(complement)
1-872 (100001-100872) 100% ->
873-1392 (107250-107769) 100% ->
1393-1537 (111734-111878) 100% ->
1538-1630 (113141-113233) 100% ->
1631-1776 (118035-118180) 100% ->
1777-1926 (131146-131295) 100% ->
1927-2117 (132345-132535) 100% ->
2118-2240 (140465-140587) 100% ->
2241-2473 (142009-142241) 100% ->
2474-3157 (143447-144130) 100% ->
3158-3252 (144463-144557) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAGAAATTCTGAAGAACAGCCAAGTGGAGGGACCACGGTATTGCAGCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAGAAATTCTGAAGAACAGCCAAGTGGAGGGACCACGGTATTGCAGCG
50 . : . : . : . : . :
51 TTTGCTACAAGAGCAGCTTCGCTATGGCAATCCTAGTGAGAATCGCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TTTGCTACAAGAGCAGCTTCGCTATGGCAATCCTAGTGAGAATCGCAGCC
100 . : . : . : . : . :
101 TGCTTGCCATACACCAGCAAGCCACAGGGAATGGCCCTCCTTTCCCCAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TGCTTGCCATACACCAGCAAGCCACAGGGAATGGCCCTCCTTTCCCCAGT
150 . : . : . : . : . :
151 GGCAGTGGGAACCCGGGCCCTCAGAGTGATGTGTTGAGTCCCCAAGACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGCAGTGGGAACCCGGGCCCTCAGAGTGATGTGTTGAGTCCCCAAGACCA
200 . : . : . : . : . :
201 CCACCAACAGCTTGTGGCTCATGCTGCTCGACAAGAACCCCAGGGGCAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 CCACCAACAGCTTGTGGCTCATGCTGCTCGACAAGAACCCCAGGGGCAGG
250 . : . : . : . : . :
251 AAATCCAGTCAGAAAACCTCATCATGGAGAAGCAGCTGTCTCCTCGAATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 AAATCCAGTCAGAAAACCTCATCATGGAGAAGCAGCTGTCTCCTCGAATG
300 . : . : . : . : . :
301 CAAAATAATGAAGAACTCCCGACCTATGAAGAAGCCAAGGTCCAGTCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100301 CAAAATAATGAAGAACTCCCGACCTATGAAGAAGCCAAGGTCCAGTCCCA
350 . : . : . : . : . :
351 GTACTTTCGGGGCCAACAGCATGCCAGTGTTGGAGCTGCCTTCTATGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100351 GTACTTTCGGGGCCAACAGCATGCCAGTGTTGGAGCTGCCTTCTATGTCA
400 . : . : . : . : . :
401 CTGGAGTCACCAACCAGAAGATGAGGACTGAGGGACGCCCATCAGTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100401 CTGGAGTCACCAACCAGAAGATGAGGACTGAGGGACGCCCATCAGTTCAG
450 . : . : . : . : . :
451 CGGCTCAATCCTGGAAAGATGCACCAAGATGAGGGACTCAGAGACCTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100451 CGGCTCAATCCTGGAAAGATGCACCAAGATGAGGGACTCAGAGACCTTAA
500 . : . : . : . : . :
501 GCAAGGGCATGTCCGTTCCTTGAGTGAACGACTAATGCAGATGTCACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100501 GCAAGGGCATGTCCGTTCCTTGAGTGAACGACTAATGCAGATGTCACTGG
550 . : . : . : . : . :
551 CCACCAGTGGAGTTAAGGCCCATCCACCTGTTACCAGTGCTCCCCTCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100551 CCACCAGTGGAGTTAAGGCCCATCCACCTGTTACCAGTGCTCCCCTCTCC
600 . : . : . : . : . :
601 CCACCACAACCCAATGACCTCTACAAGAATCCCACAAGTTCCAGTGAATT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100601 CCACCACAACCCAATGACCTCTACAAGAATCCCACAAGTTCCAGTGAATT
650 . : . : . : . : . :
651 CTACAAGGCCCAAGGGCCACTTCCTAACCAGCATAGCCTGAAGGGCATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100651 CTACAAGGCCCAAGGGCCACTTCCTAACCAGCATAGCCTGAAGGGCATGG
700 . : . : . : . : . :
701 AACACCGAGGCCCCCCACCAGAATATCCCTTCAAGGGCATGCCACCCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100701 AACACCGAGGCCCCCCACCAGAATATCCCTTCAAGGGCATGCCACCCCAA
750 . : . : . : . : . :
751 TCTGTAGTGTGCAAGCCCCAAGAGCCAGGGCACTTCTATAGTGAGCATCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100751 TCTGTAGTGTGCAAGCCCCAAGAGCCAGGGCACTTCTATAGTGAGCATCG
800 . : . : . : . : . :
801 CCTGAACCAGCCAGGGAGAACAGAGGGGCAACTGATGAGGTATCAGCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100801 CCTGAACCAGCCAGGGAGAACAGAGGGGCAACTGATGAGGTATCAGCATC
850 . : . : . : . : . :
851 CCCCTGAGTATGGAGCAGCCAG GCCAGCGCAGGACATCTCA
||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
100851 CCCCTGAGTATGGAGCAGCCAGGTA...CAGGCCAGCGCAGGACATCTCA
900 . : . : . : . : . :
892 TTGCCATTGTCAGCCAGGAACTCGCAGCCTCACAGCCCTACTTCTTCTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107269 TTGCCATTGTCAGCCAGGAACTCGCAGCCTCACAGCCCTACTTCTTCTCT
950 . : . : . : . : . :
942 GACCTCTGGGGGGTCCTTGCCCTTGCTACAATCTCCACCATCCACTAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107319 GACCTCTGGGGGGTCCTTGCCCTTGCTACAATCTCCACCATCCACTAGAT
1000 . : . : . : . : . :
992 TGTCTCCTGCCCGACACCCCTTGGTCCCAAACCAGGGAGACCATTCAGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107369 TGTCTCCTGCCCGACACCCCTTGGTCCCAAACCAGGGAGACCATTCAGCT
1050 . : . : . : . : . :
1042 CACCTGCCTAGGCCGCAGCAGCATTTCCTTCCTAATCAGGCTCACCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107419 CACCTGCCTAGGCCGCAGCAGCATTTCCTTCCTAATCAGGCTCACCAGGG
1100 . : . : . : . : . :
1092 GGATCATTACCGTCTCTCCCAACCTGGCCTGAGTCAGCAGCAGCAGCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107469 GGATCATTACCGTCTCTCCCAACCTGGCCTGAGTCAGCAGCAGCAGCAAC
1150 . : . : . : . : . :
1142 AGCAGCAGCAGCACCATCATCACCATCACCACCAACAACAGCAGCAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107519 AGCAGCAGCAGCACCATCATCACCATCACCACCAACAACAGCAGCAGCAG
1200 . : . : . : . : . :
1192 CAGCCACAGCAGCAGCCAGGAGAAGCCTATTCAGCTATGCCTCGGGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107569 CAGCCACAGCAGCAGCCAGGAGAAGCCTATTCAGCTATGCCTCGGGCTCA
1250 . : . : . : . : . :
1242 GCCATCCTCTGCTTCTTATCAGCCAGTGCCAGCAGACCCTTTTGCCATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107619 GCCATCCTCTGCTTCTTATCAGCCAGTGCCAGCAGACCCTTTTGCCATTG
1300 . : . : . : . : . :
1292 TTTCCAGAGCCCAGCAGATGGTTGAGATCCTCTCAGACGAGAACCGGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107669 TTTCCAGAGCCCAGCAGATGGTTGAGATCCTCTCAGACGAGAACCGGAAC
1350 . : . : . : . : . :
1342 TTGAGGCAAGAGTTGGAAGGATGCTATGAGAAGGTGGCAAGACTGCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107719 TTGAGGCAAGAGTTGGAAGGATGCTATGAGAAGGTGGCAAGACTGCAGAA
1400 . : . : . : . : . :
1392 G GTGGAGACAGAAATCCAGCGCGTCTCGGAGGCATATGAGA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107769 GGTG...AAGGTGGAGACAGAAATCCAGCGCGTCTCGGAGGCATATGAGA
1450 . : . : . : . : . :
1433 ACCTCGTGAAGTCATCCTCCAAAAGAGAGGCCCTAGAGAAAGCCATGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111774 ACCTCGTGAAGTCATCCTCCAAAAGAGAGGCCCTAGAGAAAGCCATGAGA
1500 . : . : . : . : . :
1483 AACAAGCTAGAGGGCGAGATTCGGAGGATGCATGATTTCAACAGGGATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111824 AACAAGCTAGAGGGCGAGATTCGGAGGATGCATGATTTCAACAGGGATCT
1550 . : . : . : . : . :
1533 GAGAG AGCGTCTAGAGACTGCCAACAAGCAGCTTGCAGAGA
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
111874 GAGAGGTG...CAGAGCGTCTAGAGACTGCCAACAAGCAGCTTGCAGAGA
1600 . : . : . : . : . :
1574 AGGAATATGAGGGGTCAGAGGACACCAGAAAAACCATCTCGCAGCTCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
113177 AGGAATATGAGGGGTCAGAGGACACCAGAAAAACCATCTCGCAGCTCTTT
1650 . : . : . : . : . :
1624 GCAAAAA ATAAAGAAAGCCAGCGTGAGAAGGAGAAGCTGGA
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
113227 GCAAAAAGTA...CAGATAAAGAAAGCCAGCGTGAGAAGGAGAAGCTGGA
1700 . : . : . : . : . :
1665 AGCGGAGCTGGCCACTGCCCGTTCTACCAATGAGGACCAAAGACGACACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118069 AGCGGAGCTGGCCACTGCCCGTTCTACCAATGAGGACCAAAGACGACACA
1750 . : . : . : . : . :
1715 TCGAAATCCGAGATCAGGCCCTGAGTAATGCCCAGGCCAAGGTGGTAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
118119 TCGAAATCCGAGATCAGGCCCTGAGTAATGCCCAGGCCAAGGTGGTAAAG
1800 . : . : . : . : . :
1765 CTGGAAGAAGAG CTGAAAAAGAAGCAAGTGTACGTTGACAA
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
118169 CTGGAAGAAGAGGTA...CAGCTGAAAAAGAAGCAAGTGTACGTTGACAA
1850 . : . : . : . : . :
1806 GGTGGAGAAGATGCAGCAGGCCCTTGTACAGCTCCAGGCAGCATGTGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131175 GGTGGAGAAGATGCAGCAGGCCCTTGTACAGCTCCAGGCAGCATGTGAAA
1900 . : . : . : . : . :
1856 AACGTGAGCAGCTAGAGCACCGTCTCCGGACACGACTGGAGAGGGAACTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131225 AACGTGAGCAGCTAGAGCACCGTCTCCGGACACGACTGGAGAGGGAACTG
1950 . : . : . : . : . :
1906 GAATCCCTGAGAATCCAGCAG CGTCAGGGCAACTGTCAGCC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
131275 GAATCCCTGAGAATCCAGCAGGTA...CAGCGTCAGGGCAACTGTCAGCC
2000 . : . : . : . : . :
1947 CACCAACGTTTCAGAATACAATGCTGCTGCACTGATGGAGCTCCTTCGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132365 CACCAACGTTTCAGAATACAATGCTGCTGCACTGATGGAGCTCCTTCGGG
2050 . : . : . : . : . :
1997 AGAAAGAGGAGAGGATTCTGGCTCTGGAAGCTGATATGACAAAGTGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132415 AGAAAGAGGAGAGGATTCTGGCTCTGGAAGCTGATATGACAAAGTGGGAG
2100 . : . : . : . : . :
2047 CAGAAATATTTGGAGGAGAATGTGATGAGACATTTTGCTCTGGATGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132465 CAGAAATATTTGGAGGAGAATGTGATGAGACATTTTGCTCTGGATGCTGC
2150 . : . : . : . : . :
2097 TGCAACTGTGGCTGCTCAGAG GGACACAACAGTCATCAGTC
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
132515 TGCAACTGTGGCTGCTCAGAGGTA...CAGGGACACAACAGTCATCAGTC
2200 . : . : . : . : . :
2138 ACTCTCCTAACACCAGCTATGACACAGCTCTAGAAGCTCGCATCCAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140485 ACTCTCCTAACACCAGCTATGACACAGCTCTAGAAGCTCGCATCCAGAAA
2250 . : . : . : . : . :
2188 GAGGAGGAAGAAATCTTGATGGCCAATAAGCGTTGCCTTGACATGGAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140535 GAGGAGGAAGAAATCTTGATGGCCAATAAGCGTTGCCTTGACATGGAGGG
2300 . : . : . : . : . :
2238 CAG GATTAAGACCCTCCATGCCCAGATTATTGAGAAGGATG
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140585 CAGGTA...TAGGATTAAGACCCTCCATGCCCAGATTATTGAGAAGGATG
2350 . : . : . : . : . :
2279 CCATGATCAAAGTACTCCAGCAGCGTTCCCGGAAGGAGCCGAGCAAGACA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142047 CCATGATCAAAGTACTCCAGCAGCGTTCCCGGAAGGAGCCGAGCAAGACA
2400 . : . : . : . : . :
2329 GAGCAGCTGTCGTGCATGCGGCCAGCGAAGTCTCTGATGTCCATTTCCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142097 GAGCAGCTGTCGTGCATGCGGCCAGCGAAGTCTCTGATGTCCATTTCCAA
2450 . : . : . : . : . :
2379 TGCTGGATCAGGCTTGCTCTCCCACTCATCCACCCTGACTGGCTCCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142147 TGCTGGATCAGGCTTGCTCTCCCACTCATCCACCCTGACTGGCTCCCCCA
2500 . : . : . : . : . :
2429 TCATGGAAGAAAAGCGAGACGACAAGAGCTGGAAGGGGAGCCTAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
142197 TCATGGAAGAAAAGCGAGACGACAAGAGCTGGAAGGGGAGCCTAGGTA..
2550 . : . : . : . : . :
2474 GCATTCTCCTGGGTGGAGACTACCGTGCTGAATATGTCCCTTCCAC
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
142247 .TAGGCATTCTCCTGGGTGGAGACTACCGTGCTGAATATGTCCCTTCCAC
2600 . : . : . : . : . :
2520 ACCCTCGCCTGTGCCACCCTCGACTCCCCTGCTCTCGGCTCACTCCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143493 ACCCTCGCCTGTGCCACCCTCGACTCCCCTGCTCTCGGCTCACTCCAAGA
2650 . : . : . : . : . :
2570 CAGGCAGCCGAGACTGCAGTACCCAAACTGAACGTGGGACGGAATCGAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143543 CAGGCAGCCGAGACTGCAGTACCCAAACTGAACGTGGGACGGAATCGAAC
2700 . : . : . : . : . :
2620 AAAACTGCAGCTGTTGCTCCCATCTCTGTTCCTGCTCCAGTTGCTGCTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143593 AAAACTGCAGCTGTTGCTCCCATCTCTGTTCCTGCTCCAGTTGCTGCTGC
2750 . : . : . : . : . :
2670 CGCCACTGCTGCCGCCATCACTGCCACTGCTGCCACCATCACCACCACCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143643 CGCCACTGCTGCCGCCATCACTGCCACTGCTGCCACCATCACCACCACCA
2800 . : . : . : . : . :
2720 TGGTAGCTGCTGCTCCAGTTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTCCAGCTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143693 TGGTAGCTGCTGCTCCAGTTGCTGTTGCTGCTGCTGCTGCTCCAGCTGCT
2850 . : . : . : . : . :
2770 GCTGCTGCCCCGTCTCCAGCCACTGCCGCTGCTACTGCTGCTGCTGTTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143743 GCTGCTGCCCCGTCTCCAGCCACTGCCGCTGCTACTGCTGCTGCTGTTTC
2900 . : . : . : . : . :
2820 TCCAGCTGCTGCTGGTCAGATTCCAGCTGCTGCCTCTGTTGCCTCAGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143793 TCCAGCTGCTGCTGGTCAGATTCCAGCTGCTGCCTCTGTTGCCTCAGCTG
2950 . : . : . : . : . :
2870 CTGCCGTTGCTCCTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTCAGGTTGCTCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143843 CTGCCGTTGCTCCTTCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTCAGGTTGCTCCA
3000 . : . : . : . : . :
2920 GCTGCTCCGGCTCCAGTTCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGTTCCAGCTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143893 GCTGCTCCGGCTCCAGTTCCAGCTCCGGCTCTGGTTCCGGTTCCAGCTCC
3050 . : . : . : . : . :
2970 AGCAGCGGCTCAGGCTTCTGCTCCTGCTCAGACTCAGGCACCAACTTCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143943 AGCAGCGGCTCAGGCTTCTGCTCCTGCTCAGACTCAGGCACCAACTTCAG
3100 . : . : . : . : . :
3020 CTCCGGCTGTGGCTCCAACTCCAGCTCCAACTCCAACTCCAGCTGTGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143993 CTCCGGCTGTGGCTCCAACTCCAGCTCCAACTCCAACTCCAGCTGTGGCT
3150 . : . : . : . : . :
3070 CAGGCTGAGGTTCCTGCAAGTCCAGCTACCGGTCCTGGACCACATCGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144043 CAGGCTGAGGTTCCTGCAAGTCCAGCTACCGGTCCTGGACCACATCGTTT
3200 . : . : . : . : . :
3120 GTCTATACCAAGTTTGACCTGCAATCCAGACAAAACAG ATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
144093 GTCTATACCAAGTTTGACCTGCAATCCAGACAAAACAGGTA...TAGATG
3250 . : . : . : . : . :
3161 GGCCTGTGTTCCACTCCAATACTCTGGAAAGAAAAACTCCCATTCAGATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144466 GGCCTGTGTTCCACTCCAATACTCTGGAAAGAAAAACTCCCATTCAGATC
3300 . : . : . : . :
3211 CTGGGACAAGAGCCTGATGCAGAGATGGTGGAATATCTCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144516 CTGGGACAAGAGCCTGATGCAGAGATGGTGGAATATCTCATC