seq1 = pF1KA1035.tfa, 3678 bp
seq2 = pF1KA1035/gi568815589r_85447112.tfa (gi568815589r:85447112_85792815), 345704 bp

>pF1KA1035 3678
>gi568815589r:85447112_85792815 (Chr9)

(complement)

1-32  (80283-80314)   100% ->
33-157  (100003-100127)   100% ->
158-225  (111481-111548)   100% ->
226-289  (114418-114481)   100% ->
290-436  (115234-115380)   100% ->
437-568  (120135-120266)   100% ->
569-662  (123238-123331)   100% ->
663-700  (131843-131880)   100% ->
701-909  (135173-135381)   100% ->
910-1087  (137496-137673)   100% ->
1088-1185  (146398-146495)   100% ->
1186-1302  (149873-149989)   100% ->
1303-2015  (159442-160154)   99% ->
2016-2099  (171531-171614)   100% ->
2100-2186  (173515-173601)   100% ->
2187-2335  (173685-173833)   100% ->
2336-2423  (196367-196454)   100% ->
2424-2568  (200112-200256)   100% ->
2569-2722  (203135-203288)   100% ->
2723-2903  (204338-204518)   100% ->
2904-3033  (205856-205985)   100% ->
3034-3165  (207222-207353)   100% ->
3166-3342  (213720-213896)   100% ->
3343-3503  (217341-217501)   100% ->
3504-3678  (245530-245704)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAAGTTAAAAGTGATACCAGAAAAAAG         CCTTACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  80283 ATGAGCAAGTTAAAAGTGATACCAGAAAAAAGGTA...TAGCCTTACCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TAATTCTAGGATCGTAGGACTCCTGGCTCAACTGGAGAAGATCAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100012 TAATTCTAGGATCGTAGGACTCCTGGCTCAACTGGAGAAGATCAATGCTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGCCTTCAGAATCAGACACTGCCCGATATGTTACATCAAAAATTCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100062 AGCCTTCAGAATCAGACACTGCCCGATATGTTACATCAAAAATTCTTCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGCTCAGAGTCAAG         AAAAAACAAGGAGAGAAATGACAGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100112 CTGGCTCAGAGTCAAGGTA...CAGAAAAAACAAGGAGAGAAATGACAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAAGGTTCTACAGGAATGGAAATTCTGCTGTCAACATTAGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 111506 CAAAGGTTCTACAGGAATGGAAATTCTGCTGTCAACATTAGAGGTA...C

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    226   AACACAAAAGATCTTCAAACTACACTTAATATCTTAAGCATTCTTGTT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114416 AGAACACAAAAGATCTTCAAACTACACTTAATATCTTAAGCATTCTTGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GAGCTGGTGTCAGCTG         GTGGAGGTCGAAGAGTGAGTTTCTT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 114466 GAGCTGGTGTCAGCTGGTA...TAGGTGGAGGTCGAAGAGTGAGTTTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 AGTCACCAAAGGTGGTTCACAAATATTGTTGCAGTTACTTATGAATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115259 AGTCACCAAAGGTGGTTCACAAATATTGTTGCAGTTACTTATGAATGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCAAAGAATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115309 GCAAAGAATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CTTGCAAAGATTGGACCAAAAG         ATAAAAAATTTGGAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 115359 CTTGCAAAGATTGGACCAAAAGGTA...CAGATAAAAAATTTGGAGTAAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120154 GGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 ATTTGCAGAATCATCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120204 ATTTGCAGAATCATCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TATTCTGCCAACT         CTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGAAAAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 120254 TATTCTGCCAACTGTG...CAGCTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGAAAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123266 TGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATTCCAGTCTTATAAA         GGTTGCTTTAGACACTCTTGCTGCA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 123316 ATTCCAGTCTTATAAAGTG...CAGGGTTGCTTTAGACACTCTTGCTGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TTGCTAAAATCAA         AAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 131868 TTGCTAAAATCAAGTA...AAGAAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 AGGATATGTCCAAGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135201 AGGATATGTCCAAGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAATTTTACAGAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135251 ATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAATTTTACAGAGTTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135301 AAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TGGGATGAAAATTCTGTATAATACTTCGCAA         GAATGTCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 135351 TGGGATGAAAATTCTGTATAATACTTCGCAAGTG...CAGGAATGTCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CAGTCAGGACTCTGGATCCTCTTGTCAATACCTCCAGTCTGATAATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137506 CAGTCAGGACTCTGGATCCTCTTGTCAATACCTCCAGTCTGATAATGAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 AAGTGTTTCCCAAAAAATCGACTGCCACTCCCAACAATTAAAAGTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137556 AAGTGTTTCCCAAAAAATCGACTGCCACTCCCAACAATTAAAAGTTCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TCATTTCCAGTTGCCTGTTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137606 TCATTTCCAGTTGCCTGTTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ACAGCTTACCTCCTGAAG         TGGATGACGTAGTAGATGAAAGT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 137656 ACAGCTTACCTCCTGAAGGTA...TAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146421 GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 AGATGACCTAGATCAAAATTTTAAG         AATGATGATATTGAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 146471 AGATGACCTAGATCAAAATTTTAAGGTT...CAGAATGATGATATTGAAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 CAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149889 CAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GATCTAAAAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149939 GATCTAAAAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 G         GACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAGCCTTTTGTAT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149989 GGTA...AAGGACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAGCCTTTTGTAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159482 TTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 ACATCTGGGAATTCTGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159532 ACATCTGGGAATTCTGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 ATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCTTTATGGATCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159582 ATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCTTTATGGATCTAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159632 CAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 GATCAAAATAGAACTATTTCATCAGTCCATGGTTTGAACAATGATATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 159682 GATCAAAATAGAACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCCTTCTCAAACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159732 AAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCCTTCTCAAACAGCCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1643 CAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159782 CAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1693 CTTACCTGTGCTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159832 CTTACCTGTGCTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 GTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTTTGCTGCACTGGAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159882 GTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTTTGCTGCACTGGAGTTG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 AAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159932 AAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1843 TCGGTTGAAGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 159982 TCGGTTGAAGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAGAATATTCAGAGGTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160032 TGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAGAATATTCAGAGGTGGCTT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 ATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 160082 ATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 GAAAGGCCTTATGGTGTACAAAG         GACAAAAATTGCTCAAGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 160132 GAAAGGCCTTATGGTGTACAAAGGTG...CAGGACAAAAATTGCTCAAGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2034 TATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCGTGTGGTATATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171549 TATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCGTGTGGTATATG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2084 ACTTGGATAACCCAAA         TTACACCATTCCAGAAGAGGGAGAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 171599 ACTTGGATAACCCAAAGTA...TAGTTACACCATTCCAGAAGAGGGAGAT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 ATTTTGAAATTTAACTCCAAATTTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173540 ATTTTGAAATTTAACTCCAAATTTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2175 TCAAATTAGAAA         AAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 173590 TCAAATTAGAAAGTA...CAGAAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 ACATAAACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173714 ACATAAACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2266 ATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAACATCATTAACTGTGAAAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 173764 ATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAACATCATTAACTGTGAAAAGTC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2316 CAACAGTCAGTTTAATTATG         GTATGCAACCACTCATGTATT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 173814 CAACAGTCAGTTTAATTATGGTA...AAGGTATGCAACCACTCATGTATT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2357 CGGTTCAGGAAGCATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196388 CGGTTCAGGAAGCATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2407 GACATTTGTTACTATAA         AAATCATTTCTCAAGAAGTTCAGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 196438 GACATTTGTTACTATAAGTA...CAGAAATCATTTCTCAAGAAGTTCAGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200136 TGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2498 TCAATTTTCCACATAAAGATGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 200186 TCAATTTTCCACATAAAGATGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2548 TATACGTATTCAACTTTACAG         ATGCATCTTCAAAAATTGGA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 200236 TATACGTATTCAACTTTACAGGTA...AAGATGCATCTTCAAAAATTGGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 ATCAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203155 ATCAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2639 AAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCCTTGGTGACTATAACAGCAATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203205 AAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCCTTGGTGACTATAACAGCAATGCCA

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2689 GAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCA         GAAATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 203255 GAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCAGTA...TAGGAAATCG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2730 CCCTTACGTTTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204345 CCCTTACGTTTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAA

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2780 GTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCATGAGCAATAACCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204395 GTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCATGAGCAATAACCCCACT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2830 GCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204445 GCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2880 TCCAGATGGTGTCATCAATGGAAA         TCATCGCTGTTCTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 204495 TCCAGATGGTGTCATCAATGGAAAGTA...TAGTCATCGCTGTTCTTTAA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2921 GTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCCGGATTTACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205873 GTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCCGGATTTACAT

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2971 CCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205923 CCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAA

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3021 GCGTTTACCCTTG         GTTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 205973 GCGTTTACCCTTGGTA...AAGGTTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCC

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3062 GAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207250 GAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTGTGG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3112 CATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207300 CATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATA

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3162 CAGG         ACATTGCCTAAGATACTGAGCCATATCGCCCCAGCAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207350 CAGGGTA...CAGACATTGCCTAAGATACTGAGCCATATCGCCCCAGCAT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3203 TTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213757 TTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACA

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3253 GCACGTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 213807 GCACGTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCAT

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3303 GGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAGGGAAAATACAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 213857 GGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAGGGAAAATACAAGGTA...AAGG

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3344 GTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217342 GTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGT

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3394 GTTGGTCTTTTACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217392 GTTGGTCTTTTACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3444 GCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAATTGAATCAAGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 217442 GCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAATTGAATCAAGCTGCA

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3494 AAGTAACTAG         CCCTACCACTTATGTCTTGGATGAAGATGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 217492 AAGTAACTAGGTA...CAGCCCTACCACTTATGTCTTGGATGAAGATGAA

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3535 CCTCGATTCCTTGAAGAAGTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245561 CCTCGATTCCTTGAAGAAGTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTT

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3585 AGATATTGAGTTGGCTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTCTGCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245611 AGATATTGAGTTGGCTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTCTGCTCAAG

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :
   3635 AAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATACCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 245661 AAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATACCTACCT